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有利对虾快速生长的水质，就是具备一定的自净能力。自净能力强的水质才能有更大的养殖优势。为了维护水质的活力，水体务必形成优良菌相、藻相，还要长时间稳定菌相、藻相。通常听到某养户感叹:想不到这虾塘亚硝酸盐了，今天又超标了，糟糕的结果是对虾体色变差了。这时候虾塘的水质由于缺乏自净能力已处于"寡水”(这里指上、下午测PH值相差为零的水质)状态。预防"寡水″，还得从放苗后开始，每隔5~7天调一次水。当集约化养殖对虾时，无可否认水体的污染速度过快。无论是养虾的哪个时期(前、中、后)，每个时期的水质状态好坏都与自净能力大小扯上关系。
过度投喂的问题，会降低水质的自净能力。就是喂的过多后，水质跟着变化。当对虾摄入过多的营养物质加重了体内的代谢负担，特别是一些难以代谢的物质，长期会导致肝胰脏问题。同时残饵和排泄物又会造成水质问题(这时指进一步加重污染)，虾在这样的环境中得病的机率高。
水质具备的自净能力可赋予养虾的正能量，让对虾更有安全感。一些易老化的水质，就是自净能力下降的表现。增强水质的自净能力，可选用鱼虾混养模式，然而这番操作也有争议性:搭配比例如何？如每亩水面:鱼二千尾(7朝苗):一万尾虾(8朝苗)等，主要还是看养户的模式了，以鱼为主时，搭配:鱼多虾少；以虾为主，搭配:虾多鱼少。这样也有利于防控病害。
在养虾规划中，未放苗的水质与放苗后的水质是不同走向的。如未放苗的水质发粘了，从中说明水质不良了。有养户认为该重新消毒改水了。如不去改水的话，这有可能在放苗后出现养坏苗的现象。这还得从水质自净能力下降说起，在虾塘的环境中，水质不能自净的原因如果属于人为进、调水不当时，不妨减慢放苗的速度。
有养户认为塘租成本大，不加以利用塘的话，亏塘租是必然的事。世间必然的事很多，正如年长的孩子，到了读书的年龄就要进入校园。有人认为不进入校园可以不？这些看法属于违背教育本身的意义。在养虾的用水标准上，它让养户有了方向感。有养户把水质弄得一团糟，本身就是违背了养虾本身的意向(根本不是想方设法去养好虾)。
养虾中、后期的水质，一直在提倡适当削减水质的营养。一旦水质里的营养物过多，水质的自净能力就会下降。如虾塘里重金属离子过多，也存在隐患，会加速倒藻。藻少了，自净能力就会下降。如果养户在维护水质上不给力，水质只会倾向坏处(严重倒藻后造成对虾应激大，进而暴发病害快)，对于养大规格虾就是一个极大挑战。
水质受养户消毒管理后呈现不同的水色。不同的水色有着不同的自净水平。有时候不良水色让养户总感觉水体欠缺什么一样，很多时候通过显微镜去发现。如藻类倾向衰退状态，就要及早引进带新藻种的水；如果本身虾塘由于过度消毒造成水体环境恶化，进去的新藻种不禁让人有种“夕阳无限好，只是近黄昏”的感受(有人认为倒藻厉害的虾塘，即使引进带新藻种的水，藻也活不了多久。)。因此，严格执行″安全、低毒、高效″的消毒措施，有利于水体的稳定性。
养虾既要做到菌藻平衡，也要维护水体的自净能力。有时候亚盐的突然飙升(指已超出养虾水质标准的范围)。据相关水质测试所表示:当硝酸盐为0时，氨氮0，亚盐＞0.15，为污染物已分解，但未完全自净；氨氮0，亚盐0，为洁净水；氨氮＞0.2，亚盐0，为水体受到新近污染……由此可见水质的自净过程与亚盐的标准化有所关联。
虾塘的菌相、藻相变化与虾塘的管理有关。有养户遇到细微的菌相、藻相变化已及早干预了，所以防止了返底。有时候只相信多开溶氧机就可以防止菌相、藻相的剧变，却不在乎天气变化、水色变化、底质变化、投喂变化等，到头来水质的自净能力变弱了还是一样归咎于管理缺失。特别是对虾养殖中、后期的水质，因其自净能力减弱，养户务必提高控料及水质调控的频率。事实上，自净能力强的水质与养出大规格虾有着必然的联系。
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