如何看待Science Advances影响因子疯狂下跌?复旦大学硕士共一打的巨噬细胞+代谢重编程组合拳,化身科研界的变形金刚!

文摘   2024-11-10 19:00   上海  


Hey!朋友们,馆长继续准时来报道啦!

最近也是有为大家好好的搜罗好文章呀,今天为大家带来的是复旦大学团队在Science Advances上发表的一篇文章!

作为Science亲儿子,《Science Advances》出道即巅峰,从16年到17年,仅需1年,影响因子从0变为11.5,巅峰时期高达14.9(这也是其最接近Nature communications的一次),然而,近两年却连续下跌至11.7,几乎回到解放前。究竟是什么原因呢

网友A:“最近两年所有综合类期刊都下跌了,主要原因还是新冠疫情过去了,引用量巨大的新冠相关类文章少了。但这其实不是坏事,因为现在反应的影响因子才是学术界本来该有的面目”。

网友B:“science编辑少,流程慢是根本原因”。

网友C:“这种所谓影响因子就是反科学的东西,出版社赚钱的工具而已”。

大家觉得是什么原因呢?欢迎大家留言讨论~

 

OK,咋们言归正传,来看下这篇复旦大学基础医学院徐延勇联合吴慧娟课题组,在Science Advances上发表的题为“Atf3-mediated metabolic reprogramming in hepatic macrophage orchestrates metabolic dysfunction–associated steatohepatitis”的研究论文。博士研究生李睿、硕士研究生龚东旭为该论文共同第一作者。相信看完这篇文章,这本期刊的创新性和投稿难度在你心里也会有一个“度”~

徐延勇,复旦大学基础医学院青年研究员,分子医学教育部重点实验室PI,博导。研究领域为糖脂代谢网络调控,探究动脉粥样硬化、脂肪肝、糖尿病、肥胖等代谢性疾病糖脂代谢紊乱的分子机制,发现新颖的代谢性疾病的致病通路并转化临床干预研究。近年以主要作者在NAT METAB, Mol THER, HEPATOLOGY, DIABETES, ATVB等代谢领域顶级期刊发表多篇有影响力研究成果。

吴慧娟,复旦大学基础医学院教授、博导。研究领域为肾脏纤维化,探究局灶节段性肾小球硬化症、糖尿病肾病、急性肾损伤慢性化等慢性肾病肾小球硬化和间质纤维化的分子机制,发现肾脏纤维化发生发展的新机制并指导临床治疗及提供干预新靶点。近五年以主要作者在J AM SOC NEPHROL, KIDNEY INT等肾脏病领域顶级期刊发表多篇有影响力研究成果。

文章提示ATF3可能是潜在有效治疗NAFLD/NASH的药物靶点,也是首次系统的揭示了ATF3在NAFLD/NASH进程中保护作用及机制。将“巨噬细胞+代谢重编程”两大国自然热点结合,打了一套“组合拳”,完美实现1+1>2的效果!据不完全统计,近五年来,巨噬细胞和代谢重编程相关国自然中标项目数量呈“爆炸式”增长,2023年就有51项国自然中标项目,今天分享的这篇文章希望对各位医生的科研思路能提供一个新的见解!思维如灵动的火花四溅,却苦于不知如何有序开展?那就来戳戳馆长吧!馆长助你理清思路,顺利发文!

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题目:Atf3介导的肝巨噬细胞代谢重编程协调代谢功能障碍相关的脂肪性肝炎

发表时间:2024年7


研究背景

代谢功能障碍相关性脂肪性肝炎(Metabolic dysfunction–associated steatohepatitis,MASH)是一种以严重肝细胞脂肪变性、炎症和纤维化为特征的疾病,已成为肝硬化、肝移植和肝细胞癌的主要原因,受肝脏巨噬细胞和周围细胞之间复杂相互作用的调节,肝脏细胞葡萄糖-脂肪酸循环的破坏会促进MASH的进展。但由于肝脏细胞内糖脂代谢的异质性及复杂性,糖代谢和脂质代谢之间相互作用的潜在机制及其在MASH发病机制中的作用尚不完全清楚 

研究设计

研究主要结果

1.Atf3调节WD喂养小鼠中葡萄糖诱导的肝巨噬细胞中FAO的减少

使用C57BL/6J雄性小鼠,分别饲喂饲料(chow diet)24周或12周,然后改为西方饮食(Western diet, WD)再饲喂额外的12周或24周,从这些小鼠中分离肝巨噬细胞,并测定细胞内的葡萄糖水平和FAO。结果显示,在WD喂养的小鼠中,肝巨噬细胞的细胞葡萄糖水平显著升高,而FAO降低,Atf3的表达显著降低

