Cell | 李毓龙与合作者阐明胆汁淤积瘙痒分子机制,开辟肝病治疗新途径

科技   2024-10-31 21:54   北京  


瘙痒自古以来便为人们所关注,苏东坡曾感慨“忍痛易,忍痒难”,生动表达了瘙痒所带来的痛苦。现代医学已表明,组胺依赖的急性瘙痒,如过敏或蚊虫叮咬等,可通过抗组胺类药物有效缓解。然而,非组胺依赖的全身性慢性瘙痒却无法通过这种药物进行治疗,因而困扰了大量慢性瘙痒患者。


胆酸在人体中具有至关重要的生理功能,主要参与脂肪的消化吸收和胆固醇的代谢调节。胆酸通过肠肝循环不断再利用,维持着机体的代谢平衡。然而,当胆汁流动受阻,发生胆汁淤积时,胆酸无法正常代谢并在体内积累,导致约80%的胆汁淤积患者出现严重的慢性瘙痒,极大地影响其生活质量。迄今为止,导致胆汁淤积瘙痒的分子机制仍不明确,且缺乏有效的治疗药物


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由于胆汁淤积瘙痒是一直以来未被满足的临床需求,2024年10月29日,北京大学李毓龙课题组联合北京大学雷晓光课题组,及北京佑安医院陈煜课题组,在Cell在线发表了题为Structure-guided discovery of bile acid derivatives for treating liver diseases without causing itch 的开拓性研究成果,系统地揭示了人体内源“天然产物”分子胆酸诱导胆汁淤积瘙痒的分子机制,并且开发出针对多种肝胆疾病具有良好治疗效果且不存在瘙痒副作用的先导药物分子



首先,雷晓光课题组与北京佑安医院陈煜团队合作,收集到数十例有瘙痒症状或无明显瘙痒症状的胆汁淤积病人血浆样本。研究者通过分析这些病人血浆中的28种不同胆酸成分,发现在伴有瘙痒症状的胆汁淤积患者中,一种包含了特殊修饰的3位羟基磺酸化胆酸(BA-3S)含量显著高于无瘙痒症状的患者。这种修饰主要发生在肝脏中,用于增强胆酸的水溶性从而利于排出体内,是胆汁淤积病人自我调节的一种方式。本研究中的发现表明,这类磺酸化修饰的胆酸很可能也与胆汁淤积病人的瘙痒症状有着密切的联系,有望将其作为一种新的生物标志物,用于预测和监测瘙痒的发生。那么,磺酸化修饰后的胆酸是如何导致胆汁淤积病人产生瘙痒症状的呢?


接下来,研究者针对这一分子机制展开了详细的研究。早在2019年,研究人员已经发现,胆酸是表达在人类背根神经节中的G蛋白偶联受体MRGPRX4(hX4)的内源性配体,能够通过激活hX4导致瘙痒(Elife 2019, 8: e48431; PNAS 2019, 116: 10525-10530)。研究者就怀疑,是不是磺酸化后的胆酸对于hX4具有更强的亲和力,从而产生这种更为严重的瘙痒现象。为了证明这一点,研究者测试了不同修饰类型的胆酸对于hX4的激活活性,结果表明胆酸的3号位羟基(3-OH)对于激活hX4具有非常重要的作用,其被磺酸化修饰后显著提高了亲和力,被氧化后则显著降低了激活活性。接着,为了证实这种亲和力的增强能够导致瘙痒的症状,雷晓光课题组与北京大学李毓龙课题组合作,构建了hX4人源化大鼠的动物模型,用于研究瘙痒症状。研究者选择对hX4激活活性最强的DCA和DCA-3S进行验证,结果表明这两种胆酸都能够导致人源化大鼠产生瘙痒症状,并且DCA-3S能够产生更为严重的瘙痒。那么磺酸化修饰是如何增强胆酸对于hX4的亲和力的呢?


