实验设计
样本类型：从实验室颗粒污泥反应器中收集五个重复样品
测序方案及数据量：三代宏基因组测序26.7G HiFi data ，二代宏基因组35.3G Illumina data
图 测序方案及分析
主要研究结果
图1 cMAGs的系统发育位置和丰度
图2 30个cMAGs的氮(N)、铁(Fe)、氧(O)、碳(C)和硫(S)代谢途径的MEBS评分
图3 30个cMAG编码的辅因子和维生素代谢的完整KEGG模块
图4 30个cMAGs的氮代谢潜力
4.适应性进化：可移动元件（MGE）、水平基因转移（HGT）
为了深入了解anammox菌群落的适应性进化，进一步分析了cMAG中的MGE和HGT。
图5 cMAGs和参考基因组中鉴定的可移动遗传元件(MGEs)
图6 cMAG.29预测28个含tnpA的基因簇
图7 厌氧氨氧化菌群落HGT基因网络及功能
研究结论
本研究通过对anammox菌群落进行HIFI测序获得30个cMAG，并进行物种分类学注释和功能分析，重点关注与氮循环有关的功能。研究人员发现anammox细菌群落中存在着多样化的物种，它们具有不同的功能特性和代谢途径。研究人员还发现了MGE和HGT事件，这可能对anammox细菌的适应性进化起到重要作用。本研究为大家深入了解anammox细菌群落的生态角色和生物技术应用提供了重要的理论依据。
参考文献
New insights into functional divergence and adaptive evolution of uncultured bacteria in anammox community by complete genome-centric analysis.Science of the Total Environment,2024
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