基于像差定向相位解包裹的数字全息显微术相位像差补偿

文摘   科技   2024-10-25 14:46   北京  


摘要:在数字全息显微中,由于成像系统的引入和成像元件的未对准,会导致样品的相位图发生严重畸变。本文提出了一种基于非连续路径相位解包裹和最小二乘拟合的自动补偿方法。该方法优先整体解包裹低动态范围的大面积像差项。在不需要背景分割或复杂优化的情况下实现了精确的拟合。据我们所知,这是第一次研究重点在相位畸变补偿的解包裹序列。数值模拟结果表明所提出的方法不仅可以补偿倾斜和球面像差,还可以补偿高阶像差和交叉项像差。实验结果表明,本文提出的方法在速度和鲁棒性上优势显著。

1. 介绍

数字全息显微术(DHM)是一种基于干涉测量的定量相位成像技术,它提供了一种非侵入性、无标记、高时空分辨率的成像。因此,DHM已广泛应用于各种领域,如生物医学、工业检测和表面形态测量。由于引入了位置不精确的显微成像系统,因此在恢复相位中不可避免的涉及相位畸变。另外,光学元件的未对准也会导致高阶相位像差。因此,真实的样品相位分布很可能被上述像差所淹没。
已经提出了许多补偿像差的方法,这些方法可以分为两大类:物理方法和数值方法。物理方法通常通过实验来补偿像差。尽管双重曝光是消除像差的有效方法,但它牺牲了时间分辨率,并可能导致由于样品的光折射而导致的未对准。其他物理方法,例如采用远心配置、在参考波中引入相同的显微镜物镜或使用电可调液体透镜(ETLL)也起作用,但需要额外的光学元件和精确对准。总体而言,这些基于实验的方法使得DHM的实现更加复杂,并且增加了装置成本。
与调整光学装置相反,数值方法可以通过从恢复的相位中减去数字相位掩模来补偿像差,而无需对装置进行任何改变。掩模通常使用抛物线函数、球面、标准多项式或泽尼克多项式来拟合。然而,由于样品相位和像差相位的混合,精确拟合掩模可能是具有挑战性的。为了克服这个问题,已经提出了各种方案。主成分分析(PCA)是一种有效的方法,它将相位图分解为一组不相关变量的值,从而精确地提取主要的畸变项。然而,它不适用于高阶像差和交叉项。另一种有效的方法是通过深度学习选择无干扰区域进行拟合,当样本在空间域中非常稀疏时,它可以工作。还提出了一种基于深度学习的数据驱动方法,该方法通过学习样本全息图和无样本全息图之间的映射,直接产生包含所有背景相位像差的无样本全息图。然而,基于深度学习的方法需要大量数据进行网络训练。基于优化的拟合方法也是近年来提出的。他们没有解决最小二乘问题,而是将相位畸变视为相位变化最小化问题或基于范数的逆问题。可以通过多次优化来获得像差的准确估计。
本文提出了一种只需要相位解包裹和最小二乘拟合的自动补偿方法,与其他基于拟合的方法不同,我们的重点是相位解包裹而不是优化。该方法采用了基于像差的非连续路径相位解包裹算法,对动态范围较低的大面积像差项进行了整体优先解包裹。然后利用Zernike正交多项式和最小二乘拟合对曲面进行建模,实现了对像差的精确补偿。通过不同的像差仿真和多样本实验验证了该方法的通用性和鲁棒性。

2. 方法

离轴是DHM中的常见设置,其中参考光束与具有轻微倾斜角λ的样本光束干涉,生成具有以下强度分布的全息图:
需要调整合适以避免傅立叶域中的0阶和±1阶项之间的重叠,以便可以使用带通滤波器来提取+1阶项,如图1所示。参考光束是准平面波。通过频谱中心化和消除指数项,+1阶项可以表示为,也可以通过执行逆傅里叶变换来获得包裹相位

其中表示傅里叶变换及其逆变换。是傅立叶域中的滤波器函数。由于引入了显微物镜、管透镜等成像元件,DHM中不可避免地会出现位相畸变。在传统的数值重建过程之后,包裹相位可以表示为:

其中分别表示样本相位和相位畸变。像差可以通过使用Zernike多项式的表面拟合来建模为:

其中是第i阶的泽尔尼克多项式,是相应的系数。像差可以通过从恢复的相位中减去来进行数字补偿。

如图1所示,我们生成了两个512 × 512像素的半球形表面作为模拟相位。为了合成具有像差的相位,我们使用Zernike多项式来模拟像差。然后,引入参考波以与样本波干涉,从而产生全息图。随后,进行了重构过程,包括快速傅里叶变换(FFT)、频谱滤波和逆FFT。如图1所示,恢复的相位由于像差而失真。

