发表期刊：Microbiome 影响因子：15.5 发表时间：2023.10 样本类型：粪便+拭子
研究背景
伴侣动物与人类关系密切，有益于身心健康。然而，动物携带的抗生素耐药性及其对主人和环境的影响仍不清楚。文章通过宏基因组分析比较了猫、人类及其生活环境的抗生素抗性基因（ARG）谱，以确定猫和人类肠道中的核心ARG，并探讨猫通过环境对人类肠道中ARG的潜在影响。
实验设计思路
实验设计概述示意图
研究结果
1、猫和人肠道中ARG的比较
研究显示，猫和人的ARG谱存在显著差异，且猫的ARG多样性和丰度均高于人（图1B-E）。猫肠道中的核心ARG为四环素、氨基糖苷类和MLS抗性基因，人肠道中的核心ARG为四环素、MLS和多重耐药性基因(图1F-G）。猫主人和非猫主人的ARG丰度无显著差异，但猫主人的APH(2'')-Ⅱa和ACC(6')-Im的丰度高于非猫主人（图1H-I）。
图1 猫肠道与人类肠道抗性组的比较
2、猫存在向主人及生活环境传播耐药性的风险
研究显示，猫和人的肠道宏基因组数据中的细菌移动遗传元件（MGEs）组成存在显著差异，人肠道中的MGEs丰度显著高于猫（图2A-B）。人肠道中的VFs(Virulence factor，毒力因子）丰度也显著高于猫肠道。与病原菌移动相关的ARGs的丰度在猫主人和非猫主人间没有显著差异，但猫主人的肠道的抗性风险得分明显更高（图2C-H）。
3、ARG的宿主组成特征和水平转移风险
猫和人的肠道菌群组成差异显著，猫以放线菌门和厚壁菌门为主，人以厚壁菌门和拟杆菌门为主。猫肠道中的双歧杆菌的丰度较高，且可能会影响人类肠道的微生物组成，其中可能包括ARG宿主（图3A-B）。通过共线性分析发现猫和人在肠杆菌科有一个共同宿主，与多个ARG显著正相关（图3C-D）。
图4 猫肠道中 MAG 携带的 ARG 数量
研究结论
研究表明，猫可能通过塑造生活环境中的耐药组来影响人类肠道中某些ARG的组成，强调了伴侣动物环境健康的重要性。文章通过宏基因组测序比较了猫、人类及其生活环境中的ARG特征，探究了猫对人类肠道中ARG的潜在影响。少数ARG宿主可能通过气溶胶吸入进入人体，而与猫的直接接触是主要途径。这些ARGs随后通过水平基因转移在肠道中重新定位，形成主人的抗性。
图6 猫对人类肠道和生活环境形成的抗药性
参考文献
Yang Y,et al. Pet cats may shape the antibiotic resistome of their owner's gut and living environment. Microbiome. 2023.
凌波微课的讲师们，实战经验丰富，旨在通过在线微课程及线下交流，帮助科研学生及科研工作者们由简入繁，掌握科研思路及生信分析的实际操作。倾心打造的高通量测序数据分析平台——凌波微课·云平台（http://www.cloud.biomicroclass.com/CloudPlatform/home），无需命令行，零基础玩转数据分析。凌波微课，用心服务科研用户，打造专业教育品牌，助力科研提升。
关注我
发现更多精彩
关注凌波微课公众号，回复“入群”，即可加入凌波微课课下交流群，更多干货等你呦！
