关于WB,你不得不注意的小细节(一)

文摘   科学   2024-07-07 19:00   广东  



1. 关于样本制备

问题描述:

1)明明已经多算了上样量,可上样时发现样本还是不够?

2)同时提取的蛋白,为啥别人的没降解偏偏你的降解了?

3)同样的变性条件,你的样本却糊成一团团絮状物,吸不上来?

4)你有了解你的样本吗?

问题分析及解决方案:

1)蛋白样品变性结束请勿立即开盖,因为立即开盖随着蒸汽的蒸发会造成样品的损失,导致上样量不足。正确的操作是在冰上冷却片刻,离心后再开盖;

2)提取蛋白时整个流程一定要在冰上进行,维持低温环境以保证蛋白活性,与此同时,在提取蛋白时要加入一定量的蛋白酶抑制剂,防止蛋白降解;蛋白提取完成后,最好分装保存于-80℃,避免反复冻融(反复冻融极易产生冰晶,会破坏蛋白结构);

建议每次上样前即便是已经变性保存的蛋白也最好再次变性处理,以保证上样前蛋白完全线性化;

3)变性后样品凝结成团的因素颇多,如:蛋白浓度过高、Loading Buffer不够等等,此时可以适当的调整变性时间和温度,或者补充Loading Buffer,但若出现明显的蛋白和水分层的现象,蛋白凝固不可再用于WB;

4)样本的制备直接决定结果的好坏,所以最好充分了解自己的样本,是细胞还是组织?采用何种方式处理?

尤其要注意心肝脾肺肾等含血细胞较多的组织,一定要去除红细胞的影响(可以买专门的去红细胞试剂盒,也可以将组织按PBS:蛋白酶抑制剂=100:1的比例进行洗涤,重复多次,必要时也可辅以7500g,离心3-5min进行处理)。


2. 关于制胶与配液

问题描述:

1)总是漏胶怎么办?制完的胶短期内如何保存?

2)什么时候拔梳子?拔梳子总是造成加样孔碎裂或歪斜?

3)配制电泳液、转膜液、封闭液要注意什么?

4)电泳液、转膜液配制一次可重复使用吗?

问题分析及解决方案:

1)如若发现经常性漏胶,可以先注入纯水进行检漏,若不漏胶,弃去纯水,用吸水纸吸干水分即可开始制胶;制胶完毕后,可以将胶置于装有电泳液的密封袋里放于4℃冰箱保存;

2)制胶完毕后最好不要立马拔梳子,可以在电泳槽里组装完毕加入电泳液后再拔梳子,借助电泳液的润滑作用拔出梳子,否则在干燥的状态下有可能弄碎加样孔,与此同时也要注意用于保存胶的电泳液不可过多,仅仅起到保湿作用即可,过多会因为长时间的浸泡导致胶变脆,加样孔间的柱子失去支撑力,从而出现东倒西歪的现象;

3)准确称量与充分溶解是配液的关键所在,尤其是电泳液的配制,若配制不当引起电压电流的波动则很容易形成波浪状条带;电泳液、转膜液最好提前配制,并置于4℃冰箱预冷,尤其是转膜液,温度过高会造成条带变形;封闭液若采用脱脂奶粉,一定要充分溶解(可以涡旋混匀后再置于摇床上混匀),条带显影时大的黑色斑点通常是脱脂奶粉溶解不完全导致的,另外脱脂牛奶要以防长时间放置引起变质,倘若配制较早,最好放于4℃冰箱保存;

4)一般而言电泳液、转膜液可以重复使用,但也要视电压电流而定。尤其是转膜液,虽大部分人采用恒流转膜,但也要注意电压的变化,若二次使用电压比较低就要适当延长转膜时间或者重新配制转膜液,否则会造成蛋白转不上去,尤其是大分子蛋白;如若自己配制的电泳液也可使用1-2次,用成品的电泳缓冲液粉配制的电泳液性能稳定,重复使用2-3次完全没问题。




本文作者是"夏沫梦鸢"同学,在获得授权后实验老司机将本文发表于公众号。

文稿:夏沫梦鸢

校对:煲仔饭

参考资料:

  • https://images.app.goo.gl/3CTjk9hJ2r7fESkH8

  • https://images.app.goo.gl/EkGqRuKFnLYvdw3p8




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