与传统的重构方法相比,要获得精确的采样相位分布需要两个额外的步骤:相位解包裹和Zernike多项式拟合相位补偿。多项式拟合是基于解包裹相位的,拟合的精度对解包裹方法非常敏感。背景分割是一种有效的提取无样本区域进行解包裹的方法,但它增加了整体工作量。在DHM中,还存在额外的挑战,例如不同方向上的不均匀像差相位以及包裹相位中的样本相位和像差的混合。因此,单独的固定方向相位解包裹不足以解决复杂和不对称的像差问题。

Fig.1. 重建和像差补偿方案。步骤一:模拟相位像差;步骤二:DHM的常规重建过程,包括FFT、频谱滤波和逆FFT;步骤三:面向像差的解包裹;步骤四:多项式拟合和相位补偿。(a)像素的可靠性;(b)(c)水平和垂直边缘的可靠性;(d)-(f)解包裹过程中的组

2.1 像差定向相位解包裹

我们面向像差的相位去包裹方法遵循的是一条局部的、非连续的路径,由于相位像差的范围往往远大于样本的相位,在分组和确定去包裹区域时,相位像差必须是较大的分组,去包裹过程也是基于在畸变组。因此,相位解包裹过程由像差引导,具有大面积和高动态范围的像差项可以很好地展开到二维表面,而具有小面积和低动态范围的样品相位成为次要考虑因素。采用面向像差的相位解包裹算法进行相位解包裹,为后续像差曲面的多项式拟合提供了更方便的拟合数据。该过程总结在算法1中。首先,在行2中,利用像素之间的二阶差来确定包裹相位中像素的可靠性。然后,水平和垂直边缘可靠性由行3中的两个相邻像素的可靠性之和定义。通过对边缘可靠性排序确定离散解包裹路径。所有像素最初都没有被标记组。随着解包裹的继续,第6行中的像素被标记为第9行中的同一组。值得一提的是,属于较小组的像素相对于较大组中的像素被展开,这确保了像差被整体地展开。

2.2 像差泽尼克拟合

泽尼克圆多项式广泛用于波前分析,因为它们可以表示几何波前与参考球面的偏离。它们可以写成:

其中是圆形瞳孔平面中的极坐标,是径向多项式。下标j是多项式排序数,它是n和m的函数。

如上所述,Zernike系数由于它们的正交性而线性独立,因此可以分离和单独量化各个像差对整个波前的贡献。方程(4)中的拟合过程可以表述为解决矩阵中的线性方程:

二维矩阵被展开为列向量,m是需要拟合的点的总数。由列向量组成的新的二维矩阵用作线性方程的系数矩阵。由于多项式的正交性,多项式矩阵是可逆的。方程(7)是超定的,并且变量c可以通过最小二乘法简单求解:

目标函数可展开如下:

其中等于。由于结果是一个标量,所以它等于它的转置矩阵,即。然后对目标函数E(c)取偏导数:

由于矩阵Z的正交性,E(c)是凸函数。具有零导数的点使目标函数值最小化:

3. 模拟
我们首先通过数值仿真结果验证了所提方法的准确性。如图2(a)所示,我们生成两个半球形,面作为样品的相位,其大小为512 × 512像素。通过Zernike多项式建模的像差被添加以合成图2(c)中的模拟相位分布。然后,引入参考波与采样波干涉,产生图2(d)中的全息图。随后,按照图1所示的步骤进行重建过程,相应的结果如图2(e)(i)所示。可以看出,所提出的方法消除了像差。这可以通过图2(j)所示的定量分析进一步观察到,其中原始相位用蓝色标记,而恢复相位用红色标记。除了零点附近的噪声外,恢复后的相位分布与原始相位分布几乎相同。值得注意的是,图2(g)中通过逆FFT直接恢复的像差与图2(c)中的有很大的不同。由于像差的存在,导致+1阶谱中心的选取不正确,从而在恢复相位中引入了线性相位因子。因此,补偿结果不能由Zernike多项式的系数来评估。
为了比较,PCA、多重FFT和Goldstein分支切割方法也被用于相位畸变补偿。除了PCA之外,其他结果基于上述不同的解包裹算法和第2.2节中描述的Zernike拟合算法。如图3所示,我们分别在低阶像差(第一个4阶Zernike多项式)和高阶像差(第一个6阶Zernike多项式)的情况下测试了这些方法的性能。很明显,PCA方法在补偿低阶像差时工作良好,但对于高阶像差则失败。多重FFT方法根本不能补偿像差。Goldstein分支切割方法对于补偿不同种类的像差不够稳健。然而,我们的方法在不同像差的情况下仍然是有效的和鲁棒的。结果表明,在相同的拟合方法下,该方法能更准确地消除像差。

Fig.2. 模拟结果:(a)-(d)模拟的相位、像差和全息图;(e)(f)全息图的光谱及其+1级;(g)初始重建;(h)拟合像差;(i)无像差的重建相位;(j)定量分析

