IF 37.6!今年最佳“CP”奖我颁给孟德尔随机化和蛋白组学!MR+组学,卷对方向事半功倍!

文摘   2024-11-15 19:00   上海  


孟德尔随机化“卷”吗?

实话实说,确实卷!

怎样在如此内卷的领域占据一席之地呢?

联合分析是一个不错的选择!与组学联合可以发37+!信吗?

今天馆长就给大家带来一篇孟德尔随机化联合蛋白组学的研究,一起看看吧~

1.该研究探究了循环蛋白与心肌梗死风险之间的关系,而且特别关注了性别差异。

2.研究通过两个独立的队列(SIMPLER和UK Biobank)进行分析,增强了研究结果的可靠性和普适性。

3.使用高通量的多重免疫测定法同时测量了大量与心血管疾病或代谢相关的蛋白质。

4.作者还评估了这些蛋白质作为药物靶点的潜力。

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题目:血浆蛋白质组和心肌梗死:性别特异性差异

杂志:European Heart Journal

发表时间:2024.10    

后台回复“666”获取原文献,编号241115


研究背景

很少有基于人群的队列研究,包括男性和女性,探索与心肌梗死(MI)事件相关的循环蛋白。本研究使用基于队列和孟德尔随机化(MR)的分析调查了循环心脏代谢相关蛋白与心肌梗死风险之间的关系,并探讨了潜在的性别特异性差异。

研究结果

队列基础分析

SIMPLER参与者的基线特征见表1。在11751名参与者的队列中,402人在平均8.3年的随访期间首次诊断为心肌梗死。总共有215名女性和187名男性被诊断为首次MIs。

在发现样本(SIMPLER)中,在完全调整的模型中进行多次比较调整后,259种循环蛋白中有51种与心肌梗死发生风险相关。在这51种蛋白中,44种与多变量模型中UK Biobank重复样本中的心肌梗死相关。蛋白METRNL在UK Biobank中不可用,仅根据SIMPLER的数据纳入结果(图1)。    

在二次分析中,在SIMPLE的多变量分析中发现了41个具有统计学意义的蛋白质x性别相互作用项。其中12个在UK Biobank的多变量分析中重复;其中一种蛋白质MMP-2,在UKB的数据中是不可用的,因此没有被重复。    

在发现和复制样本的多变量分析中,所有13种蛋白都与女性心肌梗死相关(图2)。在SIMPLE中,只有GDF15与男性心肌梗死风险相关。在UK Biobank中,12种蛋白中有9种与男性心肌梗死相关;然而,与女性相比,男性的相关性要弱得多(图2)。    

MR分析

基于CARDIoGRAMplusC4D和FinnGen结局数据来源的荟萃分析显示,较高的遗传预测水平肾素(REN)、卵泡素(FS)和RARRES2与心肌梗死风险增加相关,这与基于队列的分析一致。相比之下,遗传预测的组织因子途径抑制剂(TFPI)水平、TNF-R2、胎盘生长因子(PGF)和TNF-R1与心肌梗死呈负相关。此外,基于FinnGen研究的分析发现,V-set和免疫球蛋白结构域蛋白2、VSIG2以及FAM3C与心肌梗死的风险呈负相关;然而,在两个队列的联合分析中,这些关联没有统计学意义(图3)。    

致药性评估

在meta分析中,与心肌梗死有潜在因果关系的7种蛋白中有6种,FinnGen中与心肌梗死相关的TNF-R1(图3)已成为药物开发的靶点。

文章小结

这篇文章通过多队列研究设计、大规模蛋白组学分析、孟德尔随机化以及药靶评估等方法,为理解心肌梗死的分子机制和性别差异提供了新的见解。馆长只能说一句,孟德尔随机化还是牛哇!想跳出常规,在孟德尔随机化方向做点新东西的小伙伴快来联系馆长吧!好思路不等人哦~

馆长有话说

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