通过构建Atf3fl/fl和Atf3M−/−小鼠,发现恢复Atf3水平可使Atf3M−/−巨噬细胞的高葡萄糖和低FAO水平正常化。此外,MASH患者肝脏巨噬细胞中Atf3表达较低,且与MASH评分和血浆葡萄糖水平呈负相关。

2.Atf3通过抑制葡萄糖介导的AMPKα失活和上调Cd36来增强脂肪酸利用率

从正常饮食喂养的Atf3fl/fl或Atf3M−/−小鼠中分离肝巨噬细胞,进行RNA-seq,结果显示Atf3能够显著上调或下调超过1000个基因的表达,其中包括与糖脂代谢相关的基因。测量肝巨噬细胞中的葡萄糖水平和Pck2活性,发现Atf3缺失增加了糖异生相关基因的表达和Pck2活性,提高了细胞葡萄糖水平,降低了FAO;Atf3过表达则降低了细胞葡萄糖水平并增加了FAO。

检测Atf3对AMPKα信号通路的影响,发现Atf3能够增加磷酸化AMPKα的水平,表明Atf3可能通过AMPKα信号通路来增强FAOCUT&Tag分析未发现Atf3直接结合到FAO相关基因的启动子区域,表明Atf3可能通过其他机制调节这些基因的表达

3.Atf3通过FoxO1和Cd36协调糖异生和脂肪酸摄取的调节

通过免疫共沉淀(Co-IP)实验检测Atf3与FoxO1在肝巨噬细胞中的相互作用,发现Atf3在肝巨噬细胞中与FoxO1物理相互作用,Western blot显示这种相互作用影响了FoxO1的乙酰化状态。

使用AS1842856(FoxO1活性抑制剂)和MS-275(Hdac1抑制剂)来研究Atf3通过FoxO1和Hdac1调节糖异生和FAO的机制,发现Atf3通过阻断Hdac1介导的FoxO1去乙酰化,特别是在K242、K245和K262位点,从而增加FoxO1的乙酰化水平,减少糖异生,降低细胞葡萄糖水平。

此外,Atf3还通过上调棕榈酰化相关酶(如Abhd17a、Zdhhc4和Zdhhc5),增加CD36的棕榈酰化,从而增强脂肪酸摄取和FAO。在四个关键棕榈酰化位点突变后,Atf3对CD36的调控作用消失。

4.肝脏巨噬细胞Atf3抑制肝细胞脂肪生成

将感染了慢病毒表达GFP(Lv-Gfp)或Atf3(Lv-Atf3)的肝巨噬细胞移植到C57BL/6J小鼠中,然后饲喂WD12周,从这些小鼠中分离出肝细胞,并分析其脂质水平。Atf3在肝巨噬细胞中的过表达能够降低共培养肝细胞中的TG水平和新合成的TG水平,同时降低与脂质合成相关的基因表达。

使用Atf3fl/fl或Atf3M−/−小鼠,饲喂西方饮食(WD)12周,然后分离肝细胞,分析发现Atf3在肝巨噬细胞中的缺失(Atf3M−/−)则导致肝细胞中的TG水平和新合成的TG水平显著增加,与脂质合成相关的基因表达上调。

5.肝巨噬细胞Atf3主要通过Rbp4抑制肝细胞脂肪生成和HSC活化

结果发现Atf3在肝巨噬细胞中的过表达能够降低肝细胞中的脂质合成相关基因表达,并抑制HSCs中的纤维化基因表达;Atf3在肝巨噬细胞中的缺失(Atf3M−/−)则导致肝细胞中的脂质合成相关基因表达上调,以及HSCs中的纤维化基因表达增加。此外,Atf3通过降低肝巨噬细胞中Rbp4的表达来抑制肝细胞的脂质合成和HSCs的激活,使用中和抗体阻断Rbp4的作用,可以防止Atf3缺失引起的肝细胞脂质合成和HSCs激活。

文章小结

该研究发现Atf3通过调节Rbp4的表达来影响肝细胞的脂质合成和HSCs的激活,这一轴的存在为MASH的治疗提供了新的潜在靶点。通过结合分子生物学、遗传学、细胞学、生化分析和动物模型等多种实验方法,全面地研究了Atf3在MASH中的作用,多模态的研究方法提高了研究的深度和广度。看完你有什么想法吗?灵光乍现,但没有下文?没关系,你来提供idea,我提供优质服务,主打就是一个满意!感兴趣的伙伴速速联系馆长吧!

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