一、概述
PCR(聚合酶链反应)仪是一种用于在体外扩增DNA片段的仪器。它基于聚合酶在一系列温度变化的循环中,通过特定的引物对DNA进行模板引导合成,从而快速产生大量的目标DNA。
二、PCR仪的使用步骤
1、准备PCR反应体系:将DNA模板、引物、DNA聚合酶、缓冲液和dNTPs等反应组分混合在一起,并加入适量的水。
2、PCR仪的温度程序:根据所需的扩增条件,设置PCR仪的温度程序,包括初始变性、循环变性、退火和延伸等步骤。
3、加载反应混合液:将PCR反应混合液分装到PCR管或板中。
4、开始PCR反应:将PCR管或板放入PCR仪,启动温度程序,让PCR仪按照设定的温度和时间变化进行扩增反应。
5、结束PCR反应:PCR反应结束后,可以通过电泳或其他方法进行目标DNA的分析。
三、以下以Bio-Rad T100操作方法为例进行详解
1、打开仪器开关,显示触屏主界面
①New Protocol:创建一个新的反应程序
②Saved Protocols:查看、编辑、运行已储存的反应程序
③Incubate:孵育功能
④Tools:设置、仪器自检、仪器信息、软件升级等
2、创建新程序
点击触屏界面的“New Protocol”按钮,进入编辑界面。
①设置反应体积,在Volume 中输入体积数,可输入范围为1-100ul, 推荐反应体积为15-50ul。
②设置热盖的温度,在Lid中输入温度,可输入范围为40-110℃,推荐温度为105℃。
③点击反应程序的每一步时,显示为绿色,分别设置该步反应的温度和时间。
点击温度按钮,如95℃,出现数字键盘,输入需要的温度,点击“OK”,确认。同样的操作编辑时间。
3、插入新的反应步骤
点击一个步骤,显示为绿色,点击“Insert”将在该步骤后面插入新的反应步骤。
在“Insert Step”界面选择需要插入反应步骤的类型;
①“Temperature”即可插入温度反应;
②“Gradient”即可插入温度梯度反应,;
③“GOTO”即可插入PCR循环反应,可设置循环的起始反应步骤,如“Step2”,即循环反应从第2步开始至第4步结束,箭头指示的过程。;
点击“Delete”,即可删除选中的步骤。
4、设置温度梯度
选择一个反应步骤,点击“Options”
①选择“Gradient”;
②在“Back row”输入温度梯度的最高温度;
③在“Front row”输入温度梯度的最低温度,右边会显示从A到H每一行的温度值;
注意:不同的PCR仪温度梯度排列方向可能不同(从左到右或者从上到下排列)
5、温度的递增、时间的延伸和改变升温速率
选择一个反应步骤,点击“Options”, 进入步骤优化窗口。每一个实验步骤都包括“Increment”、“Extend”、“Ramp Rate”。
①“Increment”输入X,即每个循环后温度增加X℃;
②“ Extend”输入Y,即每个循环后时间延长Y秒;
③“Ramp Rate”输入Z,即升温速率为Z。
点击“OK”,确认。
点击“Run”,无需储存,直接运行编辑好的反应程序。也可点击“Save”按钮, 进入储存界面。
6、反应程序暂停
PCR反应程序运行时,是允许暂停的。暂停时,加热模块会维持在当前实验步骤的反应温度,热盖也维持原本的温度,直到反应程序恢复继续运行。
当正在升温或降温时,如果程序暂停,仪器会继续升温或降温,直到到达设定的温度,才会保持不变。
在“Status”状态时,点击“Pause”按钮,反应程序暂停。点击“Resume”按钮,反应程序继续运行。
7 、跳过反应程序中的某一步,可以缩短反应时间。
点击“Skip Step”按钮,即可跳过当前步骤,多次点击“Skip Step”按钮,即可跳过多个步骤。
8、取消反应程序。
当程序取消时,加热模块立刻停止温度加热。不要立即关闭仪器电源,仪器需要时间使加热模块降温。在“Status”状态时,点击“Cancel”按钮, 选择“Yes”确认。
9、选择编辑储存的程序
点击触屏界面的“Saved Protocols”按钮,选择一个程序,点击“Edite”,进入编辑界面,操作方法同上。
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本文作者是"我叫一休"同学,在获得授权后,实验老司机将本文发表于公众号。
本文由作者根据自身经验总结而成,内容仅供参考。
文稿:我叫一休
校对:樊振华
素材:可画
参考资料:
https://de.bimedis.com/a-item/pcr-thermal-cycler-bio-rad-t100-1966186
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