Asiloglu R, et al. (2024). Trophic modulation of endophytes by rhizosphere protists. The ISME Journal, wrae235.
（2024年11月20日发表）
摘要参考翻译：植物与微生物之间的相互作用对植物的健康和生产力至关重要，这种相互作用主要发生在根际，即活植物根部周围的狭窄的土壤区域。根际是微生物捕食—被捕食相互作用最为活跃的生境之一，尤其是捕食性原生生物与细菌之间的关系。本研究基于两个关键事实：微生物捕食者调节根际细菌群落组成，而根际细菌群落是根微生物组（内生菌）的主要来源，我们假设捕食根际细菌会调节内生细菌群落的组成。研究中测试了3种分类学上截然不同的无菌培养原生生物（Acanthamoeba castellanii、Vermamoeba vermiformis 和 Heteromita globosa）的影响。为了验证假设的稳健性，实验在3种具有不同细菌群落和理化特性的土壤类型中进行。细菌群落组成通过高通量测序分析，细菌基因丰度则通过实时定量PCR方法估算。结果表明，原生生物能够调节来源于根际土壤的内生菌群落。然而，不同土壤类型下这种调节表现出混沌模式（chaotic patterns），而非确定性效应。进一步实验通过改变土壤养分稀释率引发混沌动态，验证了这一观察。此外，捕食者的存在增强了内生菌对根部的定殖能力。这些研究结果揭示了根部内生菌调节的关键机制，并深化了对地下植物—微生物相互作用的理解，为通过调控根微生物组提升作物产量提供了新的可能途径。
基于细菌类群绝对丰度的原生生物对根际土壤（RS）和根内共生（RE）细菌群落的营养调节
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