扁甲系（Cucujiformia）昆虫是鞘翅目(Coleoptera)多食亚目(Polyphaga)中最大的一个类群，包含92个科，超过173000种，是鞘翅目中进化最成功的类群之一。扁甲系昆虫具高度的生态适应性，能在各类生境中生存和繁衍，不仅包含众多的农、林、牧、渔害虫，同时也包含众多的天敌、传粉和药用昆虫，在经济上具有重要意义。因此，理解其进化历史，重建其稳定的系统发育关系至关重要。然而，由于扁甲系昆虫形态多样性和栖息地的广泛分布，对各类群很难有充分的采样，使得基于形态学的进化分析困难重重。此外，分子标记的选择和数据集的处理往往只局限于有限的基因样本，限制了对扁甲系深层系统发育关系的重建，特别是扁甲系内部深层节点系统发育关系、扁甲总科（Cucujoidea）单系性问题等充满争议。这些问题极大妨碍了对扁甲系昆虫进化的理解。近年来，随着转录组和基因组在昆虫研究中的应用，大量的组学数据可以应用到昆虫系统发育研究中，这为解决扁甲系内部的系统发育关系提供了大数据基础。
Journal of Systematics and Evolution（JSE）2024年6期发表了西北农林科技大学植物保护学院刘德广教授课题组题为“Comprehensive phylogenomic analyses revealed higher-level phylogenetic relationships within the Cucujiformia”的研究论文（https://doi.org/10.1111/jse.13079）。以扁甲系昆虫为研究对象，测序了两个全基因组和一个转录组数据，并将这些新的基因组数据与现有的组学数据整合，进行了全面系统的基因组分析。
西北农林科技大学博士李星昊为该论文的第一作者，西北农林科技大学刘德广教授和陕西省杂交油菜中心的李永红研究员为该论文的共同通讯作者。课题组成员硕士研究生李茹凡、胡芳静，博士研究生郑帅、饶富强，陕西省杂交油菜中心的初级农艺师安荣参与了该研究。研究得到了陕西省重点研发计划项目的资助。
Journal of Systematics and Evolution (JSE)是以分类、系统发育和进化为核心内容，以描述和理解生物多样性为服务目标的多学科综合性国际学术期刊，主要发表系统与进化生物学领域的研究成果。JSE是中国科学院期刊分区表生物学大类1区期刊，中国科技期刊国际影响力提升计划项目（2013–2018）和中国科技期刊卓越行动计划项目（2019–2023、2024–2028）支持期刊。最新JCR影响因子3.4，排名60/265，位于Q1区。获第三届、第四届中国科协优秀科技论文奖。2023年连续第十二年荣获“中国最具国际影响力学术期刊”奖。
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