微生物组研究揭示了微生物群落的组成特征和多样性,以及微生物与宿主、环境的相互作用。宏基因组学由Handelsman和Rodon于1998年首次提出,mNGS在《高通量宏基因组测序技术检测病原微生物的临床应用规范化专家共识》中得到精准定义。凭借其多、快、好、省的优势广泛应用于医学领域的病原微生物检测,并逐渐扩展至农业动植物研究、工业食品检测和环境能源等领域。
医学领域的宏基因组
mNGS技术通过测序分析临床样本中的微生物和宿主核酸,可无偏检测多种病原体,已从呼吸道感染筛查拓展至神经系统、胃肠道、生殖系统感染等领域,并应用于微生物组、耐药性、人类基因表达及肿瘤研究。未来,mNGS将在患者治疗和公共健康中发挥更大作用。
用于病原体发现的宏基因组学
宏基因组高通量测序技术通过对临床样本中微生物和宿主核酸的测序分析,可以无偏倚地检测多种病原微生物,正广泛应用于临床感染性疾病病原检测。
公共卫生的传统病原体监测
科研领域的宏基因组
mNGS技术通过测序分析临床样本中的微生物和宿主核酸,可无偏检测多种病原体,已从呼吸道感染筛查拓展至神经系统、胃肠道、生殖系统感染等领域,并应用于微生物组、耐药性、人类基因表达及肿瘤研究。未来,mNGS将在患者治疗和公共健康中发挥更大作用。
肠道微生物研究
宏基因组学分析可全面揭示人体肠道微生物的多样性及其在消化、免疫、代谢等生理活动中的功能,帮助研究人员探索微生物与人体的相互作用及其对健康的影响。通过分析肠道微生物组的变化,可以更好地理解其与疾病的关系,如肥胖、糖尿病和炎症性肠病。调整微生物群可能有助于疾病改善,未来甚至可用于癌症筛查。目前,宏基因组学和代谢组学已揭示结直肠癌中肠道微生物群的阶段性特异性表型。
环境微生物多样性研究
农业/动物疫病检测宏基因组
mNGS技术通过测序分析临床样本中的微生物和宿主核酸,可无偏检测多种病原体,已从呼吸道感染筛查拓展至神经系统、胃肠道、生殖系统感染等领域,并应用于微生物组、耐药性、人类基因表达及肿瘤研究。未来,mNGS将在患者治疗和公共健康中发挥更大作用。
农业生产领域
宏基因组学可揭示农业活动和土壤管理对微生物群落结构与功能的影响,解析作物与土壤微生物(如根际微生物、共生菌根)间的互作,分析病害相关微生物,为病害监测和防控提供支持。
多病原检测、不明原因动物疫病检测
宏基因组学可解析动物消化道、养殖环境及废水、粪便中微生物结构与功能,揭示其在养殖系统中的机制,以提升营养利用、促进生长,并支持养殖污染控制和粪便无害化处理。同时可定向检测动物携带的病原体。动物病原宏基因组测序采用DNA/RNA共建库策略,应用于检测、流调和特定病原研究。
食品微生物溯源和生产环境监控
宏基因组建库相关产品选择指南
应用方向 | 产品名称 | 货号 | 备注 |
提取试剂盒 | MolPure® Magnetic Pathogen DNA/RNA Kit | 18306ES | DNA&RNA共提取 |
临检病原宏基因组方向(测序类型SE75或SE50) | Hieff NGS® OnePot Flash DNA Library Prep Kit | 12316ES | 病原DNA检测 |
Hieff NGS® ds-cDNA Synthesis Kit | 13488ES | DNA&RNA共检测 | |
Hieff NGS® OnePot Flash DNA Library Prep Kit | 12316ES | ||
Hieff NGS® One-Step rRNA Removal Kit(Human) | 12258ES | ||
动物疫检宏基因组方向(测序类型:PE150或SE100) | Hieff NGS® ds-cDNA Synthesis Kit | 13488ES | DNA&RNA共检测 |
Hieff NGS® C37P4 OnePot cDNA&gDNA Library Prep Kit | 13502ES | ||
环境宏基因组、食品微生物等其他领域检测(测序类型PE150) | Hieff NGS® OnePot Pro DNA Library Prep Kit V4 一步法DNA酶切建库试剂盒V4 | 12972ES | DNA检测 |
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供稿:海小星
投稿邮箱:tougao@caivd-org.cn
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