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樱桃是蔷薇科（Rosaceae）李属（Prunus）中极具经济价值的果树之一。据FAO统计，2022年全球樱桃的种植面积达454,664公顷，总产量为2,765,827吨，其中，中国是最大的樱桃消费国和进口国。自20世纪90年代末以来，樱桃的遗传研究取得了大量成果，特别是在果实重要经济性状的QTL定位和功能基因的鉴定方面。但是，受限于基因组信息量和遗传图谱分辨率的差异，已公布的樱桃遗传位点质量参差不齐，且参考基因组不统一的问题，给全面理解性状的遗传结构带来了挑战，限制了遗传信息的挖掘利用。2024年9月，Horticulture Research上线了（Advance Access）四川农业大学王小蓉教授课题组与法国国家农业食品与环境研究院（INRAE）Elisabeth Dirlewanger课题组联合完成的题为Genomes and integrative genomic insights into the genetic architecture of main agronomic traits in the edible cherries的综述论文。
该论文系统回顾了近30年樱桃主要性状遗传及功能基因研究进展，梳理了樱桃基因组信息、遗传图谱构建进展。通过系统整理和科学分析，筛选、甄别高可信度数量性状基因位点（QTLs）94个，全基因组关联分析（GWAS）位点111个，已验证其性状相关功能基因遗传位点48个，共计253个，覆盖30余个重要农艺性状。进一步将这些位点分类整合，并比对至欧洲甜樱桃组装质量较好的‘Tieton’V2基因组，构建了首张樱桃性状遗传结构图谱（图1）。该工作将为樱桃性状遗传位点高效利用、樱桃种间泛基因组图谱构建以及樱桃分子育种与遗传改良提供重要参考。
图1 樱桃性状遗传结构
四川农业大学园艺学院博士研究生刘针杉为论文第一作者，王小蓉教授和Elisabeth Dirlewanger研究员为共同通讯作者，四川农业大学园艺学院王燕博士和法国国家农业食品与环境研究院Anthony Bernard博士也参与了本研究工作。本研究依托樱桃资源四川省科技资源共享服务平台和四川省樱桃种质资源圃，得到了四川省国际科技创新合作项目（2024YFHZ0302）、四川省自然科学基金项目（2023NSFSC0158）和国家现代农业产业技术体系四川水果创新团队（SCCXTD-2024-4）的资助。
文章链接：
https://doi.org/10.1093/hr/uhae269
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