研究者尝试利用冷冻电镜技术解析DCA-3S与hX4的复合物结构,然而尽管做了大量的尝试,但都无法成功获得复合物结构,他们推测可能是DCA-3S的亲和力依然不足导致的。在2021年,Bryan课题组首次解析了hX4与外源性配体的复合物结构,他们发现hX4的配体结合口袋包含了丰富的带正电氨基酸(Nature 2021, 600: 170-175)。因此,研究者推测磺酸化胆酸活性的提高可能与磺酸基团携带了一个负电荷有关。基于此,研究者做了大胆的推测:进一步增加其携带的电荷数或许能够进一步提升亲和力。因此,他们将磺酸基团换成了携带两个负电荷的磷酸基团,人工合成了3位磷酸化修饰胆酸DCA-3P。非常惊喜的是,这种磷酸化修饰确实将其亲和力提升了近十倍。利用DCA-3P,研究者成功解析了胆酸类化合物与hX4的复合物结构,首次揭示了胆酸是如何激活hX4的分子机制。更有趣的是,DCA-3P所结合的口袋与目前所报道的其余MRGPRX家族受体小分子的结合口袋都不一样。其余的小分子都结合在MRGPRX家族更靠近溶剂的部分,而DCA-3P则以垂直的方式地结合在hX4内部。值得一提的是,在研究团队获得这个cryo-EM复合物结构之前,也曾尝试过利用AlphaFold和分子动力学模拟的方式去解释胆酸与hX4的结合机制,然而预测的结果表明DCA-3P结合位置与所报道的其他分子类似结合在更靠近溶剂的部分,与实验解析出来的结果完全不同,这也进一步证实一定程度上预测的模型与实际结果依旧存在着较大差距


正如所预测的那样,DCA-3P的磷酸部分(P-Head)被锁定在富含正电氨基酸的结合腔中,这种静电相互作用正是导致磺酸化和磷酸化胆酸激活活性提升的主要原因。此外,研究者也发现,DCA-3P中部的疏水部分(H-Middle)通过疏水相互作用被hX4中间丰富的疏水氨基酸所稳定。和之前的工作所推测的不同的是,DCA-3P的羧酸部分(C-Tail)并非如预测的那般结合在hX4的正电氨基酸富集区域(Sci. Transl. Med. 2024, 16: eadk8198),而是与发生构象变化的R241形成氢键相互作用。这些研究详细阐明了胆酸激活hX4的分子机制,展示了3-OH基团和磺酸化修饰在激活hX4过程中发挥的关键作用,为我们理解胆酸诱发瘙痒提供了全新视角


在对胆酸和瘙痒机制进行深入研究的同时,研究者也同时关注到现有临床药物奥贝胆酸(OCA)在治疗过程中的瘙痒副作用。OCA是一种强效的法尼醇X受体(FXR)激动剂,广泛用于治疗原发性胆汁性胆管炎(PBC)。然而,其剂量依赖性的瘙痒副作用限制了OCA在临床中的广泛应用。由于OCA也是胆酸类似物,并且同样包含了至关重要的3位羟基基团,因此,研究者推测其产生瘙痒的副作用可能也是通过激活hX4来实现的。研究者进一步从分子、动物、人体等多方位的角度证实,OCA确实可以激活hX4并且在人源化大鼠模型,甚至人体上产生剂量依赖性的瘙痒症状。因此,OCA导致瘙痒副作用的靶点确实就是hX4。
在证实了OCA的副作用靶点后,是否能够基于前期的机制研究,改造OCA使其保留治疗活性的同时失去瘙痒的副作用呢?基于对胆酸激活hX4机制的深入理解,研究团队对OCA进行了精准的结构改造,去除了其激活hX4所必需的3-OH基团,成功获得了化合物C7。令人惊喜的是,通过细胞水平的实验证实,C7失去了激活hX4的能力但保留了对FXR的激活活性。进一步通过人源化大鼠动物模型验证,发现化合物C7并不会使人源化大鼠产生瘙痒的症状!这也就说明,基于胆酸激活hX4的分子机制,非常精准地使得OCA失去了原本导致瘙痒的功能。


虽然通过分子设计使得C7成功失去了导致瘙痒的功能,那么它是否依旧具有治疗肝病的活性呢?之前的研究表明,FXR激动剂可调控胆酸代谢和脂质稳态相关基因的表达,这是OCA在治疗肝病(如PBC和NASH)中的临床优势所在。为了研究C7的全基因组效应,研究人员对C7和OCA处理后的HepG2细胞进行了RNA测序分析。结果显示,C7显著下调了胆汁酸和脂肪酸合成相关基因的表达,同时上调了与胆汁分泌相关的基因。相比对照组,C7和OCA分别改变了1021和629个基因的表达,且有376个基因的变化是两者共同的。定量PCR也验证了这些结果,证实C7显著下调了Cyp7a1,并上调了Nr0b2和Abcb11的表达。研究团队进一步证实了C7在治疗NASH等肝脏疾病方面依然具备显著疗效,且不会引发瘙痒问题。这一突破性进展彻底解决了OCA的瘙痒副作用,为肝病临床治疗带来了全新的可能性。


