硬核生物信息学系列汇总

文摘   教育   2024-12-17 09:02   北京  

01

 R语言基础

Scientific Research

观观老师

手把手教你组学分析!


R语言 | 第1期. 听说你因为不会安装R包而放弃入门R语言?

R语言 | 第2期. 文件导入

R语言 | 第3期. 让你对自己的数据明明白白

R语言 | 第4期. 从原始数据到可视化结果,这个必会的技能你学会了吗

R语言 | 第5期. 你知道如何快速筛选你的变量和观测样本吗?

R语言 | 第6期. 变量修改大全

R语言 | 第7期. 数据合并大全

R语言 | 第8期. R语言绘图临门一脚

R语言 | 第9期. 汇总数据加速包

R语言 | 第10期. 字符串匹配,小菜一碟!

R语言 | 第11期. 字符串修改

R语言 | 第12期. 字符串排序、拼接和分割

R语言 | 第13期. apply家族入门应用

R语言 | 第14期. ggplot2初识

R语言 | 第15期. ggplot2柱状图系列

R语言 | 第16期. ggplot2气泡图系列

R语言 | 第17期. 让chatGPT教你ggplot2

R语言 | 第18期. 无代码ggplot2不香吗?

R语言 | 第19期. 无代码ggplot2不香吗?-第二弹
R包|第1期. 绪论
R包|第2期. 你真的了解Dotplot嘛?
R包|第3期. 单细胞上游!Cellranger包全解!





02

Bulk RNA测序

Scientific Research

Bulk RNA-seq | 第1期. 快2024年了,还有必要学习Bulk RNA-seq?
Bulk RNA-seq | 第2期. 零基础画主成分分析(PCA)图
Bulk RNA-seq | 第3期. 基因ID转换,一键搞定
Bulk RNA-seq | 第4期. 差异分析三巨头,该了解一下了

Bulk RNA-seq | 第5期. 关于热图,你所不知道的

Bulk RNA-seq | 第6期. 火山图,不是你想的那样

Bulk RNA-seq | 第7期. GO富集,我收藏了

Bulk RNA-seq | 第8期. KEGG富集,我收藏了

Bulk RNA-seq | 第9期. GSEA富集,不一样的富集分析

Bulk RNA-seq | 第10期. GSVA富集,给富集分析画一个句号




03

图解单细胞RNA测序

Scientific Research

解单细胞 | 第1期. UMAP或tSNE降维聚类(再不上车,你就真的错过了!)

图解单细胞 | 第2期. pseudo-bulk将scRNA-seq数据转化为bulk RNA-seq数据

图解单细胞 | 第3期. 惊!看完这篇,我竟学会了单细胞转录组测序组学最常见的热图

图解单细胞 | 第4期. 寻找疾病致病细胞或保护细胞,原来是用这种方法!

图解单细胞 | 第5期. 这种形似树枝的图到底怎么看

图解单细胞 | 第6期. 好不容易看懂了UMAP图,但为什么细胞上又有箭头了呢

图解单细胞 | 第7期. 圆圈和复杂的连线

图解单细胞 | 第8期. 富集分析里的MM豆,也能吃吗?

图解单细胞 | 第9期. 除了GO,KEGG,还能用什么富集分析?

图解单细胞 | 第10期. 单细胞分子层面分析——转录因子分析

图解单细胞 | 第11期. 单细胞研究思路?看完这篇你就明白

图解单细胞 | 第12期. 如何整合bulk RNA和scRNA数据?

图解单细胞 | 第13期. 单细胞WGCNA分析——hdWGCNA

图解单细胞 | 第14期. 单细胞联合GWAS分析




04

单细胞RNA测序数据分析

Scientific Research

单细胞测序 | 第1期. 单细胞测序:揭开生命奥秘的钥匙
单细胞测序 | 第2期. 下游数据质控知多少
单细胞测序 | 第3期. Seurat之PBMC分析标准化流程
单细胞测序 | 第4期. 写文章时需要用到的单细胞转录组测序原理
单细胞测序 | 第5期. 单细胞测序文件面面观
单细胞测序 | 第6期. 10X genomics 上游分析-cellranger介绍
单细胞测序 | 第7期. 10X genomics 上游分析-cellranger应用
单细胞测序 | 第8期. 一文打通单细胞测序研究思路
单细胞测序 | 第9期. Zenodo一个宝藏公共数据库和单细胞的不解之缘
单细胞测序 | 第10期. 生物信息学必须了解的数据库
单细胞测序 | 第11期. 不会还有人不知道这个免费一年的云服务吧!?
单细胞测序 | 第12期. 单细胞分析数据下载、导入和合并
单细胞组学 | 第13期. 单细胞测序中竟然存在双细胞?
单细胞组学 | 第14期. 想发单细胞测序文章?这一步必学!
单细胞组学 | 第15期. 一份强烈推荐收藏的细胞周期校正宝典!
单细胞组学 | 第16期. 不可不知的单细胞流程
单细胞组学|第17期. 找到Cluster的领头羊
单细胞组学|第18期. 单细胞注释不再是烦恼!
单细胞组学第19期. 单细胞数据分析的核心环节,必学!
单细胞组学 | 第20期. 美无极限——卷起来的UMAP图美化方案
单细胞组学 |  第21期. 点亮数据星空——Dotplot图绘制技巧揭秘
单细胞组学 |  第22期 单细胞转录组基础分析流程详解
单细胞组学 | 第23期. 单细胞数据分析的灵魂,学起来!
单细胞组学 | 第24期. 找到属于你的细胞亚群!
单细胞组学 |第25期. 单细胞亚群细分
单细胞组学|第26期. 一个函数搞定单细胞富集分析!

单细胞组学|第27期. 想发高分?干湿结合才是王炸!

单细胞组学 | 第28期. 拟时序分析,看这里!


单细胞思路 | 第1期 必学习的最常规的单细胞思路!
单细胞思路 | 第2期 单细胞中的资源库
单细胞思路 | 第3期 找到靶点分子后可以直接测序

 

05

代谢组学

Scientific Research

代谢组学 | 第1期. 2024年了,上车代谢组学还不晚

代谢组学 | 第2期. 关于代谢组学,你必须了解的事

代谢组学 | 第3期. 即将发车,快来学习代谢组学基本流程与技术

代谢组学 | 第4期. 快来学,一文掌握代谢组学上游分析

代谢组学 | 第5期. 代谢组学多元统计分析,你学会了吗

代谢组学 | 第6期. 富集分析,代谢组学也要有!

代谢组学 | 第7期. 图解代谢组学,有图有真相

代谢组学 | 第8期. 有图有真相,代谢组学图解之多组学进阶

代谢组学 | 第9期. 代谢组学升级到空间层面会发生什么

代谢组思路 | 第1期. 代谢组学基本思路——描绘图谱&寻找新药治疗靶点

代谢组思路 | 第2期. 代谢组学思路从基础到进阶——识别高危患者+预测预后

代谢组思路 | 第3期. 代谢组学思路进阶——预测预后



(更新于2024-12-16)


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编辑:静观
编审:静观

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