EHJ丨蛋白质组学立大功!揭秘小分子药物通过增加线粒体自噬改善心梗后不良心室重构机制

文摘   2024-12-06 20:30   北京  




研究概览

Study Overview

心肌梗死(MI)患者中约13%在出院后30天内发展为心力衰竭(HF)。线粒体损伤在该类型HF发病机制中发挥关键作用,避免损伤线粒体积累是预防心室不良重构的重要治疗策略。PINK1/Parkin通路介导的线粒体自噬是线粒体质控的重要通路,有证据表明增加线粒体自噬通量有心脏保护作用。然而,尽管被广泛研究,目前还没有可用于临床HF的线粒体自噬调节药物。



近日,美国雪松西奈医疗中心Jennifer Van Eyk教授团队在欧洲心脏杂志(EHJIF=37.6发表文章。发现MI后单次注射小分子Parkin激活药物PR-364能够有效改善生存率、心脏功能并延缓HF进展。本研究利用小鼠MI模型和细胞模型,通过代谢组学与蛋白组学相结合的方法揭示了PR-364显著增加了线粒体自噬和线粒体生物发生,改善了三羧酸循环、线粒体钙定位改变以及线粒体翻译重编程,证实了PR-364对线粒体代谢的促进和对心肌的保护作用。



—【研究摘要图】—




01

PR-364选择性激活心肌细胞Parkin并促进线粒体自噬

1.1 模型

H9c2细胞(大鼠心肌细胞)、AC16细胞(人类心肌细胞)

1.2 实验方法

Western blot(点击跳转观科研丨图解WB),siRNA转染,荧光显微成像,Seahorse线粒体应激测定,流式细胞术(点击跳转观科研丨图解流式),蛋白质组学,靶向代谢组学(点击跳转观科研丨代谢组学

1.3 研究结果

PR-364是一种由TR-FRET高通量筛选方法发现的小分子Parkin激活剂,选择性激活Parkin,且呈剂量依赖效应,而对其他E3泛素连接酶无激活作用(图1A-D)。随后作者在向心肌细胞分化的H9c2细胞系通过siRNA转染,发现抑制Parkin后即使应用PR-364,线粒体清除关键蛋白p62仍然显著降低,提示PR-364通过Parkin激活线粒体清除(图1E-F)。将细胞用PR-364处理后用巴佛洛霉素抑制自噬3h,利用组分分离WB证实了p62的线粒体易位显著升高,并通过线粒体自噬染料证实应用PR-364后线粒体自噬水平增加(图1H-J)。不仅如此,作者还发现PR-364作用后,线粒体生物发生标志物PGC-1α表达显著增加(图1K-O),提示PR-364同时调节线粒体自噬和生物发生。

图1. PR-364在体外选择性激活Parkin并促进 Parkin依赖性线粒体自噬

为了观察PR-364在人类心脏中的作用,作者使用PR-364处理AC16细胞(成人心室心肌细胞)6小时后进行了蛋白质组学和靶向代谢组学分析(图2A-C)。代谢组学数据的ClueGO通路分析显示,PR-364处理后,AC16细胞三羧酸循环中有五种代谢物丰度均增加,并且ATP水平升高>6倍,证实线粒体功能提升(图2D)。通过Seahorse检测同样证实PR-364增加了AC16细胞的基础呼吸、最大呼吸和ATP生产,改善线粒体功能(图2E)。使用发现蛋白质组学数据的ClueGO通路分析发现线粒体钙运输与线粒体蛋白翻译相关蛋白表达增加,(图2F-G)。

图2. PR-364上调代谢物和蛋白质表达,改善AC16细胞的线粒体呼吸和钙摄取


02

PR-364促进小鼠线粒体自噬并改善MI后心脏功能

1.1 模型

WT小鼠、MI小鼠模型(永久冠状动脉结扎, PCAL)

1.2 实验方法

Western blot,蛋白质组学,超声心动图,Parkin基因敲除小鼠点击跳转观科研丨基因敲除鼠),Masson染色点击跳转观科研丨图解病理染色

1.3 研究结果

为了研究PR-364的在体效应,作者对WT小鼠腹腔注射PR-3646h对心肌组织进行检测,发现心肌裂解物和线粒体组分中的自噬标志物LC3水平均显著升高,提示心肌细胞自噬激活(图3A-D)。随后作者构建了健康小鼠队列(n=4),给与PR-364处理并在6h时收集心肌组织蛋白。在sham小鼠中,PR-364显著改变心肌蛋白质谱(图3E-G),并显著增加翻译及多种线粒体蛋白的丰度(图3H-I)。

图3. PR-364在6小时内增加线粒体翻译和线粒体自噬


随后作者在为永久冠脉结扎(PCAL)后2h的小鼠单剂量腹腔注射PR-364 (1mg/kg),并观察28天(图4A)。与载体对照相比,给与PR-364显著改善MI小鼠28天生存率(图4B)和心脏重量(图4D)。此外,PR-364显著改善心脏大小(图4E)和射血分数,而在Parkin敲除鼠(PKO)中无此效应(图4F)。Masson染色显示PR-364显著改善MI28天的心肌瘢痕面积,提示PR-364改善了病理性心室重构(图4G)。


图4. PR-364通过维持心脏功能、防止心脏重构和降低MI后死亡发挥心肌保护作用


03

PR-364改善MI心脏早期的翻译重编程

1.1 模型

MI小鼠模型(永久冠状动脉结扎, PCAL)

1.2 实验方法

蛋白质组学

1.3 研究结果

作者发现MI队列中死亡小鼠多发生于PCAL3-7天(图4B),因此观察了第3天(死亡开始前)和第7天(存活小鼠)PR-364对心脏蛋白质组谱影响(图5A)。在7天队列中,PR-364处理组生存率为100%,而对照组为50%(图5B)。在3天队列中,共检测到904个蛋白质发生组间显著改变,而7天队列中发现1115种蛋白质发生显著变化(图5D)。

图5. PR-364可降低死亡率并导致PCAL后小鼠心脏的翻译重编程

作者认为载体组PCAL后发生差异表达,但PR-364恢复假手术组水平的蛋白质是生存关键蛋白,在3天队列中,符合该改变的蛋白有70种,而7天队列中发现287种。主成分分析发现PR-364/PCAL组于假手术组相近,而载体/PCAL组与其余三组有差异(图5E)。通过使用ClueGO分析PR-364/PCAL组和载体PCAL组之间的通路和细胞成分变化,发现3天组中通路改变有限,提示主要是由于急性MI效应主导的蛋白质组变化(图5F)。然而,7天组中发现多个通路在应用PR-364组上调,包括参与代谢和线粒体质控的蛋白(图5G-H)。


研究总结

损伤线粒体增加是MI后HF发生的重要机制,促进线粒体自噬被认为可减轻MI后缺血/再灌注损伤,然而缺乏通过该机制改善线粒体质控的药物。本研究通过心肌细胞模型和小鼠模型验证了候选小分子药物PR-364在促进线粒体质控的作用,并利用蛋白质组学证实了PR-364可诱导MI后心脏翻译重编程,改善MI后心脏的线粒体翻译与蛋白质谱,进而改善生存并预防心室不良重构,展现了PR-364的临床应用潜能。


参考文献

Ai L, de Freitas Germano J, Huang C, et al. Enhanced Parkin-mediated mitophagy mitigates adverse left ventricular remodelling after myocardial infarction: role of PR-364. Eur Heart J. Published online November 27, 2024. doi:10.1093/eurheartj/ehae782

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图文:往观

审核:定观

编辑:往观

编审:仓观


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