Forestry Res | 西南大学何宁佳教授团队构建了桑树基因组大小、染色体数目和倍性数据库

学术   三农   2024-09-12 10:30   江苏  

桑树作为一种具有重要经济价值的林木,在全球范围内分布广泛。桑树除了作为蚕的重要食物来源之外,其综合利用价值日益引起人们的重视。桑树种质资源具有高度多样性,但由于缺乏资源的基因组大小、染色体数目和倍性等众多关键的基础信息,这在一定程度上阻碍了桑树资源的深度开发与利用。


2024年8月,Forestry Research 在线发表了西南大学资源昆虫高效养殖与利用全国重点实验室何宁佳课题组撰写的题为MGCPdb, a collective resource for mulberry genome size, chromosome number, and ploidy 的研究论文。


该研究运用流式细胞术对323份桑树种质资源的基因组大小开展了测定,发现这些资源的基因组大小从0.36 Gb到3.08 Gb都有分布。同时,该研究通过染色体计数的方法验证了部分资源的染色体数目及倍性。为了给广大研究人员提供便利,并提升数据的利用率,该研究将所有数据进行整理汇总,构建了免费开放、用户友好、使用便捷和持续更新的桑树基因组大小、染色体数目和倍性数据库MGCPdb。这将为桑树资源遗传多样性研究提供宝贵的数据信息。


图1. 桑树种质资源的FCM分析及染色体核型分析


图2. MGCPdb数据库介绍


西南大学资源昆虫高效养殖与利用全国重点实验室马赑副教授和何宁佳教授为该论文通讯作者,研究生王虹虹刘京纯许枭飞为共同第一作者。本研究得到了国家自然科学基金和重庆市基础科学与前沿技术研究计划的资助。


西南大学桑树团队致力于桑树分子生物学及功能基因组的研究,主要包括桑树资源挖掘与染色体进化、桑树优质性状的分子机制和网络等调控研究。

原文链接

https://doi.org/10.48130/forres-0024-0024
forres-0024-0024.pdf
特邀作者:王虹虹
编辑:顾笑寅

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Forestry Research 是一本专注于林学领域的期刊,一本全新的国际化的、开放获取的、具有严格的编辑筛选和同行评审流程的期刊。主要发表与森林科学和多个相关领域的研究论文、方法、综述和观点;涵盖范围从分子到种群,再到生态系统。期刊主编由美国密歇根理工大学林业资源与环境学院卫海荣教授担任,北京林业大学钮世辉教授担任期刊执行主编。目前期刊已被Scopus、DOAJ、CABI等大型数据库收录。


期刊官网:

www.maxapress.com/forres

投稿网址:

mc03.manuscriptcentral.com/forres


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