药物计算系列培训第五期|基于配体的分子性质预测与筛选:定量构效关系模型

文摘   科学   2024-11-28 18:18   中国  




本系列讲座围绕着计算模拟和 AI 技术在药物设计流程中的应用,以及相关的算法原理介绍展开,旨在帮助有药物计算需求的科研人员快速入门 AI for Life Science 领域。

在前期的培训中,我们主要针对常见的基于结构的药物设计方法(如:Docking、FEP 等)的原理和应用进行了介绍。在靶点 3D 结构已知的情况下,这些方法能够更详细地预测小分子配体和靶蛋白间的相互作用,从而对药物分子进行筛选和优化。然而,在实际的药物发现过程中,受限于靶点的特性和实验成本,靶点的 3D 结构信息并不总是可用的。因此,研究人员开发出了各种基于配体的药物设计方法,并发展为一类重要的药物设计工具。其中,最典型的代表既是定量构效关系( Quantitative Structure-Activity Relationship, QSAR )方法。

在本期培训中,我们将以基于配体分子性质预测与筛选:定量构效关系模型为主题,详细介绍定量构效关系( QSAR )方法的基本原理,以及 QSAR 方法中重要的理论基础 - 分子表示方法。随后会介绍分子表示方法的最新进展 - Uni-Mol 预训练模型,和基于 Uni-Mol 的 Uni-QSAR 工具。最后,通过实际案例展示 Uni-QSAR 在药物设计流程中的具体操作和注意事项。

希望通过这部分内容的介绍,大家能够掌握 QSAR 方法,并能在实际的研究工作中灵活应用,帮助研究人员更高效地对新化合物进行性质预测和筛选。

活动概况


培训主题:

基于配体的分子性质预测与筛选:定量构效关系模型

培训时间:

2024年11月30日(周六)9:00-11:00

培训形式:

腾讯会议

培训日程:

培训主讲:

宋珂,深势科技高级计算科学家。2012年毕业于山东大学化学与化工学院,获“理论与计算化学专业”博士学位,随后进入复旦大学化学系开展博士后研究工作。2016年加入上海科技大学-免疫化学研究所,在计算生物学平台和生物医学大数据平台工作。主要研究方向为:利用量子化学方法研究催化反应机理,利用分子动力学方法研究生物大分子的功能机理,以及药物分子的筛选和 MOA 研究。

参与方式

  1. 本次培训在线上进行,如您有意向报名本次培训,请扫描下方二维码或访问课程链接,点击“立即报名


课程链接:https://j1q.cn/CxpXVquD
  1. 课程报名成功后,将显示本次培训的微信群二维码,请大家扫码进入课程群,直播链接将在群内通知。如果二维码无法加入,请添加小助手微信( HermiteService ),小助手会手动拉你入群;
  2. 培训涉及到的账号将由小助手进行开通,如您遇到任何问题,可以添加下方课程小助手微信:

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