肠道-脑轴新突破!Nat Methods | 诱导多能干细胞变身「内脏感觉神经节类器官」,揭示神经疾病奥秘

文摘   2024-11-08 20:00   上海  

在神经科学领域,肠道-脑轴(gut-brain axis)的研究越来越受到重视。肠道微生物组在多种神经疾病患者中发生了变化,而调控这些微生物可以减轻小鼠模型中的神经疾病症状。尽管免疫系统和肠道-血液-脑轴(gut-blood-brain axis)的作用受到了广泛关注,但迷走神经(vagus nerve)——这条连接大脑和肠道的重要通道的作用也不容忽视。


与此同时,随着干细胞技术的进步,科学家们已经能够从诱导多能干细胞(iPSCs)中产生各种细胞和类器官。然而,生成内脏感觉神经元(VSNs)的方案尚未完善。这些神经元对于理解肠道-脑轴在神经疾病中的作用可能具有重要意义。


近日,韩国首尔大学的Inhee Mook-Jung研究团队在《自然·方法》(Nature Methods)上发表了一篇题为“Differentiating Visceral Sensory Ganglion Organoids from Induced Pluripotent Stem Cells”的研究论文。该研究成功创建了一种从iPSCs分化出内脏感觉神经节类器官(visceral sensory ganglion organoids, VSGOs)的方法。



分化过程及验证


研究人员通过一系列特定的方法和调控,成功地将iPSCs分化为内脏感觉神经节类器官。在这个过程中,他们使用了定量PCR和免疫染色技术进行验证。例如,PAX2基因在分化过程中表达量较高,而TFAP2A和PAX8基因的表达量有所降低,这为分化过程的准确性提供了有力的证据。


VSGO和i-VSN的分化及验证


以早期阶段的细胞为基础,通过添加多种生长因子,研究团队成功分化出了VSGO和内脏感觉神经元(i-VSNs)。免疫染色结果显示,VSGO能够表达多种典型的神经节标记物,如PHOX2B和PIEZO1。此外,钙成像和膜片钳分析表明,VSGO具备功能性,并且包含多种对不同化学物质有反应的i-VSN群体。


单细胞RNA分析结果


通过对i-VSNs和VSGO进行单细胞RNA测序并整合分析,研究团队确定了多种细胞类型,包括VSNs、施万样细胞(SCs)、卫星胶质样细胞(SGCs)以及EpP样细胞(EpPLs)。这些细胞类型各自具有独特的标记基因表达模式,为深入了解细胞的组成和特性提供了基础。


图1:VSGO单细胞RNA分析


发育轨迹分析


通过轨迹分析技术,研究团队揭示了VSGO分化的发育途径。他们发现了多种祖细胞类型,如边境未决定祖细胞( BLUPs),以及不同的分化轨迹,如BLUPs-NEpP2和BLUPs-OEPD-NEpP1等。这些发现确定了相关的关键驱动基因,对于理解细胞分化的机制和调控具有重要意义。


亚簇分析


亚簇分析显示,VSNs具有明显的异质性。不同亚簇能够表达不同的神经肽受体和神经递质。例如,某些亚簇表达P2RX家族受体,并且在神经递质分泌方面,不同亚簇对血清素、去甲肾上腺素等的分泌情况各不相同。这体现了VSNs在功能和分子表达上的多样性。


轴-芯片模型结果


研究团队成功设计并构建了微流控芯片,将VSGO与人结肠类器官(HCOs)连接起来,形成了3D轴-芯片模型。通过填充细胞外基质,有效减少了分子扩散。免疫染色观察到芯片上的神经连接,并利用逆行跨突触伪狂犬病毒验证了VSGO和HCOs之间的直接连接。


图2:使用微流控芯片建立连接VSGO和HCO的3D轴-芯片


功能连接验证


钙成像结果显示,VSN在与HCO连接时对葡萄糖和胆汁酸会产生特定的反应,从而验证了两者之间存在功能连接。对轴-芯片上的类器官进行单细胞分析,确定了HCO和VSN的不同细胞簇以及相关标记基因表达情况,并且发现这种连接会导致转录组发生改变,进一步说明了两者之间的紧密联系和相互影响。


在AD研究中的应用结果


在轴-芯片模型中研究Aβ(淀粉样蛋白β)和tau(tau蛋白)传播时,研究团队发现VSNs可能是这些病理蛋白传播的潜在介质。APOE4(载脂蛋白E4)和LRP1(低密度脂蛋白受体相关蛋白1)对传播过程产生了影响。通过比较不同iPSCs来源的VSNs,发现APOE4会影响亚簇的分布及基因表达。对内脏运动神经元(visceral motor neurons, VMNs)的研究表明,其在Aβ和tau传播过程中的作用小于VSNs。应用患者来源的iPSCs构建轴-芯片模型,发现Aβ和tau的传播与临床数据之间存在相关性,为研究AD的发病机制和相关治疗提供了新的视角和依据。


图3:患者来源的内脏感觉神经节类器官(VSGO)的Aβ和tau传播测定


这项研究成功建立了从iPSCs分化内脏感觉神经节类器官的方法,并通过多维度研究验证了其分化过程及特性。构建的轴-芯片模型在神经疾病研究中显示出VSNs可能是肠道-脑轴中病理蛋白传播的潜在介质,受APOE4和LRP1影响,且与临床数据相关。这项研究为神经疾病研究提供了新的模型和思路,有助于深入理解肠道-神经-脑轴在神经疾病中的作用机制,对未来相关疾病的治疗和研究具有重要意义。


参考文献:

Ahn, K., Park, HS., Choi, S. et al. Differentiating visceral sensory ganglion organoids from induced pluripotent stem cells. Nat Methods (2024). https://doi.org/10.1038/s41592-024-02455-8



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