图1. Droplet Hi-C流程示意图
首先，研究者将Droplet Hi-C技术应用于小鼠大脑皮层样本，获得的单细胞三维基因组数据能有效区分多种细胞类型，展示了不同神经元和非神经元细胞类型中特异性的染色质高级结构。同时也探究了不同细胞类型差异性的染色质高级结构（A/B区室，拓扑关联域和染色质环）与染色质组蛋白修饰状态和基因表达之间的联系。研究者还发现染色质多重互作中心区域富集超级增强子和细胞类型特异性标记基因。
通过进一步改进，研究者开发出单细胞多组学测序法Paired Hi-C, 能够同时捕获单个细胞内的三维基因组结构和转录组，帮助研究人员探索染色质结构与基因表达之间的关系。
作者简介
该工作由加州大学圣地亚哥分校任兵教授领导完成。任兵教授课题组长期致力于揭示染色质结构与基因调控的关系。团队通过创新技术，为理解发育和疾病的基因调控机制做出了重要贡献。课题组博士后常蕾和谢旸为论文的共同第一作者。
《自然-生物技术》Nature Biotechnology
DOI: 10.1038/s41587-024-02447-1
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