“ 2024年3月《细胞和感染微生物学前沿》（FRONT CELL INFECT MI）发表了一篇题为“Unveiling the antibacterial mechanism of resveratrol against Aeromonas hydrophila through proteomics analysis”的蛋白质组学分析文章。”
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研究结果
01. 通过 生物实验 研究白藜芦醇Res对嗜水气单胞菌A.h的抗菌活性
图A：通过自动生长曲线仪测定不同浓度Res处理下A.h的生长曲线，其中在A.h(普通LB阴性培养基)和A.h+3%DMSO(阴性培养基)中，菌株生长趋势基本相同，随着Res浓度增加，生长曲线降低，甚至128ug/ml Res浓度下，A.h OD600 几乎为0。表明Res能明显抑制A.h的生长。
图B：研究48、64 μg/mL Res 培养12 h后A.h的存活能力
图C：通过 结晶紫法 评价Res对A.h的抗生物膜活性。随着Res浓度增加，生物膜形成率显著降低。
02. 定量蛋白质组学下的蛋白质结果
分别选取A.h、A.h+48ug/ml Res、A.h+64ug/ml Res 三种处理组，每组有3个重复性样本，共9个样本进行定量蛋白质分析。根据定性定量结果进行生物信息学分析：
图A：样本中蛋白质丰度相关性分析，不同处理之间相关性系数低，重复性样本之间相关性系数高。
图B：PCA主成分分析，重复性样本聚集到一起。
图CD：差异分析，在A.h+48ug/ml Res VS A.h差异分组中鉴定出1098个显著差异蛋白质；在A.h+64ug/ml Res VS A.h差异分组中鉴定出1036个显著差异蛋白质。
图E：针对差异比较组中显著差异蛋白质DEPs数量绘制直方图进行展示。
03. 定量蛋白质组学下的生物信息学分析
在上面差异分析中，得到的不同差异比较组中的1098和1036 DEPs，之后针对两组中的共有或特有DEPs（venn图AB）分别进行GO富集分析，并将结果绘制成饼状图（图CDEFGH），不同颜色代表功能富集相关的不同生物学过程。
04. 不同浓度处理下蛋白质的表达趋势分析
文章进一步分析了Res浓度对A.h中蛋白表达的关联影响。分析全部蛋白质的聚类趋势，如图所示，共得到8个簇。
其中cluster3是唯一一个表达变化一直保持下调的聚类簇，簇中有339个蛋白质，这些蛋白可能与研究目的相关，在调控基因表达中发挥重要作用。
取48/64 ug/ml Res处理下的菌种进行qPCR验证， 结果显示，qPCR实验数据与相应的蛋白质组学数据基本一致，进一步证明了组学数据的可靠性和可重复性。
06. 白藜芦醇对细菌形态的影响
利用扫描电镜 (SEM) 研究Res处理前后A.h细胞形态的变化。结果显示，Res处理导致细胞形态发生显著变化，且呈剂量依赖性。细胞尺寸随着Res浓度的增加而增大（图A），这可能是由于Res胁迫细胞分裂相关基因的表达受到影响所致。
并绘制细胞大小直方图（图B），***代表P<0.05。
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