哈喽大家好，馆长又来啦！
现如今随着经济发展与人们健康意识增强，国家高度重视且大力支持中医药发展，导致中医药热度持续火爆，利好消息频发！那么我们在这股浪潮中如何才能“既快又好”的拿下SCI呢？相信很多小伙伴都有这样的疑问，今天就由馆长来为大家揭秘吧~
说到SCI发文，无外乎两种：第一，开展大量实验，得出系统结论（又到年底冲KPI的关键时刻啦，这种方法显然不适合）；第二，联合生物信息学技术，再配以实验验证，干湿结合（这种实验条件限制少，发文快，适用范围广的方案，只要有想法，SCI必拿下！屏幕前的你是不是也有所心动了呢?）
今天馆长就为大家带来一篇网药+分子对接+湿实验的高分模版，毕竟咱们很多的国内团队有着丰富的中医药应用实践，再加上国家层面的大力支持，SCI高分肯定会有创新突破！让我们站在巨人的肩膀上，向SCI发起冲击~
这不，这篇由华北理工大学团队发表的研究论文就非常good，该研究以慢性肺部炎症和肺纤维化（PF）治疗为研究方向，通过结合网络药理学和实验验证的创新综合方法揭示白藜芦醇（Res）抗纤维化作用的新机制。该研究思路清晰，逻辑层层递进，且复现极为容易，各位宝子可直接借鉴！这网药+中医药的发文模式真是好处多多啊~
此外作为传承几千年的中医药应用，不仅比化学药物的副作用小，深受审稿人喜欢，还临床可挖掘资源丰富，样本及数据获取便利，只要你能与中医药“擦边”，借用此篇的网药+分子对接+湿实验的优质思路，拿下一区SCI还是稳稳滴~
PS：当然啦！巧思路+妙方法也并非取之不尽用之不竭，各位宝子如果对复现此类文章感兴趣，那就抓紧联系馆长，获取最新的热点思路，及免费适用生信服务器！心动的宝子快来找馆长吧，我们的专业团队定助您抢先别人一步拿下SCI！全天在线哦~
定制生信分析
云服务器租赁
加好友备注“99”领取试用
题目：基于网络药理学方法的白藜芦醇抗纤维化机制解码
杂志：Phytomedicine
影响因子：IF =6.7
发表时间：2024年9月28日
后台回复“666”获取原文献，编号241107
研究背景
吸入结晶二氧化硅（CS）经常导致慢性肺部炎症和肺纤维化（PF），这种疾病的有效治疗方法有限。白藜芦醇（Res）已在PF治疗中显示出潜力。然而其潜在机制仍未完全阐明。本研究旨在通过结合网络药理学和实验验证的创新综合方法揭示Res抗纤维化作用的新机制的首次全面尝试。
研究思路与数据来源
本研究采用网络药理学研究Res的整体药理机制，在药物-靶点-疾病之间构建一个复杂的网络，检查药物与其各自的治疗靶点之间的特定分子相互作用，阐明综合药理学作用机制，然后使用体内和体外研究验证预测的药理作用。
图1. 实验设计流程图
研究结果
1. 构建疾病-靶点-功能注释-信号通路网络
STRING数据库用于对Res治疗PF的216个潜在靶点进行可视化分析，构建PPI网络。该网络的P值富集为<1.0E-16，表明这些潜在目标之间具有高度的互连性和可信度。使用Cytoscape 3.9.1软件对网络节点程度进行拓扑分析，并使用CytoHubba进行关键基因鉴定的进一步分析显示，关键基因（包括AKT1、TNF等）对Res的潜在治疗效果具有重要意义。
图2. Res治疗PF潜在靶点的网络分析结果
2. PF处理中潜在Res靶标的GO/KEGG富集分析
使用GO和KEGG富集分析对Res治疗PF的216个潜在靶点进行分析。GO富集生成2902个GO术语。BP分析突出了重要的过程，例如对外源性刺激、氧化应激和化学应激的反应。CC分析表明膜外围和水泡腔是关键反应位点。MF分析表明 DNA 结合、转录因子结合和蛋白质磷酸酶结合与PF发生有关。KEGG富集分析产生了178个条目，其中前20个条目包括AMPK、IL-17、VEGF信号通路等。
3. 通过分子对接验证Res和治疗靶点之间的结合能力
Res和靶蛋白的结合载量由SwissDock网络服务器预测。采用Sybyl-X 2.0和Dockey软件分析Res的分子对接能力。Res和AMPK之间交互作用的总分和 pKi 的平均值和标准差分别为2.64±0.19和0.2±0.13。此外进行了酶活性测定，结果显示良好的酶活性（图3B），确定了120 μM的最佳ATP浓度。总之酶活性测试结果证实了AMPK和Res之间的相互作用。
图3. 基于TR-FRET的酶活性测试揭示了Res和AMPK之间的相互作用
4. Res对体内PF的影响
如图4B所示，与生理盐水对照组相比，CS暴露组表现出炎症浸润、肺间质水肿和炎性细胞结节的程度。与对照组相比，二氧化硅暴露组的炎症浸润评分显著升高。同时通过Masson染色显示，在CS暴露组小鼠的肺组织中观察到胶原蛋白沉积的显着增加。此外与盐水对照组相比，CS 组肺组织的整体纤维化面积明显增加（图4E）。此外进行免疫组化（IHC）染色检测胶原蛋白 I（Col-I），定量结果显示，CS暴露组的Col-I染色增加。
图4. 体内实验结果分析
5. Res对成纤维细胞转分化的影响
免疫荧光显示，对照组NIH3T3细胞中波形蛋白表现出低荧光信号，CS刺激后波形蛋白的荧光信号强度上调，而Res处理可降低波形蛋白的荧光信号强度。此外Western Blot分析显示，与对照组相比，CS处理组肌成纤维细胞转分化标志物的表达显著增加，而这些蛋白在CS+Res组中的表达降低。相反CC治疗适度逆转了 Res 对肌成纤维细胞转分化的抑制作用。总之，这些结果表明 Res 治疗可以抑制成纤维细胞向肌成纤维细胞转分化。
图5. 细胞实验验证结果分析
文章总结
本研究通过网络药理学分析确定了Res治疗CS诱导的PF的一套综合治疗靶点。揭示了Res的潜在治疗靶点，为使用Res治疗PF提供了理论基础。读完此篇是真的顺畅，清晰的思路加上优质的选题才是SCI成功的关键！宝子们如果手中也有相关的药物或者数据资源，不妨跟着馆长一起来试试复现此篇吧！犹豫就会败北，速速行动起来吧，馆长等你来哦~
馆长有话说
馆长会持续为大家带来最新生信思路，也可以提供特色数据库构建、免费思路评估、付费生信分析和方案设计以及实验项目实施等服务，对数据库构建和生信分析感兴趣的朋友可以咨询馆长哦！
生信分析
方案设计
服务器租赁
往期推荐
