Seethepalli A, et al. (2024). Divide and conquer: using RhizoVision Explorer to aggregate data from multiple root scans using image concatenation and statistical methods. New Phytologist, doi: 10.1111/nph.20151.
（2024年10月6日发表）
摘要参考翻译：在农业和自然系统中，根对于确定植物生产力和土壤碳输入量非常重要。有时，一个样本中的根的数量太多，无法容纳在一张扫描图像中，因此样本要分几次扫描，而目前还没有汇总数据的标准方法。本文介绍并验证了在多个扫描中进行标准化测量的两种方法：图像拼接（image concatenation）和统计聚合（statistical aggregation）。我们开发了一个Python脚本，它能识别哪些图像属于同一个样本，并返回一个更大的合并图像。我们使用免费开源软件RhizoVision Explorer处理这些合并图像和原始图像。我们还开发了一个R脚本，可识别属于同一样本的数据行，并应用正确的统计方法返回每个样本的单一数据行。我们使用来自北方泥炭地和北极地区的柳枝稷（switchgrass）、杨树（poplar）以及各种乔木和杜鹃花科灌木的示例图像对这两种方法进行了比较。除了中位直径（median diameter）无法通过统计聚合准确计算外，这两种方法的大多数根部测量结果几乎相同。我们相信这些方法的可用性将对研究根生物学有所帮助。
图像拼接和分析的总体流程
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