Huelsmann M, et al. (2024). A framework for understanding collective microbiome metabolism. Nature Microbiology, 9: 3097–3109.
(2024年11月26日发表)
摘要参考翻译:微生物组代谢是许多重要生态系统功能的基础。个体微生物组成员通常只对底物进行部分的分解代谢,或不表达生长所需的所有代谢功能。微生物组成员通过交换代谢中间体和细胞构件来互相补充,从而实现集体代谢。当前我们缺乏一个机制框架来解释为何微生物组成员采取部分代谢,以及这些代谢功能是如何在它们之间分配的。在这里,我们提出,蛋白质组效率的自然选择——即以最小的蛋白质投资完成基本的代谢通量——解释了微生物组成员的部分代谢,这也支撑了微生物组的集体代谢。以碳循环为例,我们讨论了集体代谢的模式、这些模式在何种条件下提高个体的蛋白质组效率,以及由此产生的代谢相互作用。总之,我们提出了一个机制框架,解释了集体代谢功能如何通过对个体的选择而产生。
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