作者进一步研究了C7在肝脏相关疾病中的治疗作用。研究发现,C7在胆汁淤积和非酒精性脂肪性肝炎(NASH)模型中展现出强大的肝保护作用和抗纤维化潜力。在α-萘基异硫氰酸酯(ANIT)诱导的胆汁淤积大鼠模型中,C7有效下调了与胆汁酸合成和炎症相关的基因表达,显著改善了胆汁分泌,减少了血清总胆红素、ALT和AST水平,并缓解了肝实质坏死和炎症细胞浸润。在胆管结扎(BDL)模型中,C7进一步减少了胆汁淤积引发的纤维化。在TAA诱导的NASH模型中,C7下调了纤维化和脂肪生成相关基因的表达,减少了肝脏损伤及纤维化,表现出显著的抗炎和抗纤维化功效。这些研究表明,C7有望成为治疗胆汁淤积和NASH等肝病的创新药物。


综上所述,本研究工作围绕胆汁淤积瘙痒和肝病治疗新策略两个方面展开了非常系统的研究(下图)。第一个方面,从临床样本出发,结合高分辨质谱发现3位羟基磺酸化修饰胆酸在瘙痒胆汁淤积病人体内显著升高,它们能够通过增强对于hX4的激活活性从而导致更为严重的瘙痒症状。此外,利用冷冻电镜技术,解析了hX4与胆酸类似物的复合物结构,详细地阐明了胆酸的3-OH对于激活hX4的重要作用。第二个方面,研究者针对OCA在临床上导致瘙痒副作用开展了一系列的机制和分子改造研究。首先证实OCA通过激活hX4导致瘙痒副作用,接着根据发现的胆酸激活hX4的分子机制,精准地对OCA进行化学改造,成功地获得了失去瘙痒副作用,并且保留了肝病治疗活性的新一代药物分子C7,为临床肝病治疗提供了全新的可能性,有望彻底解决OCA在临床上应用中遇到的瘙痒难题。


该研究总结



雷晓光教授、李毓龙教授、陈煜教授为论文的共同通讯作者。北京大学雷晓光课题组博士研究生杨军、李毓龙课题组博士毕业生赵天军、雷晓光课题组范俊萍博士和陈煜课题组邹怀宾博士为该论文的共同第一作者。




研究组介绍


李毓龙:

北京大学生命科学学院教授,北京大学IDG麦戈文脑科学研究所PI,北大-清华生命科学联合中心PI,新基石研究员,深圳湾实验室分子生理学研究所合作PI。


实验室研究领域:

人的大脑由数十亿的神经元组成,后者又通过数万亿的突触组成复杂的神经网络。不同种类的神经元经过或远或近的投射,通过突触与其他神经元进行信息交流,实现感知觉、决策和运动等高级神经功能。

研究大脑的最大挑战在于脑的高度复杂性。我们实验室集中在神经元通讯的基本结构突触上,从两个层面上开展研究:一是开发前沿的工具,即开发新型成像探针,用于在时间和空间尺度上解析神经系统的复杂功能;二是借助先进的工具探究突触传递的调节机制,特别是在生理及病理条件下对神经递质释放的调节。

具体而言,对于工具开发,我们集中于:

1. 结合光遗传学和荧光成像,无损伤性的研究神经元之间的电突触连接。电突触的异常可导致耳聋、癫痫、脑部肿瘤和心脏功能异常等疾病。

2. 开发可遗传编码的检测神经递质/调质的荧光探针。神经递质/调质是神经元化学突触传递的关键介导分子,与感知、学习和记忆以及情绪密切相关。

利用上述荧光探针,我们的功能性和生理性的研究集中于:

1. 结合双光子成像和可遗传编码的荧光探针,使用果蝇和小鼠作为模式生物,研究嗅觉传导或睡眠过程中脑的工作机制。

2. 寻找上述新型化学递质/调质小分子的对应受体,即寻找“孤儿”受体的配体。

3. 结合生物信息学、分析化学、生物化学、生理学和成像学方法,系统地探索和鉴定潜在的新型小分子神经递质。


李毓龙实验室更多相关工作详见:

http://yulonglilab.org/。


此外,实验室长期诚聘不同学科背景的副研究员、博士后及技术员,待遇从优。欢迎对脑科学感兴趣的有志青年加入!

邮箱:yulonglilab2018@gmail.com


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