近期发表于Genome Medicine 的一篇文章通过基因组学的方法研究了澳大利亚的产广谱β-内酰胺酶（ESBLs）肠杆菌的分子流行病学特征和传播情况。该研究收集了澳大利亚多家医院2012年至2016年期间的临床分离株，这些分离株来自医院内感染的患者。通过二代+三代测序结合，首先表征了数据集中的携带ESBL质粒的类型；其次通过质粒的核酸序列的相似性以及质粒上基因成分的相似性，将ESBL质粒分成了多个家族，发现A家族的质粒在肺炎克雷伯菌中分布最广，并且在整个研究阶段均有检出（图1）。
然而其他质粒并不像A质粒一样表现出了明显的传播迹象。研究者结合临床数据以及单核苷酸差异分析发现，进一步确认了A质粒的传播是院内ESBLs扩散的主要原因。通过与公共数据库比对，研究者发现Plasmid A与全球传播的肺炎克雷伯菌ST307克隆中的IncFIB/IncFII blaCTX-M-15质粒非常相似。为进一步论证发现，研究者还收集了2017年至2020年期间的产ESBLs肺炎克雷伯菌分离株，通过基因组测序发现，A质粒在这一段的分离株中占比也非常高（图2）。图2：A质粒在2017-2020年间肺炎克雷伯菌中的分布（带颜色的柱子表明A质粒的数量）研究表明该质粒在随后的几年里依旧是院内ESBL传播的主要载体。产ESBLs肠杆菌在医院环境中广泛传播，质粒在传播过程中起到了重要的作用。这些研究结果对于制定感染控制策略和预防抗生素耐药性的传播具有重要意义。肠杆菌科细菌可携带产ESBLs基因的优势质粒，容易引起院内感染广泛传播，应予以重视。
原文链接
https://doi.org/10.1186/s13073-022-01103-0
参考文献：
Hawkey J, Genome Med. 2022;14(1):97.
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