Hortic Res | 中国热科院南亚所在无患子科染色体可视化研究方面取得新进展

科技   三农   2025-01-03 09:00   江苏  

『点击免费订阅《园艺研究》电子刊』

Oligo-FISH(寡聚核苷酸荧光原位杂交)在植物研究中具有重要意义。它能够精确地定位特定基因特定序列,揭示基因组结构、染色体重排及空间分布。尤其在作物基因组学中,Oligo-FISH有助于研究染色体构成、重组,结构变异等。此外,Oligo-FISH是为基因定位、遗传图谱构建及育种研究的重要工具。同时,它也可用于研究植物的染色体演化和物种间的比较基因组学。


2024年9月,Horticulture Research上线了(Advance Access)中国热科院南亚所荔枝龙眼课题组题为A cost-effective oligo-based barcode system for chromosome identification in longan and lychee的研究论文


该研究报道了一种经济高效的寡核苷酸文库合成系统,相比之前的寡核苷酸池(oligo pool)合成方法而言,能够降低一半的成本。并且这种方法可以适用于不同物种,为其它植物物种的细胞遗传学研究提供了新的思路。


图 经济高效的寡核苷酸文库合成系统


本研究以无患子科龙眼和荔枝为材料,开发了一种经济高效的oligo文库合成方法。该方法通过将每个特异50nt的寡核苷酸序列相邻配对,生成单个100nt的混合oligo序列。通过嵌合引物接头与多重PCR扩增,成功扩增36个特异的染色体区域信号,并识别龙眼和荔枝的所有15条染色体。此外,本研究揭示了35S rDNA在个别染色体上的精确位置,并识别出龙眼和荔枝基因组中35S rDNA位点组装位置错误。这种经济高效的寡核苷酸条形码系统显著降低了oligo合成成本,相比之前的寡核苷酸池(oligo pool)合成成本减少了一半,为不同植物物种的细胞遗传学研究提供了宝贵的资源。


闽江学院地理与海洋学院黄永吉博士,广西大学农学院余凡助理教授和中国热带农业科学院南亚热带作物研究所周建男博士为论文共同通讯作者。本研究获得海南省自然科学基金青年基金项目(320QN322)、中国热科院南亚所青年专项启动基金、中国博士后科学基金(2022MD723761)的资助。


文章链接:

https://doi.org/10.1093/hr/uhae278


——点击阅读推荐文章——

Genomic diversity, population structure, and genome-wide association reveal genetic differentiation and trait improvements in mango 

https://doi.org/10.1093/h‍r/uhae153

Hortic Res | 南亚所芒果研究室在芒果资源群体遗传分化和重要性状遗传改良研究上取得进展


A chromosome-level genome assembly of Agave hybrid NO.11648 provides insights into the CAM photosynthesis
https://doi.org/10.1093/hr/uhad269‍
Hortic Res | 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所剑麻研究团队在龙舌兰亚科基因组及CAM进化机制上取得进展


加入作者交流群

扫码添加小编微信,拉你进入《园艺研究》作者交流群,群内不定期开展主编答疑会、作者分享会、审稿人培训会等高质量活动。



备注“姓名+单位+HR”

进入作者交流群

About Horticulture Research

《园艺研究(英文)》Horticulture Research)是由南京农业大学主办的学术期刊,主要刊载园艺作物的基础和理论研究,包括遗传学、育种、组学和演化、园艺作物的起源及驯化、生物技术、生物化学、生理学和细胞与分子生物学,环境互作生物学等。科睿唯安JCR2023影响因子:7.6,位于园艺一区(第2/38名),植物科学一区(第13/265名),遗传学一区(第14/191名)。2023年中科院期刊分区:位于园艺小类一区,植物科学小类一区,遗传学小类一区,农林科学大类一区(Top期刊)。入选中国科技期刊卓越行动计划二期英文领军期刊。

南京农业大学英文期刊




点击关注Horticulture Research

欢迎转载,留言开白。


特邀作者:周建男
编辑排版:王平、赵紫馨(实习)
审核:尹欢、孔敏

点击下方“阅读原文查看文章原文

园艺研究
《园艺研究》(Horticulture Research)是南京农业大学主办的英文学术期刊,采用开放获取形式,专注刊载和园艺作物有关,能引起广泛的国际和学科兴趣的基础和理论研究。
 最新文章