ENVIRON EXP BOT:解析牧豆树胁迫耐受机制,培育逆境韧性作物

学术   2024-10-30 20:23   四川  

高温是主要的非生物胁迫因素之一,它还会引发其他胁迫,如干旱。地球温度自1880年以来每十年上升一定幅度,到2100年预计平均温度还会大幅上升,这将对农业产生严重影响,威胁粮食安全。植物的耐热性依赖于热休克蛋白(HSPs)和热休克因子(HSFs)。HSFs 通过与 HSP 基因上游的热休克元件(HSEs)结合来调控基因表达。当植物暴露在高温下时,HSFs 和 HSEs 被激活,促使大量 HSPs 的合成,这些 HSPs 能够修复和重折叠受损蛋白质,对植物的蛋白质内稳态和耐热性起关键作用。基因表达对植物生长、发育和适应环境至关重要,其受多种调控元件影响。启动子和终止子是植物中基因表达的两个关键调控元件。植物启动子是包含 RNA 聚合酶和转录因子结合位点的 DNA 片段,可分为组成型启动子和诱导型启动子。组成型启动子持续刺激下游基因转录,但缺乏特异性和对蛋白质表达的严格控制;诱导型启动子则能在特定刺激下以时空特异性的方式调控基因表达,在农业转基因应用中具有重要价值。终止子在基因表达中也起着重要作用,它决定了 mRNA 转录的量和稳定性。虽然在转基因植物开发中往往强调启动子的强度,但近年来终止子在调控基因表达方面的重要性也逐渐受到关注。终止子位于编码序列下游,其作用包括防止相邻基因的非预期转录以及增强 mRNA 转录本的稳定性。

牧豆树(Prosopis cineraria)是沙漠生态系统中的优势豆科树种,对高温、干旱等非生物胁迫具有高度耐受性,是研究植物抗逆性的良好材料2024年10月9日,Environmental and Experimental Botany在线发表了阿联酋大学Sasi S等题为Learning from the desert legume tree, Prosopis cineraria to develop stress-tolerant crops的研究文章。该研究通过对牧豆树热激蛋白基因 PcHsp18.2 的启动子和终止子进行分析和功能验证,探讨了其在提高作物抗逆性方面的应用潜力。

材料与方法

植物材料和DNA提取:从阿联酋Sweihan地区(24°17’18.3"N 55°43’36.2"E)沙漠中生长的 20 年以上树龄的牧豆树采集叶片作为实验材料。采用改良的CTAB法提取叶片DNA。经质量和含量检测后,提取的DNA用于后续启动子和终止子的扩增。

HSP18.2 启动子和终止子的克隆:研究牧豆树Hsp18.2PcHsp18.2)的相对季节性表达,设计启动子和终止子(分别为pPcHSP18.2tPchsp18.2)引物,进行 PCR 扩增,产物纯化后克隆到载体并测序。

序列分析:识别和分析启动子和终止子序列中的顺式调控元件和调控基序,并与其他 HSP 启动子进行比较。

转化载体的构建:将 pPcHSP18.2(715bp)、ptPcHSP18.2(249bp)和 pCaMV35S(346bp)启动子克隆到植物转化质粒载体 pCAMBIA 1391Z 中 gusA 报告基因的上游。通过限制酶EcoRI和AvrII从pMiniT™ 2.0载体上切下启动子片段,与用相同酶切的pCAMBIA 1391Z载体的gusA基因上游融合,构建重组质粒:

pCAMBIA1391Z-pPcHSP18.2::gusA-tnos(命名为PGN)、

pCAMBIA1391Z-ptPcHSP18.2::gusA-tnos(命名为PTGN)、

 pCAMBIA1391Z-CaMV35S::gusA-tnos(命名为35SGN)。

将载体的tnos终止子替换为tPchsp18.2片段(249bp),通过合成包含从BstEIISphI的序列(保留tnos上游和下游到SphI 的序列),并将tPchsp18.2以正向、反向(tPchsp18.2 R)以及截短形式(tPchsp18.2100)分别克隆到载体中,构建重组质粒:

