近日,华中农业大学园艺林学学院宁国贵课题组在国际学术期刊The Plant Cell在线发表了题为Boosting transcriptional activities by employing repeated activation domains in transcription factors的研究论文,利用调控花青素合成的MYB转录因子,发现了一种通过串联重复天然转录因子ADs增强其转录激活活性的方法。
该研究以两个调控花青素生物合成的R2R3-MYB转录因子,来自拟南芥中的AtPAP1(Arabidopsis thaliana)和淫羊藿中的EsMYBA1(Epimedia sagittatum)为对象,发现过表达EsMYBA1拟南芥和烟草相比过表达AtPAP1拟南芥和烟草中合成积累更多的花青素,且EsMYBA1相比AtPAP1下游类黄酮合成关键基因的表达量更高,RNA-seq结果表明EsMYBA1相比AtPAP1对共同的下游基因具有更强的转录激活能力,说明同源基因之间转录激活强度存在显著差异。
图1 MYB转录因子调控花青素生物合成
从蛋白结构来看,R2R3-MYB转录因子一般由DBDs和ADs组成,这两个结构域对转录因子转录激活活性具有重要影响。作者以多种方式包括置换转录因子的DBDs和Ads、串联重复转录因子DBDs以及串联重复转录因子ADs,合成了一系列转录因子,通过遗传转化实验发现串联重复ADs能够促进烟草积累更高含量的花青素,且类黄酮合成相关基因的表达量显著提高,说明串联重复ADs能够提高转录因子的转录激活活性。同时,利用来自NAC、bHLH和EIL转录因子家族成员,进一步证明了合成TFs与天然TFs相比,其活性显著增强。这些发现加深了我们对TFs转录激活活性的理解,并表明通过串联重复天然TF中的ADs是一种广泛适用的能够提高TFs的激活能力的方法。
图2串联重复AtPAP1的 ADs合成转录因子的功能分析
综上所述,该研究提供了一种有效的方法,可以大大增加TFs的转录激活活性,对下游基因的不良影响最小。随着对重要TFs的持续挖掘,这种增强TFs活性的策略不仅为我们探索决定TF激活效力的机制提供了视角,而且对于加速基础研究、合成生物学、基因工程和基因治疗的进展也将变得越来越有价值。
华中农业大学园艺林学学院宁国贵教授为该论文的通讯作者,华中农业大学何超超博士(现为浙江省农科院博士后)、梁跃博士后(现为中国农业大学副教授)和陈润洲博士为该文共同第一作者,华中农业大学博士生李润慧,已毕业硕士研究生孙婷婷、杜星、倪晓梅,已毕业博士研究生申玉晓(现就职于河南农业大学),华中农业大学尚均忠副教授,华中农业大学何燕红副教授,华中农业大学包满珠教授,克莱姆森大学罗宏教授,云南省农科院王继华研究员,香港浸会大学廖攀教授,华中农业大学康春颖教授,康涅狄格大学袁耀武教授也参与了本研究工作。本研究得到了国家重点研发计划项目、国家自然科学基金和现代农业产业技术体系建设的支持。
Levine M and Tjian R. Transcription regulation and animal diversity. Nature. 2003:424(6945):147–151. https://doi.org/10.1038/nature01763. Erijman A, Kozlowski L, Sohrabi-Jahromi S, Fishburn J, Warfield L, Schreiber J, Noble WS, Söding J, and Hahn S. A High-throughput screen for transcription activation domains reveals their sequence features and permits prediction by deep learning. Mol Cell. 2020:78(5):890-902.e6. https://doi.org/10.1016/j.molcel.2020.04.020. Brodsky S, Jana T, and Barkai N. Order through disorder: The role of intrinsically disordered regions in transcription factor binding specificity. Curr Opin Struct Biol. 2021:71:110–115. https://doi.org/10.1016/j.sbi.2021.06.011. Walzer KA, Tandel J, Byerly JH, Daniels AM, Gullicksrud JA, Whelan EC, Carro SD, Krespan E, Beiting DP, and Striepen B. Transcriptional control of the Cryptosporidium life cycle. Nature. 2024:630(8015):174–180. https://doi.org/10.1038/s41586-024-07466-1. Wang J, Zhou L, Shi H, Chern M, Yu H, Yi H, He M, Yin J, Zhu X, Li Y, et al. A single transcription factor promotes both yield and immunity in rice. Science. 2018:361(6406):1026–1028. https://doi.org/10.1126/science.aat7675. Wei S, Li X, Lu Z, Zhang H, Ye X, Zhou Y, Li J, Yan Y, Pei H, Duan F, et al. A transcriptional regulator that boosts grain yields and shortens the growth duration of rice. Science. 2022:377(6604): eabi8455. https://doi.org/10.1126/science.abi8455.
论文链接:https://doi.org/10.1093/plcell/koae315
来源: BioArt植物
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