2024年9月，Forestry Research 在线发表了由深圳基因组所武志强研究员团队和中国林业科学研究院热带林业研究所徐大平团队的洪舟副研究员联合完成的题为Insights into Aquilaria Phylogenetics through Comparative Plastomic Resources 的研究论文。该研究为沉香属植物提供了丰富的质体基因组资源，为理解沉香属植物的进化模式以及物种间的系统发育关系提供了重要的科学依据。
本文通过对22个新的沉香属植物叶绿体基因组进行测序，并结合已发表的15个沉香叶绿体基因组，开展了系统的比较基因组学和系统发育分析。新测序的22个沉香属植物质体基因组的长度范围为174,804到175,046 bp，GC含量稳定在36.70%到36.71%之间。所有基因组均呈现出典型的四分体结构，且基因组结构和基因内容高度保守。通过基因组比较，研究识别出了多个高变区（Highly Variable Regions, HVRs），这些区域包括rps16、rpoC1 等，未来可作为沉香属植物的DNA条形码，用于物种鉴定。结合最大似然法（ML）和贝叶斯推断法（BI），研究构建了沉香属植物的系统发育树，揭示了5个主要进化分支。尤其是A. sinensis、A. crassna 等主要经济物种的系统发育关系得到进一步厘清。在所分析的蛋白质编码基因中，accD 基因显示出最高的Ka/Ks值（1.54），提示该基因可能在沉香属植物的进化过程中经历了正向选择，参与了适应性进化。
这些研究发现不仅增强了我们对沉香属植物进化的理解，还为其提供了潜在的分子标记，未来有助于进一步的种质资源保护和利用。
中国农业科学院深圳农业基因组研究所武志强研究员为本文的通讯作者。中国林业科学研究院热带林业研究所洪舟副研究员为本文共同通讯作者。本文的第一作者为深圳基因组所、中国林科院、澳洲莫道克大学联培博士生阚俊虎。基因组所博士生聂丽云及科研助理米增露为共同第一作者。该工作得到了广东省林业局科技项目、广东省珠江人才、深圳市科创委和农科院创新项目的支持。
根据团队工作需求，拟面向基因组学、功能基因组、遗传育种、进化生物学等方向招收博士后3-5名。欢迎感兴趣的朋友联系武志强研究员（wuzhiqiang@caas.cn）。
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