微生物组学科研生态构建：方法开发、功能挖掘和科学传播
刘永鑫 研究员
中国农科院基因组所
刘永鑫，中国农科院基因组所研究员，微生物组与营养健康团队首席，iMeta执行主编，宏基因组公众号创始人。聚焦微生物组方法开发、功能挖掘和科学传播，在Nature Biotechnology、Nature Microbiology等发表论文80余篇，被引21000+次，连续入选2022/2023年度全球前2%顶尖科学家。开发了培养组(Nature Protocols, 2021)、扩增子(iMeta, 2023)、宏基因组等分析流程(Protein Cell, 2021; GPB, 2023)，数据可视化平台和网络分析R包(iMeta, 2022a/b)，为本领域提供了系统的分析环境。发现了宿主基因介导根系菌群参与氮利用(NBT, 2019)和挖掘抗赤霉病的生防菌(NM, 2022)，推动了菌群在植物营养与健康研究中的发展。主持国自然青年/面上/区域联合子课题、中科院、农科院、深圳市等项目。兼任中国微生物学会微生物组专委会、中国生物信息学会计算合成生物学专委会委员。创办宏基因组公众号，17万+同行关注，累计阅读量超6千万。主编《微生物组实验手册》专著，由300多位同行共同编写且长期更新的百科全书。发起iMeta期刊，影响因子23.7，位列微生物学科研究类期刊全球排名第一，填补亚太地区本领域高水平期刊空白，助力华人主导的国际学术话语权体系建立。兼职为Nature Communications、Nucleic Acids Research、Microbiome等90种期刊审稿260次。
宏基因组技术改变了人们认识世界的方式，使我们可以全面揭示生活在人、动物、植物和环境中微生物组的全貌和潜在功能。刘永鑫团队聚焦微生物组方法开发、功能挖掘和科学传播。在方法开发方面，我们相继开发了培养组(Culturome, Nature Protocols, 2021)、扩增子(EasyAmplicon, iMeta, 2023)、宏基因组(EasyMetagenome)、多组学(Wekemo, iMeta, 2024)、可视化(ImageGP 1/2, iMeta, 2022/2024)平台和网络分析R包ggClusterNet。在功能研究方面，发现了萜类化合物对菌群的调控规律(Science, 2019)、宿主关键基因介导根系菌群参与氮利用(Nature Biotechnology, 2019)和菌群中抗赤霉病生防菌挖掘和作用机制 (Nature Microbiology, 2022)。在科学传播方向，创办《宏基因组》公众号，分享本领域研究方法、成果解读博文3400+篇，阅读量6千万次；主编《微生物组实验手册》专著，打造本领域研究方法的参考百科全书；发起微生物组和生物信息交叉期刊《iMeta》，IF 23.7位列微生物学科研究类期刊全球第一。
报告时间：2024年10月30日 星期三 9:00-11:30
会议地址：黑龙江大学生命科学学院315会议室
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1卷1期
1卷2期
1卷3期
1卷4期
2卷1期
2卷2期
2卷3期
2卷4期
3卷1期
2卷2期封底
2卷4期封底
3卷2期
3卷3期
3卷3期封底
3卷4期
3卷4期封底
1卷1期
“iMeta” 是由威立、肠菌分会和本领域数百千华人科学家合作出版的开放获取期刊，主编由中科院微生物所刘双江研究员和荷兰格罗宁根大学傅静远教授担任。目的是发表所有领域高影响力的研究、方法和综述，重点关注微生物组、生物信息、大数据和多组学等。目标是发表前10%(IF > 20)的高影响力论文。期刊特色包括视频投稿、可重复分析、图片打磨、青年编委、前3年免出版费、50万用户的社交媒体宣传等。2022年2月正式创刊发行！发行后相继被Google Scholar、ESCI、PubMed、DOAJ、Scopus等数据库收录！2024年6月获得首个影响因子23.7，位列全球SCI期刊前千分之五(107/21848)，微生物学科2/161，仅低于Nature Reviews，同学科研究类期刊全球第一，中国大陆11/514！
“iMetaOmics” 是“iMeta” 子刊，主编由中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员和香港中文大学于君教授担任，是定位IF>10的高水平综合期刊，欢迎投稿！
iMeta主页：
http://www.imeta.science
姊妹刊iMetaOmics主页：
http://www.imeta.science/imetaomics/
出版社iMeta主页：
https://onlinelibrary.wiley.com/journal/2770596x
出版社iMetaOmics主页：
https://onlinelibrary.wiley.com/journal/29969514
iMeta投稿：
https://wiley.atyponrex.com/journal/IMT2
iMetaOmics投稿：
https://wiley.atyponrex.com/journal/IMO2
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