pCAMBIA1391Z-pPcHSP18.2::gusAtPchsp18.2(命名为PGHT)、

pCAMBIA1391Z-pPcHSP18.2::gusA-tPchsp18.2100(命名为PGHT100

pCAMBIA1391Z-pPcHSP18.2::gusA- tPchsp18.2 R(命名为PGHTR)。

图1 PcHsp18.2(图上方)以及在无启动子的 pCAMBIA1391z::gusA 表达载体中的表达盒的示意图

农杆菌介导的烟草转化:采用 Kodackattumannil 等人描述的农杆菌介导转化方法,用重组质粒转化烟草(Nicotiana tabacum cv. SR1)叶片外植体。经过共培养、筛选和生根培养,获得转基因烟草植株。

转基因植物的确认:将具有健壮根系的单个假定转基因植株(用不同构建体转化)移植到装有盆栽土的盆中,在25°C、16h/8h 光照/黑暗光周期的植物生长室中生长。采用前述的 CTAB 方法从转化和未转化(野生型,WT)植株的叶片中提取基因组 DNA,用 PCR 和 GUS 组织化学染色确认转基因植株。按照 Kodackattumannil 等人的方法完成 T₀植物的建立和转基因株系 T₃后代的产生,T₃后代用于胁迫实验。

热胁迫和其他非生物胁迫:对转基因株系的种子(T₃)进行消毒后,按照 Kodackattumannil 等人的方法在含潮霉素的培养基上萌发和生长,WT植株在无潮霉素的培养基上萌发和生长。对不同生长阶段(10、20、40 天和开花阶段)的健康植株进行热胁迫和其他非生物胁迫处理,分析组织中的 GUS 活性,提取 RNA 进行基因表达分析。

花粉活力和萌发研究:用Ampha Z32花粉活力分析仪(瑞士Amphasys AG)分析花粉活力,用花粉萌发培养基培养花粉,分析花粉萌发率。

热胁迫下的结实和萌发:对植株进行热胁迫处理,分析结实情况和种子萌发率。

RNA 提取和 gusA 基因表达分析:提取植物组织中的 RNA,反转录为 cDNA,用实时定量PCR 分析 gusA 基因的表达。

研究结果

PcHsp18.2 的季节性相对表达

PcHsp18.2 基因的相对表达量在2021年呈现出季节性差异,在夏季表达量显著升高,呈现出高倍数表达(图 2A )。在 2021年各个月份采集的样本中,6 月采集的样本中 PcHsp18.2 基因的表达量最高。这是因为 2021 年 6 月是当年温度最高的月份,该基因的表达可能与温度升高的热胁迫环境有关(图 2B )。

图2 2021年隔月采集的牧豆树中PcHsp18.2 的相对表达情况(A);2021 年 6 月(最热月份)采集的花朵中PcHsp18.2 的表达情况(B)。

PcHsp18.2的多序列和系统发育分析

通过多序列和系统发育分析发现,PcHsp18.2 与绿豆(Vigna radiata var. radiata)表现出高度的相似性。这表明PcHsp18.2 可能与绿豆中的同源基因在进化上具有较近的亲缘关系,它们可能具有相似的功能和基因结构。相比之下,PcHsp18.2 与拟南芥(Arabidopsis thaliana)的序列相似性较低。这说明 PcHsp18.2 在进化过程中可能发生了一些独特的变化,导致其与拟南芥的同源基因在序列上产生了较大的差异,其功能和调控机制可能也存在一定的区别。

图3 PcHsp18.2 的多序列和系统发育分析

PcHSP18.2启动子序列中顺式元件的结构分析

pPcHSP18.2序列分析显示出多个与环境信号相关的转录因子结合位点,包括高温、低温、干旱、ABA、盐和 SA 响应元件,以及组织/器官特异性表达元件。

图4 PcHSP18.2 启动子的顺式元件

HSP18.2 启动子和终止子的比较分析

pPcHSP18.2与拟南芥的pAtHSP18.2 具有较高的一致性,但包含更多的顺式元件,且热休克元件的结构和分布存在差异。tPchsp18.2与拟南芥的tAthsp18.2具有较高的相似性,但在调控元件的位置上存在差异。

