合成规划、反应产率管控及AI药物虚拟筛选与成药性评价

文摘   2025-01-08 09:05   北京  


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主办单位


会议介绍



各有关单位: 

过去几年里,以人工智能为代表的新技术的引入,通过利用 自然语言处理·、深度学习 、机器学习和图像识别等对传统的计算机辅助药物设计带来显著的效率提升,并极大地增加了研发成功的可能性。

AI药物虚拟筛选是一种借助人工智能技术,通过计算机模拟对大量候选分子进行筛选,从而找出具有潜在生物活性化合物的方法,这样可以减少实验筛选的工作量和成本,“数据+知识+AI”实现新靶标药物虚拟筛选,在药物虚拟筛选场景和先导化合物优化场景中,对训练未见的新靶标表现出良好的泛化性能,可解释性分析还为基于结构药物设计提供了有价值的线索。AI成药性评价是利用人工智能技术对药物的成药性质进行评估的方法。它可以对化合物分子的吸收(Absorption)、分布(Distribution)、代谢(Metabolism)、排泄(Excretion)、毒性(Toxicity),即ADMET等方面进行预测,从而大幅提高研发效率,实现项目快速推进。为帮助业内深度学习掌握AI在药物筛选及成药性评价中技术实现及应用我单位将于2025年3月13日-15日在南京市举办“合成规划、反应产率管控及AI药物虚拟筛选与成药性评价专题培训班”,详细通知如下:


会议安排

 

会议地点:南京市(具体地点通知给已报名人员)

会议时间:2025313 -15 13日全天报道)


课程大纲-主讲老师










3月14日 第一天:9:00-16:30

有机合成规划及应用(陈从喜博士)

1.化合物及合成化学

1.1稳定分子:单质与化合物

1.2无机化合物与有机化合物

1.3有机分子结构:平面与立体

1.4构效关系:结构与性能

1.5有机合成:分子积木游戏,创造神奇多样的世界

2.有机合成规划及策略

2.1目标分子与获得策略

2.1.1 天然产物提取

2.1.2 天然产物衍生化

2.1.3 化工原料多步合成

2.2半合成:基于天然产物

2.2.1 来自植物细胞提取物衍生合成

2.2.2 来自动物的天然产物衍生合成

2.2.3 来自微生物代谢产物的衍生合成

2.3全合成:汇聚式合成优势

2.3.1 逆合成分析

2.3.2 保护基团及脱保护策略

2.4集大成者:合成生物学

2.4.1 合成生物学的概念

2.4.2 合成生物学的优势

2.4.3 合成生物学的局限性

3.有机合成类型

3.1主要反应类型

3.1.1 氧化还原

3.1.2 取代反应

3.1.3 加成反应

3.1.4 有机酸及其衍生化反应

3.1.5 其他反应

3.2 案例分析:多种反应类型的综合应用

4.有机合成应用

4.1设计反应路线

4.2确定合理反应条件

4.3反应过程跟踪

4.3.1薄板层析(TLC)

4.3.2高效液相(HPLC)及质谱联用(LC-MS)

4.3.3气相(GC)及质谱联用(GC-MS)

4.4 反应的终止及后处理

4.5 产品的分离、纯化、表征、鉴定

反应产率管控策略(陈从喜博士)

1.反应产率、转化率、原子经济性

1.1反应产率、不对称反应产率

1.2转化率

1.3总收率

2.产率不理想的原因及对策

2.1从反应机制机理上考虑

2.2案例

2.3从副产物副反应上考虑

2.4案例

2.5从温度光照等反应条件上考虑

2.6案例

2.7从催化剂角度考虑

2.8案例

2.9从后处理及纯化上考察

2.10案例

3.巧妙短路线是提高产率的根本

3.1百分率乘数效应

3.2如何设计短路线

3.2.1善用已有工业化中间体

3.2.2巧用天然产物片段

3.2.3利用自然的力量:合成生物学

3.3举例

4、合成化学相关工具

4.1 Reaxys(www.reaxys.com)、SciFinder等外文数据库

4.2 学术谷歌、百度、chemicalbook等网站


3月15日 第二天 9:00-16:30

AI药物虚拟筛选( 王博士)

5.虚拟筛选的相关概念

5.1虚拟筛选的定义与目标

5.2虚拟筛选方法的分类

5.3虚拟筛选的评价指标

6.靶标-药物互作与人工智能基础

6.1药物发挥活性的结构基础

6.2分子力场

6.3人工智能基本原理

7.基于配体的虚拟筛选

7.1定量构效关系(QSAR)的基本概念

7.2分子表征概述

2.1 SMILES字符表征

2.2 分子指纹

2.3 理化性质描述符

2.4 2D图表征

2.5 分子构象与3D表征

7.3基于机器学习的分子性质预测

7.4基于人工智能的分子性质预测

案例分析:基于DeepChem的活性分子虚拟筛选

8.基于结构的虚拟筛选

1分子对接的基本原理与结构文件

2常用对接软件介绍

3对接基本步骤

蛋白准备

配体准备

分子对接与对接后分析

4AI重打分

基于序列的虚拟筛选

案例分析:基于AutoDock的活性分子虚拟筛选

9. AI药物虚拟筛选常用数据库介绍

1 化合物商品库

2 分子活性数据库

3 蛋白序列与结构数据库

AI成药性评价(上海药物所 李叙潼博士)

10成药性的相关概念

ADMET研究在药物研发中的意义

人工智能ADMET预测概览

11ADMET评价中的人工智能预测方法

如何应用开源的ADMET预测方法

如何构建自己的预测模型

案例:不确定性估计和可解释性模型

案例:主动学习用于生物口服利用度预测

12生成具有理想成药性的药物分子

生成式人工智能

多目标优化

案例:生成兼具靶标亲和力和良好血脑屏障通透性的分子


讲课老师介绍:

陈从喜博士 北京颖诺凯胜科技有限公司&分子树(北京)科技产业有限公司,任董事总经理兼首席科学官,主要从事生物医药、新材料、资源高值化利用等功能分子领域的新分子设计、工艺创新开发、绿色产业化等,解决分子科技领域关键工艺及产业化应用、建立分子库和项目库,实现分子科技重大成果产业化应用及产业链增值。二十年新型药物结构单元的设计、合成研究及技术管理经验。


王博士 博士毕业于中国科学院上海药物研究所,获理学博士学位,研究方向聚焦于面向药物设计需求的人工智能技术开发与基础理论研究,主要包括基于图神经网络与多模态表征技术的分子性质预测、蛋白-配体互作关系预测与代谢性质预测等。

李叙潼博士   中科院上海药物所副研究员,究聚焦于基于人工智能的药物设计方法学研究,进行基于靶标、表型、成药性的药物设计算法开发,系统性解决活性化合物发现和结构优化问题、药物作用机制和临床药效问题、药物代谢和安全性问题,以助力新型药物的研发。近五年来在Nucleic Acids Res、Nat Commun、Acta Pharm Sin B、Nat Comput Sci等SCI期刊发表通讯或一作论文20余篇(含共同)。 

  

会议说明

1、理论讲解,实例分析,专题讲授,互动答疑

2、主讲嘉宾均为行业内资深专家,欢迎来电咨询

3、企业需要内训和指导,请与会务组联系


会议费用

  

会务费:3000/31日前报名且汇款,优惠至2500/人;报名三人及三人以上,优惠至2000/

(会务费包括:培训、资料、茶歇培训期间中餐、等);



会议咨询

  

    

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会务组咨询:梁 红 

13241056626(同微信)

QQ咨询 2672283518  

电子邮箱:yiyaolianghong@163.com


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