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沈晓峰
科学家的需求
科学家们每天都在处理大量分布在多台仪器和多个实验室中的数据。传统的数据管理方式,如使用移动硬盘进行数据复制,不仅繁琐且效率低下,从历史研究中检索数据更具挑战性。因此需要一种更简便、智能的方式来与同事、合作者和客户共享数据、方法和结果。同时,提高实验室生产力也始终是科研的首要问题,这需要更多的自动化、更快的处理速度以及更好的仪器利用率。充分利用历史数据,寻找预测模式,并从海量的研究中获得更深入的洞察也是越来越迫切的要求。Thermo Scientific Ardia平台正是基于满足这些需求而开发的。
在开发Ardia平台的过程中,我们关注了四个核心领域,并将这些理念贯穿到了软件的设计与应用之中:
协作:将人员、数据和仪器集中在一个平台上,鼓励数据和知识的共享。
生产力:通过自动化工作流程和加快处理速度,提高实验室生产力。
深度洞察:通过将数据集中管理、相互关联并进行标识,有助于进行深度挖掘以获得更多的见解。
安全:通过用户权限管理、审计追踪、结果版本控制以及内置的备份和归档功能,确保数据在一个安全的环境中得到管理。
连接应用程序
Ardia平台支持一系列集成的软件包,包括Chromeleon、Biopharma Finder、Proteome Discoverer和Compound Discoverer。
Chromeleon色谱数据系统可以在合规的前提下支持包括高分辨质谱在内的系统,通过与Ardia 结合进一步提升了MS数据处理的性能。
BioPharma Finder支持多种工作流程,包括完整质量分析、肽图分析、寡核苷酸分析、自上而下分析,通过Ardia 平台将来自Chromeleon和Xcalibur的数据集中到一个中心位置,促进协作和效率,并轻松生成全面和可定制的报告。
Proteome Discoverer与CHIMERIS合作,支持各种采集方法。在Ardia 平台的支持下,数据收集和搜索并行进行,提升了处理速度,显著节省了时间。
Compound Discoverer 主要用于小分子数据处理,提供了未知峰检测、交互式数据可视化和高级化合物注释工具,结合Ardia平台处理后速度显著提升。
赛默飞还致力于开放平台,允许与非Thermo科学软件应用程序进行有效连接。例如,Skyline通过Ardia API直接访问数据,不再需要手动下载或外部文件管理。对于其它第三方软件,则可以通过Ardia Sync 进行数据和结果的同步。
提升分析工作流的生产力
Ardia Core软件相当于Ardia的操作系统,处理诸如用户配置文件、数据管理、备份和归档等任务,确保科学家们可以在一个安全、受控的环境中进行数据和结果的共享。
Ardia Core的系列应用程序,例如Ardia Data Viewer、Ardia Instruments等,提供了特定功能。
无论是Chromeleon还是Xcalibur采集的数据都可以存储在Ardia服务器上。Ardia Data Viewer提供了直接访问服务器上数据的功能。用户无需下载软件,即可使用Web浏览器从进行访问,为任何拥有Ardia帐户和查看数据权限的人提供提供了灵活性和便利性。
Ardia Instruments应用程序界面中可显示任何由 Xcalibur 或 Chromeleon 控制的仪器,包括采集状态、当前样品进度、进样列表中的剩余样品以及预期的批次完成时间等信息。它还提供了一个可选的连接到服务中心的功能,使科学家们可以直接从软件中提出服务请求。通过内置的调度器,允许提前预约仪器的使用时间。
Ardia Data Insights提供了仪器的实时监控和管理,使得科学家们可以有效地获取整个实验室的仪器状态,充分利用实验室资产,优化实验室运营。
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结语
Thermo Scientific Ardia平台通过集成多种数据处理软件和工作流程,提高实验室生产力,支持全球协作,安全管理数据和仪器。它代表了科学数据管理和分析的新标准,旨在解锁数据的力量,最大化资产利用,自动化工作流程,并利用历史数据加速科学进展。
想象一下,这种连接性对您的实验室将会产生多么深远的影响——Ardia平台将帮助您更有效地使用仪器,轻松协作,快速获取结果并简化数据管理。
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