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自然界的微生物由于种类不同，它们对营养的需求也有差别，因此在菌种分离、保藏以及工业发酵中，都要根据该菌株对营养需求的特点来配制相应的培养基。
在科研生产上按所用原料不同，又可分两类：应用肉汤、马铃薯汁等天然成分配制的，称为天然培养基；应用化学药品配成并标明成分的，称为合成培养基或综合培养基。含化学试剂的培养基，大多为合成培养基。由于液体培养基不便长期保留，现已有公司改制成粉末。培养基在受热、吸潮后，易被细菌污染或分解变质，因此保管时必须防潮、避光，置低温处保存。对一些需严格灭菌的培养基(如组织培养基)，较长时间的储存必须放在2~6℃的冰箱内。常见培养基有以下一些。
一
细菌培养基
二
放线菌培养基
三
真菌培养基
四
酵母培养基
1
基础培养基
YPD 或YEPD：Yeast Extract Peptone Dextrose Medium(1L)，又叫酵母浸出粉胨葡萄糖培养基，加入琼脂的又叫酵母膏胨葡萄糖（YPD）琼脂培养基
配方：1% Yeast Extract（酵母膏），2% Peptone（蛋白胨），2% Dextrose (glucose)葡萄糖，（若制固体培养基，加入2%琼脂粉）
配制方法：
1 溶解10gYeast Extract（酵母膏），20gPeptone（蛋白胨）于900ml水中，如制平板加入20g琼脂粉
2加入20g Dextrose (glucose)（葡萄糖）
3 高压 115 度 15min
注：葡萄糖，yeast extract ，peptone溶液混合后在高温下可能会发生化学反应，导致培养基成分变化，所以要分别灭菌后再混合。葡萄糖可以过滤除菌，也可以115℃ 15min灭菌，(葡萄糖溶液灭菌后加入)。
2
基本培养基
配方一：NaAc 10g， (NH)2SO4 5g， NaHPO4 0.05g， MgSO4-7H20 1g，维生素B 100ug，蒸馏水100mL，处理琼脂2g ，pH自然，121℃灭菌15min
配方二： 葡萄糖2%， KHPO4 0.0 1%， MgSO4 · 7H20 0.0 5%，(NH)2S04，0.05% ，处理琼脂2%。蒸馏水配制，pH 6。0，121℃灭菌15min
配方三： 葡萄糖10g， NaCl 0.0 1g， (NH )2SO4 1g，微量元素母液1mL， K2HPO4， 0.0 125g，维生素母液1mL， KI 0.0001g， MgSO4·7H20 0.05g， CaCl·2H20 0.0 1g，蒸馏水1000mL。 pH 5.5~6.0，115℃灭菌25min
微量元素母液: HPO4 1mL，ZnSO4·7H20 7mg，CuSO4-5H201mg， CaCl2-6H20 5mg，蒸馏水100mL。
维生素母液:烟碱酸40mg，肌醇200mg，泛酸20mg，对氨基苯甲酸20mg，核黄素20mg，维生素B， 40mg，生物素0.02mg，吡哆醇40mg，蒸馏水100mL。
3
YNB培养基
YNB培养基由以下A、B、C三种溶液组成:
A液，维生素混合液:维生素B， 1000mg，烟酸400mg，吡哆醇400mg，生物素20mg，泛酸钙2000mg，核黄素200mg，肌醇10000mg，对氨基苯甲酸200mg，无离子水1000mL
B液，微量元素液: HBO4 500mL，MnSO4 ·7H20 200mg，ZnSO4-7H2O 400mg， CuSO4-7H2O 40mg， FeCls • 6H20 100mg，Na2MnO3 200mg，无离子水1000mL。
C液，其它无机盐液:KI 0.0 1mg，CaCl2-2H20 0.0 1g，K2HPO4 0.015g，KH2PO4 0.085g，MgSO4·7H20 0.05g，NaCl 0.01g，无离子水1000ml。
配制方法:取A液1mL、B液1mL、C液10mL、无离子水1000mL，混合，调pH为6。5，即成。说明:①配制YNB时，先分别将已灭菌分装的A、B液各1mL与C液10mL，在无菌条件下混合，再将已灭菌的(NH4)2SO4按0.05%的量加人到无离子水中，混匀即可。
注：配制糖发酵培养基时，方法同上，只是按2%浓度加入不同的糖液。
五
食用菌菌种培养基
配方一：马铃薯-蔗糖-琼脂培养基
20%马铃薯煮汁1000 mL，蔗糖20 g，琼脂18 g。马铃薯洗净去皮后，切成小块。称取小块200 g，加水1000 mL，煮沸20min后，过滤。 在滤汁中补足水分到1000 mL，即成20%马铃薯煮汁。在汁中加入琼脂和蔗糖，煮沸，溶解后，补足水分，分装，灭菌，备用。pH要求不严，可以不测定。
配方二：综合马铃薯培养基
20%马铃薯煮汁1000 mL，磷酸二氢钾3g，硫酸镁1.5 g，葡萄糖20 g，维生素10 mg，1脂18g。先配制20%马铃薯煮汁，方法同上。在煮汁中加入上述各种组分，加热溶解后补足水分，调整pH到6，分装，灭菌，备用。该培养基用于培养和保存灵芝、平菇、香菇等食用菌菌种。
六
蓝藻培养基
BG-11培养基
母液1: NaNO3，300mg/mL，NaCO3，4mg/mL；
母液2: MgSO4·7H20 15mg/mL；
母液3: CaCl2·2H20；
母液4:柠檬酸(CA) 1.2mg/mL，FeCA 1.5mg/mL，Na2EDTA 0.08mg/mL；
母液5: KHPO4 ·3H20 8mg/mL:
母液6: HBO3 2.86mg/mL，MnCl-4H20 1.81mg/mL，ZnSO4·7H20 0.0222mg/mL ，NaMo04·2H20 0.03mg/mL，CusO4-5H20 0.079mg/mL，Co(NO3)2·6H20 0.0494mg/ml。
取母液1、2、3、4、5各5mL，取母液6 1mL，加蒸馏水至1000mL，调pH值为8。0.0 BG-11固体培养基含琼脂1%
