粪便中的生物标志物,你知道怎么用吗?

学术   2024-08-23 20:30   上海  


我国结直肠癌发病率在全部恶性肿瘤中位居第 2 位,死亡率逐年攀升至第 4 位;其中 2022 年新发病例 51.71 万,死亡病例 24.00 万。结直肠癌患者中约 70% 为散发病例,整个发展过程一般历时 5~10 年,早期结直肠癌症状隐匿,不易察觉,多数患者在就诊时已属于中晚期。


中晚期患者常见症状包括:(1)排便习惯改变;(2)粪便性状改变(变细、血便、 黏液便等);(3)腹痛或腹部不适;(4)腹部包块;(5)肠梗阻;(6)全身症状:如贫血、消瘦、乏力、低热等,晚期可以出现腰骶部疼痛、黄疸、腹水等。


据统计,经规范治疗的确诊结直肠癌患者,5 年生存率接近 64%。此外,结直肠癌预后与诊断分期高度相关,TNM I 期结直肠癌患者 5 年生存率可达 90% 以上,而 TNM IV 期仅有 12% 左右。可见,结直肠癌筛查可以有效降低结直肠癌的死亡率。


人体血液和粪便中的 DNA 检测是一种新兴的结直肠癌筛查方法,具有采样简便,风险小,敏感性和特异性高等优势,有望成为下一代新型结直肠癌筛查和早期诊断检测靶标。



粪便 DNA 检测


粪便 DNA 检测的主要原理,是通过从粪便样本中检测来自脱落肿瘤细胞的标志性 DNA 片段,判断是否存在结直肠癌或癌前病变。这些 DNA 片段主要包括突变 DNA(基因)和 DNA 甲基化。


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DNA 甲基化


甲基化修饰是基因表达调控的重要方式,一些异常 DNA 甲基化与结直肠癌发生密切相关:粪便 SFRP2 甲基化检测筛查结直肠癌的敏感性和特异性分别为 77%~90% 和 77%,AUC 为 0.94;粪便波形蛋白甲基化检测筛查结直肠癌的敏感性和特异性分别为 46% 和 90%。


目前,已发现众多有望用于通过粪便筛查结直肠癌的甲基化 DNA,包括 APC、ATM、MLH1、MGMT、BMP3、GSTP1、NDRG4、RASSF2A、SFRP2、TFPI2、HLTF、CDKN2A、GATA4、VIM 和 WIF1 等。


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DNA 突变


在肿瘤组织标本中检测结直肠癌相关 DNA 突变已广泛开展。例如,KRAS 是由 RAS 家族成员基因编码的 GTP 酶蛋白,参与表皮生长因子受体(EGFR)的信号转导,调控细胞生长、分化、增殖和存活,被认为是结直肠癌发生的主要驱动基因之一。中国临床肿瘤学会(CSCO)结直肠癌专家委员会指出,RAS 突变型的晚期结直肠癌患者无法从抗 EGFR 单抗治疗中获益,故推荐对所有晚期结直肠癌患者,在综合治疗前进行 RAS 突变检测。自从 1992 年 Sidransky 等在粪便中成功检测出突变型 KRAS DNA 后,P53、APC、DCC 和 BAT26 等结直肠癌相关突变 DNA 的粪便检测被陆续报道。


遗憾的是,仅 40%~50% 的结直肠癌患者存在 KRAS 点突变;P53 突变一般是结直肠癌的中晚期分子生物学事件,不适用于筛查和早期诊断;APC 基因突变虽然存在于超过 85% 的结直肠癌患者肿瘤组织中,但其诊断结直肠癌的灵敏性相对有限(14%~30%)。这说明单独检测这些突变 DNA 不足以筛查结直肠癌。


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多靶标粪便 DNA 检测


结直肠癌的发生是多步骤、多基因驱动的结果,并非每一例结直肠癌均具备上述各突变 DNA 或者甲基化 DNA。多靶标粪便 DNA 检测(multitarget stool DNA test,MT-sDNA)是检测粪便中的多个 DNA 标记,包括甲基化的 BMP3、NDRG4 和突变的 KRAS,并以 βeta-actin 作为内参,具有较好的灵敏性。检出率高、无需肠道准备等优势,使 MT-sDNA 成为未来结直肠癌筛查发展的新方向。