图5 序列分析。牧豆树和拟南芥HSP启动子的序列比对(A); PcHSP18.2终止子的序列及特定元件(B);牧豆树和拟南芥HSP终止子的序列比对(C)。

gusA 基因在非生物胁迫下的表达

在热胁迫下,PGHT组合在叶、茎和根的维管束中表达量最高,PGHTR组合表达量较低。

图6  经各种非生物胁迫处理后 40 天转基因烟草第 3 或第 4 片叶的 GUS 染色情况

PGNPGHT植物中 gusA 基因的时空表达

在不同发育阶段和组织中观察到 GUS 表达的时空分布,PGHT 植物在所有花器官中表达量较高。

图7 热胁迫后,在转PGN基因的烟草植株中,PcHSP启动子调控下 GUS 的时空表达情况。(A)10 天龄幼苗,(B)子叶,(C)40 天龄幼苗,(D)幼苗根系,(E)幼苗茎,(F)成熟茎,(G)叶柄,(H)花朵,(I)花瓣,(J)柱头,(K)花药,(L)花粉粒,以及(M)萌发的种子。

图8 热胁迫后,在转PGHT基因的烟草植株中,带有tPcHSP18.2 终止子的PcHSP 启动子调控下 GUS 的时空表达情况。(A)10 天龄幼苗,(B)子叶,(C)40 天龄对照幼苗,(D)40 天龄受胁迫幼苗,(E)带有根毛的根,(F)叶柄,(G)成熟茎,(H)发育中的对照花朵,(I)发育中的受胁迫花朵 I 阶段,(J)花朵,(K)对照花朵的纵切面,(L)受胁迫花朵的纵切面,(M)雌蕊,(N)心皮纵切面,(O)花药,(P)萌发的花粉,(Q)豆荚,以及(R)未成熟种子。

花粉活力和萌发研究

PGNPGHT植物在热胁迫后的花粉活力和萌发率均高于野生型。PGNPGHT植物在热胁迫下的结实率和种子萌发率均高于野生型。

图9 花粉及萌发研究。(A)IFC分析;(B)体外萌发花粉的GUS染色;(C)花药中的GUS表达;(D)热胁迫后所采集种子的萌发百分比。

qRT-PCR 分析

gusA 基因的表达在不同胁迫下呈现差异。在所有测试组织(如植物的叶、茎和根)中,热胁迫下 gusA 基因表达量最高,而冷胁迫下所有组织中的相对表达量最低。

图10 不同组织中gusA的相对表达量。(A)叶片;(B)茎;(C)根;(D)花药。

本研究验证了 pPcHSP18.2 tPchsp18.2 在烟草植物中的诱导性,为基础和应用研究提供了应激诱导型启动子。PcHsp18.2在夏季表达量最高,表明其存在强大的调控机制,可用于挖掘高效基因和启动子,赋予作物耐受性状。

原文
Sasi S, Krishnan S, Kodackattumannil P, et al. Learning from the desert legume tree, Prosopis cineraria to develop stress-tolerant crops[J]Environmental and Experimental Botany, 2024, 228: 106003.

相关阅读:
• MsMIOX2基因在苜蓿盐碱胁迫耐受中的作用及分子机制
• 糖基转移酶基因的进化和功能分化塑造茶树品质和耐寒性
• 不同绿豆基因型的高温耐受性及胁迫后的补偿性生长差异

霜降:人间至此秋色尽,草木摇落露为霜。

AgriPheno平台
植物生理生态、植物表型组学和基因组学、激光雷达探测技术及数据分析、光谱技术、花粉活力分析、生物育种、温室气体、机器人自动化等领域,国内外最新资讯、战略与政策导读。
 最新文章