染料法:
SYBR Green I是最常用的染料之一。这种非特异性嵌入双链DNA的小分子染料,在游离状态下几乎不发出荧光,但当其结合到双链DNA上时荧光强度显著增加。 每个循环后,随着新合成的双链DNA数量增加,SYBR Green I结合的量也随之增加,因此可以通过检测荧光强度来衡量PCR产物的数量。 它的缺点是无法区分目标序列和其他非特异性扩增产物(如引物二聚体),因为染料会与所有双链DNA结合。
探针法通常使用的是水解探针(也称TaqMan探针)。这类探针是一段寡核苷酸,两端分别标记有报告基团(Reporter, R)和淬灭基团(Quencher, Q)。在完整的探针中,R发出的荧光被Q吸收,所以没有荧光信号。 探针在PCR过程中被酶切开,释放荧光信号。这种方式更特异,能准确检测目标序列,适合多重检测。但是,探针的设计和合成相对复杂,成本也较高。
[视频版本]
往期文章
手把手教学|如何分析qPCR的数据
手把手教学|荧光定量PCR全流程实验步骤和注意事项
手把手教学|通用荧光定量PCR引物设计的原则和流程
exdrive.cn
公众号、视频号、知乎、Bilibili
抖音、西瓜、今日头条、小红书
内容同步