早在千禧年伊始,Ahlquist 等首次报道联合应用 APC、K-RAS、P53 和微卫星不稳定的标志物 Bat⁃26 的多靶标粪便 DNA 检测结直肠癌和直径大于 1 cm 腺瘤的敏感度分别为 91% 和 82%,远高于粪便单靶标 DNA 检测。


有报道称,对于大于 1 cm 的无蒂锯齿状息肉,MT-sDNA 的检出率为 67%,粪便隐血免疫化学检测(FIT)的检出率为11%;对于结直肠癌,MT-sDNA 的检出率为 100%,而 FIT的检出率为 80%。


今年 4 月,一项纳入 2 万多名受试者的研究报告称,联合粪便异常甲基化 LASS4、LRRC4 和 PPP2R5C 检测和免疫化学检测的新一代多靶标粪便 DNA 检测(BLUE-C),检测结直肠癌的灵敏性达到了 93.9%,其中,对 I~III 期结直肠癌的灵敏性也达到了 92.7%,对高级别上皮内瘤变的灵敏性为 74.6%,对癌前病变的灵敏性也达到了 43.4%,各项数据均优于 FIT。


相比于 FIT 而言,MT-sDNA 对结直肠癌和较大腺瘤具有较高的灵敏性,且不需要饮食限制或肠道准备。


尽管若此,粪便 DNA 检测用于结直肠癌的筛查仍面临诸多挑战,其中包括但不限于:

1、特异性未达到预期:FIT 筛查结直肠癌的特异性为 94.8%,而 MT⁃sDNA 检测筛查结直肠癌的特异性为 86.6%;

2、癌前病变检出率仍较然偏低,仅为 42%;

3、检测成本较高,降低了患者依从性;

4、粪便 DNA 大多来自肠道细菌,急迫需要更高效的提取和纯化人类 DNA 的方法;

5、粪便 DNA 的收集较为复杂,样本的处理和分析需要专业的设备与人员,基层难以开展。



血液 DNA / 循环肿瘤 DNA 检测


临床上,外周血是用于结直肠癌分子标志物检测的重要标本。除传统的 CEA、CA199 等结直肠癌相关抗原外,循环肿瘤 DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)受到广泛关注。游离于血液中的细胞外 DNA 称为 cfDNA(cell free DNA),主要来源于血细胞和肿瘤细胞坏死、凋亡、溶解释放或直接分泌的片段化 DNA,其中来自肿瘤细胞的部分称为 ctDNA,部分 ctDNA 具有肿瘤特异性,可用于结直肠癌的筛查和复发预测,并为术前新辅助治疗及术后辅助治疗的疗效评估提供参考。


同粪便 DNA 检测一样,ctDNA 检测靶标也包括甲基化 DNA突变 DNA。其中,参与调控细胞周期和细胞分裂的 Septin9 的异常甲基化是研究报道最多的靶标。血液 Septin9 基因甲基化对结直肠癌的灵敏性为 48.2%~95.6%,特异性为 79.1%~99.1%,对腺瘤筛查的灵敏性为 9.8%~22%。美国 FDA 已于 2016 年批准一种基于血液样本的 Septin9 基因甲基化试剂盒上市。


除 Septin9 的异常甲基化外,ALX4、APC、SFRP2、SDC2、BCAT1、IKZF1 和 SPG20 的甲基化,KRAS、TP53、APC、BRAF 等突变 DNA 也可在患者的血液中被检出,但用于结直肠癌筛查的表现并不突出。


