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样本量爆棚?分析深度加码?选对服务器,省心科研无忧!
学术
2024-10-22 19:00
上海
嘿,聊到服务器配置,要是自个儿在实验室买,要记得选那种“高配款”,不然通过设备科升级,那可有的折腾了。未雨绸缪,留点缓冲空间总是明智的。不过嘛,若你在咱们这租个在线服务器,那就轻松多了,开个账户,售后群里喊一嗓子,今天说明天就能用上,跟变魔术似的。
再说宏基因组测序,样本不多时,64线程配256G内存的服务器就游刃有余。但要是样本超过30个,嘿,你就需要提升到96线程,512G内存了。为啥?因为宏基因组测序是个内存大户,组装、去冗余那会儿,算力需求蹭蹭涨,分析复杂度也跟着飙升,需要的软件和数据库支持一个都不能少。
来看看单细胞分析。基础操作,比如读取数据、质控啥的,一个样本大概1万个细胞,占2G内存。样本少于30个的话,72线程配256G内存就够了。不过,如果你想玩深度分析,比如伪时序分析,那内存至少得跳到512G起。
最后说说孟德尔分析,像是代谢物、肠道菌群、免疫细胞、炎症因子、药靶这些研究,256G内存的服务器就能应对自如。但如果数据量爆棚,超过5T,那还是建议直接上512G内存吧。
总而言之,挑服务器就像挑鞋子,得合脚!样本多、分析深,内存就得跟上节奏。
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问:服务器常用软件都有什么?
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