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2021年，南通市16个国考断面水质优Ⅲ比例为87.5%，农业面源污染成为制约全市地表水环境质量进一步提升的瓶颈，特别水产养殖领域，由于养殖过程中饲料投入多、养殖密度大，加上养殖生物的活动（游动、摄食、排泄等）以及气象条件等各种因素的作用，造成养殖水体中有机物含量升高，pH、COD、总氮、总磷总量相应增加。
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