此外,采用多个 DNA 靶点联合检测的方法,可进一步提高结直肠癌 ctDNA 筛查的有效性。例如,使用 C9orf50、KCNQ5 及 CLIP4 基因甲基化联合筛查结直肠癌的灵敏性和特异性分别为 85% 和 99%,对早期结直肠癌诊断灵敏性也达到了 80% 和 85%。联合 ctDNA 检测与粪便 DNA 检测也在结直肠癌的早期筛查中展示出巨大的发展潜力,例如,对于结直肠癌 0~I 期的患者,单独检测血浆 Septin9 甲基化的灵敏性仅为 57%~64%,将血浆 Septin9 甲基化检测与 FIT 联合可将灵敏性提高到 94%。


ctDNA 检测属于微创性操作,采样方便快捷、风险较小,有助于提升人群筛查参与率和依从性。尽管如此,ctDNA 检测仍存在较多问题和挑战,包括但不限于:

1、ctDNA 仅占 cfDNA 的很小一部分,分离和纯化 ctDNA 具有一定难度;检测结果会受到正常血细胞来源的 DNA 的干扰;

2、室温下,ctDNA 在血液中的半衰期仅为 1.0~2.4 h,这对标本的取样、制备和存储提出了较高要求。



附表:部分结直肠癌筛查方式的比较



 总结 


粪便和血液 DNA 检测作为新颖的无(微)创筛查手段,在结直肠癌的筛查中展现出了巨大的应用价值。基于血液样本的 Septin9 基因甲基化试剂盒和基于粪便样本的多靶标 MT-sDNA(KRAS、NDRG4 和 BMP3)DNA 检测技术已被美国 FDA 批准。《中国结直肠癌诊疗规范(2023版)》也明确提出:近年来粪便 DNA 检测可以进一步提高结直肠癌粪便初筛的效益。相较于单一 DNA 靶标检测,多 DNA 靶标检测可以显著提高灵敏性,而进一步联合 DNA 检测与其它检测(例如 FIT、循环肿瘤抗原等)也极具前景。随着对结直肠癌相关 DNA 的研究更加深入,粪便和血液 DNA 检测有望加速进入临床,为国民健康保驾护航。



参考文献

1. Han B, Zheng R, Zeng H, et al. Cancer incidence and mortality in China, 2022. J Natl Cancer Cent. 2024;4(1):page. DOI: 10.1016/j.jncc.2024.01.006

2. Imperiale TF, Porter K, Zella J, et al. Next-Generation Multitarget Stool DNA Test for Colorectal Cancer Screening. N Engl J Med. 2024;390(11):984-993. doi:10.1056/NEJMoa2310336

3. Zhang Y, Wang Y, Zhang B, et al. Methods and biomarkers for early detection, prediction, and diagnosis of colorectal cancer. Biomed Pharmacother. 2023;163:114786. doi:10.1016/j.biopha.2023.114786

4. 国家卫生健康委员会医政司,中华医学会肿瘤学分会. 中国结直肠癌诊疗规范(2023版)[J]. 协和医学杂志, 2023,14 (4): 706⁃733. doi: 10.12290/xhyxzz.2023⁃0315.

5. 中国临床肿瘤学会(CSCO)结直肠癌专家委员会. 结直肠癌分子标志物临床检测中国专家共识[J]. 中华胃肠外科杂志,2021,24(3): 191⁃197. DOI:10.3760/cma.j.cn.441530⁃20201225⁃00679.

6. 鄂一民, 孙司正, 范小彧等. 结直肠癌粪便筛查的现状与展望[J/OL].中华结直肠疾病电子杂志, 2023, 12(04): 331-336. DOI: 10.3877/cma.j.issn.2 0 95-3224.2023.04.010.

7. 张愉涵, 陈宏达, 卢明等. 结直肠癌筛查和早期诊断生物标志物研究进展[J]. 中华流行病学杂志, 2021, 42(1):142-148. DOI:10.3760/cma.j.cn112338-20200411-00556.

8. 冷晓旭 房静远. 粪便标志物 DNA 和 RNA 筛查结直肠癌特性分析[J]. 中华医学杂志,2020 ,100(42),DOI: 10.3760/cma.j.cn112137⁃20200228⁃00507.


策划:白露
投稿:tangshixuan@dxy.cn
题图来源:站酷海洛


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