中兽医在养殖业中的疾病预防和诊治过程中，曾一度起到了举足轻重的作用，它不但弥补了西医在诊断上的局限性，更弥补了西药在治疗上的不足。中兽医本来就是有着几千年发展的中医的延伸，与现代医学是有着理论本质的不同，但又相互交融的两个医学领域。中兽医有着它自己的发展过程，也更有着它自身的科学价值。虽然中医的思维过程是一种模糊思维，与西医的直观思维相比，似乎有难以理解之处，但是，它最终还是以物质为基础，尊崇物质是生命本源的理论，其自身仍体现了一种独特的科学概念。
一.关于中医的科学性问题
现在医学界一直还存在着中医是否科学的争论，其中代表着西医的人士认为中医不科学，原因是中医不依生命指标为依据，完全凭借着肌体外部的四诊资料诊察，是一种伪科学。而中医认为，肌体内在的病理状况，是一定会在外部有所表现的，“有其内必有其外”就已经说的非常明白。中医虽然不会去分析某些指标，但这种整体观念就已经体现了生命科学的实质。因为，脏器指标的变化，也正是生命异常的体现。中医也特别强调肌体与自然的关系，认为大自然是所有生命体的存在环境，肌体只有通过不断地同步调节，才会迎合四季的变化，才会不至于自体与寒热相悖而发病。中医讲“天人合一”，这不但对人，对所有动物体也同样适宜。这是客观、也是物质的，因此也是科学的。
二.关于古代哲学问题
中医理论的中心思想，既是阐释了肌体阴阳盛衰及其转化问题，它统筹了金、木、水、火、土五行的变化规律，是以此象释彼行的取象类比法则。阴阳和五行是古代哲学的范畴，阴阳分别代表着两个对立的矛盾双方，是相制相成的两种不同表现形式。具体地说，从正反而言，正为阳，反为阴；从上下而言，上为阳下为阴；从内外而言，外为阳内为阴；从寒热而言，热为阳寒为阴。无正则无以为反，无上则无以为下等等，也就是说，无阳则无以为阴。五行的概念实际上就是对事物存在本质的概念，和阴阳一样，也是对万事万物的一种解释方式。而中医理论运用阴阳五行的概念，其实也就是一种对肌体生理病理的解释方式而已，是类比，包括五行配五脏等等。这恰恰证明了中医拥有着自己的发展道路，并也会沿着这条道路继续发展下去。
三.关于疾病诊疗问题
中医在对疾病的诊疗上，更有着自己独特的理论，强调肌体阴阳的平衡为疾病与否。也就是说，是以肌体状态或功能的改变来判断疾病的发生。由于某种原因的影响，肌体的阴阳平衡往往会被打破而紊乱，因此，即会出现或寒、或热的病理反应。而在此症候变化的初始阶段，肌体的生理指标很可能仍处于一个相对正常的状态。比如体温并未升高但已有热状、微生物的检查并未发现感染但已有周身的不良反应以及精神状态的差异。。。。。等等这些都会被中医四诊捕捉得到，从而证明肌体疾病的存在。对此，有一个事例就非常具有说明力，此事例是某省级电视台的“中医养生”栏目列举的。说的是有一位老人，由于夏季贪凉，吃了刚刚从冰箱取出的西瓜，之后便一直腹泻。因此便到医院去做西医检查。但查了几次都未查出原因。老人的腹泻也一直未愈，最后却导致了一个悲观的结果——引发肺炎而亡。这是什么原因？可能对于中医来说是一件憾事——一件本来并不算太大问题的憾事！由此也可以看出，许多疾病的发生与发展，在最初阶段的第一时间内，中医有着独到的诊察优势。
四.关于药物理论问题
中药是中医理论指导下的产物或工具，遣药组方是中医诊疗的最后程序。那么对于中药来说，它更离不开中医理论的指导而随意应用。中药以植物类居多，每一味药物都含有多种有机成分，其中更含有代表本身性质的“性”和“味”，而中医运用中药恰恰是充分利用它的“性”和“味”，来对疾病性质的反向抑制和调节，从而达到治疗目的。当然，一般而言，中药的内在成分也决定着它的“性”和“味”，但也由于中药的成分复杂，其中性味相同的两种不同药物，其成分可以不同；而性味有别的两种药物，其成分也可能存在某种相同。因此，中药成分也从来不作为中医用药的原则。也因此，几千年来中医也一直在据其性味来组方遣药。
五.关于中兽医发展问题
曾经看到过许多研究或者探讨，认为中医的发展应该向西医的理论靠拢。认为中医的诊病应该符合解剖学的概念，中医的治疗应该倾向于病原感染的研究，中药的运用也应该究其成分而发展。其实，中医本来就有自己的解剖学理论，只是与西医的解剖学有实质与功能的不同罢了。中医的五脏理论区别于西医，认为心、肝、脾、肺、肾共属于五脏系统，每一个脏系既是一种单独的功能系统，但又相互之间有着密切的联系。因此，中医便以五行配属五脏。肝——木，心——火，脾——土，肺——金，肾——水。而且，相互之间也存在生克关系，是一种功能的、动态的解剖理论。中医在疾病治疗上有外感和内伤之分，外感即六淫致病，内伤既是多种原因导致的脏腑阴阳平衡的紊乱。中医所指的六淫致病在疾病的某个阶段，其实与西医也是相一致的。比如鸡的支原体感染，其症状为咳嗽、流鼻液等，这与中医所讲的风寒表证就非常相近。再比如，新城疫的体温升高和脏器的出血，这又与中医辨证中的气、血分热盛相吻合。这些也都证明了中医、西医虽然理论不同，但共有相同的指向和治疗目的。
再谈一下中药。关于中药的成分问题前面已有说明，虽然当前对中药的发展认识各异，但到目前为止，还没有一例是按成分遣药组方的，也并没有一例能够脱离开中医理论而去用药的。这就好比空运和陆运，彼此也只能在自己的线路之内自我完善，但却是根本不能相互牢笼的。当然，中兽医需要发展，也更需要深入地去研究，但也只能紧紧地依附于它的理论去就其优、抑其弊。比如剂型的改革、应用的方便化等，完全不可以中医西医论，中药西医化。
