表1 多组学分析所需的生物样本含量
Integral-Omics™ 微量样本多组学解决方案
产品特色
连续提取带来灵活且高效的微量多组学分析
我们在液氮环境下将原始组织研磨成粉末,每 10 mg 分装在一个EP管中,进行后续的提取实验,保证了多组学样本来源的均一性,避免将一块组织一分为六所导致的各组学样本来源异质性问题。
☆ 微量
可随机挑选6种以内的组学自由搭配,如蛋白+转录+代谢三组学,满足客户个性化多组学所需。
技术路线
连续提取策略
西湖欧米 Integral-Omics™ 采用了改良的双相萃取技术(MTBE/甲醇/DEPC水),随后通过温和的冰浴超声处理以释放生物分子,并进行连续提取。
图2 微量样本提取策略
实测数据
西湖欧米 Integral-Omics™ 实测数据
表2 小鼠肝脏组织 Integral-Omics™ 实测结果(10 mg组织/样)
科研论文
Integral-Omics™ 在临床样本中的应用
期刊:Analytical Chemistry
样本类型:六位结直肠癌(CRC)患者的肿瘤组织和配对正常邻近组织(NATs)
研究结果:研究人员共鉴定到1116 种代谢物,1920 种脂质,9257 个蛋白质,132537 个肽段和 40107 个磷酸化位点。转录组RIN/RQN 值在4.0到7.6之间,稍低于小鼠肝脏样本 ,这可能是因为临床样本采样和储存的复杂性。
西湖欧米现已推出 Intergral-Omics™ 科研服务,助力广大科研人员微量样本多组学分析,各位老师若感兴趣,欢迎垂询。
• 样本类型:对照(健康)组(n=28)、疑似但实为普通流感组(n=25)、新冠感染轻症组(n=37)、新冠感染重症组(n=28),血清样本
• 研究方法:TMT蛋白组,靶向蛋白组;非靶代谢组,靶向代谢组
Immunity|Multi-omics blood atlas reveals unique features of immune and platelet responses to SARS-CoV-2 Omicron breakthrough infection [6],多组学研究揭示新冠Omicron感染者的血液 “生态系统”
项目案例3
Cell Discovery|Integrated proteogenomic characterization of medullary thyroid carcinoma [7],甲状腺髓样癌的综合蛋白质基因组特征
项目案例4
MedComm|Integrated transcriptomics, proteomics, and functional analysis to characterize the tissue-specific small extracellular vesicle network of breast cancer [8],乳腺癌组织特异性小细胞外囊泡的转录组学、蛋白质组学和功能分析
• 样本类型:乳腺癌组织、正常乳腺组织和外周血标本;提取sEVs
参考文献
1. Ghaffari, S., et al., An integrated multi-omics approach to identify regulatory mechanisms in cancer metastatic processes. Genome Biology, 2021. 22(1).
2. Hasin, Y., M. Seldin, and A. Lusis, Multi-omics approaches to disease. Genome Biology, 2017. 18(1).
3. Mun, D.-G., et al., Proteogenomic Characterization of Human Early-Onset Gastric Cancer. Cancer Cell, 2019. 35(1): p. 111-124.e10.
4. Li, W., et al., Integral-Omics: Serial Extraction and Profiling of Metabolome, Lipidome, Genome, Transcriptome, Whole Proteome and Phosphoproteome Using Biopsy Tissue. Analytical Chemistry, 2025.
5. Shen, B., et al., Proteomic and Metabolomic Characterization of COVID-19 Patient Sera. Cell, 2020. 182(1): p. 59-72.e15.
6. Wang, H., et al., Multi-omics blood atlas reveals unique features of immune and platelet responses to SARS-CoV-2 Omicron breakthrough infection. Immunity, 2023. 56(6): p. 1410-1428.e8.
7. Shi, X., et al., Integrated proteogenomic characterization of medullary thyroid carcinoma. Cell Discovery, 2022. 8(1).
8. Shen, L., et al., Integrated transcriptomics, proteomics, and functional analysis to characterize the tissue‐specific small extracellular vesicle network of breast cancer. MedComm, 2023. 4(6).
西湖欧米是一家专注于AI赋能的微观世界数据公司,致力于多组学驱动的精准医学的转化落地,目前专注于基于蛋白质谱技术的疾病生物标记物IVD试剂盒的开发。
联 系 我 们
service@westlakeomics.com
扫描下方二维码
点击阅读原文,访问西湖欧米官网。