生命科学
Life science
在世界范围内，实施和评估基因组测序（GS）作为新生儿和婴儿筛查工具的努力正在扩大。BabySeq项目的第一次迭代（2015-2019）是一项新生儿测序的随机对照试验，在医学、行为和经济结果方面提供了新的证据。BabySeq的第二次迭代于2023年1月开始招募参与者，从美国几个地区的儿科诊所招募了500多名1岁以下的婴儿，在更大、更多样化的队列中研究了GS的结果。试验的目标是最终纳入50%以上自认为是黑人/非裔美国人或西班牙裔/拉丁裔的家庭，试验设计的关键方面是与社区咨询委员会共同制定的。所有登记的家庭都将获得遗传咨询和家族史报告。2024年10月3日，该研究成果以“The BabySeq Project: A clinical trial of genome sequencing in a diverse cohort of infants”为题，发表在Cell Press细胞出版社期刊American Journal of Human Genetics上。
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使用基因组测序（GS）作为一种筛查工具来识别生命早期的遗传疾病风险在全世界范围内引起越来越多的关注。婴幼儿基因组测序（BabySeq）项目是一项全新的随机对照试验（RCT），该研究的第一阶段在2015年至2019年间进行，参与者主要是白人家庭，且社会经济地位较高。虽然该阶段为基因组测序的可行性提供了重要数据，但由于样本群体的单一性，其结果的普适性受限。因此，研究团队启动了第二阶段，计划在更广泛和多样化的群体中展开试验。这一新阶段的目标是招募超过500名婴儿，且一半以上的婴儿来自非裔美国人和西班牙裔/拉丁裔家庭。这不仅能扩展数据的多样性，还能够更深入地了解基因组测序在不同文化、社会背景中的接受度与应用效果。
第二阶段的BabySeq项目仍然采用随机对照试验的设计，参与的婴儿随机分为两组：一组接受基因组测序，另一组仅接受详细的家族病史评估。所有参与者的父母都将接受专业的遗传咨询，并获得关于家族病史的报告。接受基因组测序的婴儿会通过测序分析超过4300个与儿童期和可操作成人期疾病相关的基因，这些基因与孟德尔遗传病的风险以及携带者状态密切相关。研究报告将包括婴儿与疾病相关的基因变异信息、携带者状态以及大型染色体拷贝数变异等（图1）。
图1 BabySeq项目研究流程。
在研究设计中，研究团队特别重视社区的参与和反馈，成立了社区顾问委员会（CAB），成员包括少数族裔的家长、社区领袖和临床医生。委员会不仅参与了研究设计的决策过程，还在婴儿招募、家长访谈、知情同意和结果报告的设计中提出了重要建议。通过这种深入的社区参与，研究不仅能够更好地满足少数族裔群体的需求，还能够减轻因基因研究而产生的潜在不信任感，尤其是针对那些曾经受到不公平医疗待遇的群体。
基因组测序技术在医学上有着极大的潜力，可以在疾病发生之前预测个体的遗传风险。然而，关于这种技术在婴儿期广泛应用的心理、社会和经济影响，仍然缺乏充分的研究。因此，BabySeq项目不仅关注基因测序的医学效益，还深入探讨了其对父母和家庭的心理社会影响。研究设计了纵向的家长调查，以评估基因测序对亲子关系、夫妻关系以及父母个人心理状态的影响。研究假设，接受基因组测序的父母不会经历比未接受测序的父母更多的心理负担。通过这一系列的调查，研究团队希望能够全面了解基因测序对家庭生活的影响，尤其是在心理健康和家庭关系方面的潜在效益和风险。
此外，研究还对基因组测序带来的经济影响进行了探索性分析，特别是其对医疗资源的利用和相关费用的影响。基因测序可能会引发一系列后续的医学干预和测试，因此需要明确其对整个医疗体系的经济负担。通过对参与者的电子病历和行政数据进行分析，研究将量化由于基因组测序引发的医疗干预及其相关成本。虽然这些经济分析可能无法在短期内得出明确的结果，但它们对于未来基因筛查项目的设计和实施具有重要的政策参考价值。
BabySeq项目的第二阶段通过将基因组测序应用于更多样化的婴儿群体，探索其在新生儿筛查中的广泛应用潜力。这不仅有助于揭示不同人种和族裔婴儿中孟德尔遗传病风险的流行情况，还能够为未来基因筛查计划提供更加准确和全面的医学、心理社会以及经济数据支持。项目的研究结果将为公共卫生项目的设计提供重要的依据，帮助实现基因筛查技术的广泛应用，使其惠及更多群体，并尽量减少潜在的医疗风险和社会不公。
通过这项研究，BabySeq项目不仅在科学技术层面上推进了基因组测序在婴儿筛查中的应用，还通过多方合作、社区参与和多样化群体的纳入，促进了基因科学在公共卫生领域的平等性和可及性。这一项目的研究成果有望为全球范围内的基因筛查计划提供借鉴，帮助构建更加公正和可持续的基因医疗体系。
相关论文信息
论文原文刊载于Cell Press细胞出版社旗下期刊American Journal of Human Genetics，点击“阅读原文”或扫描下方二维码查看论文
▌论文标题：
The BabySeq Project: A clinical trial of genome sequencing in a diverse cohort of infants
▌论文网址：
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0002929724002970
▌DOI：
https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2024.08.011
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