Fig.3. 所提出方法应用于模拟像差的补偿结果。两个模拟样品是半球形表面和USAF 1951

4. 结果和讨论
4.1 示意性装置

为了进一步验证所提出方法的可行性,对基于Mach-Zehnder干涉的数字全息显微术进行了实验研究。如图4所示,我们采用He-Ne激光器(632.8 nm,HNLS 008 R,Thorlabs)作为相干照明,并采用像素尺寸为5.86 μm的探测器。为了产生物光波和参考光波,经过准直和扩束的激光被分束器分成两束。物光波通过由凸透镜、20×无限远校正显微物镜(RMS 20 X,0.4 NA,Olympus)和镜筒透镜组成的显微系统,最终在相机平面成像。镜筒透镜的焦距为75 mm。参考光束被4f系统(L1和L2)扩展,并在照相机平面中与物体光波干涉,生成全息图。

Fig.4. DHM示意图

4.2 定量相位靶的结果

首次使用定量相位显微镜靶来验证光学装置和算法。图5(a)中的全息图是由DHM获得的,其尺寸为4096 × 3076像素。图5(b)示出了全息图的频谱,并且将带通滤波器应用于该光谱以恢复样品的复振幅。由于样品为纯相位物体,图5(c)中仅显示了相位图像。在这种情况下,DHM的相位像中只出现了线性像差和球差。所述算法用于补偿相位图像中的相位畸变,图5(d)示出了由该算法拟合的相位畸变。通过从来自图5(e)中的DHM的相位值中减去像差掩模来补偿像差。相位分布清晰,没有多余的背景相位。USAF 1951的区域在图5(f)中用数字方法重新聚焦和放大。数字重聚焦是通过菲涅耳传播算法实现的,该算法可以将恢复的样本聚焦在不同的纵向平面上。

Fig.5. 定量相位显微镜目标的结果

4.3 静态样本中的结果

为了测试算法对不同像差的鲁棒性,我们记录了各种静态样本的全息图,包括切片肠、切片鱼鳃和切片鱼卵巢。为了验证在不同像差情况下的可行性,我们采用了10×(0.25NA)和20×(0.4NA)两种不同放大倍数的显微物镜。结果如图6所示,包括补偿前后的相位图像,以及2D包裹和3D解包裹像差。由于样品和光学系统的变化,在恢复的相位图像中,像差有很大的不同,包含了不同曲率的球面像差。除标准球差外,切片肠道和切片鱼鳃的相位图像中还存在高阶像差。尽管像差不均匀,但该方法在各种情况下仍能很好地工作。

并对鱼鳃片样品进行了不同方法的比较。在对频谱进行裁剪之后,用于像差补偿的图像的大小为800 × 800像素。该代码在配备2.90GHz CPU(Intel i7- 10700 F)和MATLAB的PC上运行,并且记录时间消耗。结果如图7所示,采用相位变化(PV)定量评价结果。

相位变化的值越小,相位的背景越均匀。可以看出,所提出的方法和Goldstein分支切割方法可以精确地补偿像差,但是所提出的方法的时间消耗远小于Goldstein分支切割方法。基于主成分分析和多重FFT的方法虽然计算速度快,但补偿效果很差。图8表示上述结果的背景定量值。与其他方法相比,该方法重建的背景更加均匀。总的来说,所提出的方法在速度计算和补偿结果方面综合优秀。

Fig.6. 不同样本的重建结果。由于装置的不同,像差也不同。最后一列显示了通过所提出的方法拟合的像差的3D表面图

Fig.7. 切片鱼鳃样品的不同方法比较,PV:相位变化。BC:Goldstein分支切割方法

Fig.8. 图7中横截面线中无像差相位的轮廓比较

5. 结论

本文提出了一种自动、鲁棒的DHM相差补偿方法。该方法既不需要背景分割,也不需要复杂的优化,实现了精确的拟合。相位解包裹采用了一种特殊的方法,即沿非连续路径的相位解包裹算法,通过对可靠度的排序和分组,实现了畸变相位的优先整体展开。精确的像差可以通过基于Zernike正交多项式的最小二乘拟合来近似。通过减去近似的像差,恢复出具有均匀背景和高对比度的真实相位分布。相比于其他方法,本文方法具有较高的精度和较短的计算时间。多样本仿真和实验结果验证了该方法的可行性和鲁棒性。我们将在后续的研究中进一步优化算法。





论文信息:

该论文以Efficient phase aberration compensation for digital holographic microscopy based on aberration-oriented phase unwrapping”为题在线发表在Optics Communications



本文第一作者为本实验室硕士吕文晋,通讯作者为本实验室负责人史祎诗教授。

   

Lyu, Wen**, and Yishi Shi. "Efficient phase aberration compensation for digital holographic microscopy based on aberration-oriented phase unwrapping." Optics Communications 554 (2024): 130212.



论文地址:
https://doi.org/10.1016/j.optcom.2023.130212

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