O’Donnell RP, et al. (2024). Discordance Down Under: Combining phylogenomics & fungal symbioses to detangle difficult nodes in a diverse tribe of Australian terrestrial orchids. Systematic Biology, doi: 10.1093/sysbio/syae070.
（2024年12月7日发表）
摘要参考翻译：兰科菌根真菌（OMF）共生关系被认为是兰科多样化的主要驱动因素。在陆生兰科Diurideae族中，长期以来有假设认为OMF共生关系可能反映了兰花宿主之间的进化关系。考虑到近期的系统基因组学研究尚未完全解析Diurideae族下亚族的亲缘关系，我们旨在探讨兰花对OMF的偏好是否能为某些系统发育假说提供支持。首先，我们使用系统基因组学方法和贝叶斯分歧时间估算，构建了Diurideae族的属水平树。接着，我们整合了几十年来发表的真菌序列以及形态学/发芽数据，识别了属水平尺度上主要的真菌伙伴，并进行了祖先状态重建，估算了真菌共生变迁的进化轨迹。在整个族中，我们发现了源自不完全谱系分化的系统发育不一致。然而，我们的结果也揭示了该族中真菌共生前所未有的系统发育生态位保守性：整个属、亚族，甚至相关亚族群体仅与单一真菌科共生，这表明Diurideae族中的真菌共生偏好确实反映了兰花宿主之间的系统发育关系。此外，研究还表明了这些关系的演变方向，即从与多个真菌科的普遍联系发展到只与一个真菌科建立更特殊的伙伴关系。兰科共生偏好为一些长期存在系统发育不确定性的群体提供了新的见解。尽管存在复杂的进化历史，宿主-共生关系仍可用于帮助理顺替代的系统发育假说。
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