生命科学技术论坛︱活细胞定量超分辨率成像:十年历程(陈良怡,教授,北京大学)

学术   2024-10-09 00:01   上海  

【神经科学前沿技术培训系列】详见文末


责编︱生命科学研究前沿技术论坛组委会


导言

Bio-protocol逻辑神经科学将在金秋季节隆重推出线上生命科学研究前沿技术论坛系列,专注于生命科学技术的最新进展,重点探讨前沿技术、方法和工具的实际应用。论坛将邀请国内外杰出的科学家和技术专家,与广大研究人员共同分享、学习,并深入讨论如何将这些新技术和工具更好地应用于各个研究领域。


本系列论坛将涵盖多个专题。首场成像专题(第1期)将于北京时间2024101020:00-21:00正式开启


我们非常荣幸邀请到陈良怡教授(北京大学)担任首场成像专题(第1期)主讲嘉宾,并由席鹏教授(北京大学)李博研究员(复旦大学)冯倩倩高级工程师(清华大学)作为互动嘉宾共同参与本次网络研讨会。



专题亮点




1. 创结构照明显微技术,实现活细胞长达一小时的超分辨率(SR)成像。

2. 利用双模式显微镜技术,全面成像细胞器及分子相互作用。

3. 创新两步迭代去卷积算法,突破活细胞SR成像的分辨率极限,成功捕捉核孔动态变化。

4. 开发背景去除新技术,实现活细胞SR成像的定量分析与大分子结构精准研究。



摘要




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Here we present an overview of our recent works in live-cell superresolution (SR) microscopy. Over the past ten years, we have developed several innovative techniques to improve the resolution and accuracy of live-cell imaging.


Our first breakthrough was the development of a structured illumination microscopy technique based on the continuity of biological structures embedded in Hessian matrices (Hessian-SIM). Hessian-SIM significantly reduces the photon dosage required for SR microscopy while suppressing reconstruction artifacts induced by random noise. Additionally, we demonstrated that the high sensitivity of this method allows for the use of sub-millisecond excitation pulses followed by dark recovery times, reducing photobleaching and enabling hour-long time-lapse SR imaging with common fluorescent probes in live cells (Nat. Biotechnol. 2018).


To enable holistic SR imaging, we developed a dual-mode microscopy technique that combines SIM with label-free three-dimensional optical diffraction tomography (ODT). By providing a holistic view of organelles and simultaneously highlighting molecules, this method is ideal for studying organelle interactomes. We demonstrated that the ODT module can resolve mitochondria, lipid droplets, the nuclear membrane, chromosomes, the tubular endoplasmic reticulum, and lysosomes (Light Sci Appl. 2020).


To further push the resolution limit of live-cell SR imaging, we developed a two-step iterative deconvolution algorithm based on continuity and sparsity of fluorescence signals (Sparse deconvolution), which extends resolutions beyond the physical limits of optical systems. Sparse-SIM achieving ~60 nm resolution at a 564 Hz frame rate, resolving dynamics of ring-shaped nuclear pores over an hour in live cells. The algorithm can also be used to improve resolutions of other fluorescence microscopes, such as confocal, STED, and lightsheet microscopes. Thus this mathematical path to improve microscopic resolution may have broad implications (Nat. Biotechnol. 2022).


Finally, for live-cell SR imaging to be quantitative, the completeness of delicate structures and the linearity of fluorescence signals are required in addition to resolution. To make live-cell SIM microscopy more quantitative, we proposed a physical model-based background removal method (BF-SIM). BF-SIM preserves intricate and weak structures down to sub-70 nm resolution while maintaining signal linearity, enabling us to discover novel, dynamic actin structures in live cells (Nat. Commun. 2023).




报名方式




扫描上方二维码或点击阅读原文即可报名,首场成像专题(第1期)将于北京时间2024101020:00-21:00正式开启。同时您可按照提示提前向专家们提出您的问题,他们将选择一些共通的疑问在研讨会直播时为您解答。欢迎大家积极提问!



主讲嘉宾




陈良怡 北京大学 教授


陈良怡,北京大学博雅特聘、长聘教授,新基石研究员。北京大学国家生物医学成像科学中心副主任,获得国家自然科学基金委杰出青年基金等资助,是科技部重点研发专项、基金委重大研究计划集成项目的首席科学家。为了在不同的时空尺度研究糖尿病相关的胰岛素分泌调控,发明一系列的高时空分辨率生物医学成像的可视化手段,包括高分辨率微型化双光子显微镜,海森结构光超分辨显微镜,活细胞双模态超分辨率显微镜,发明基于新数学原理的稀疏解卷积超分辨率成像算法,实现活细胞成像中分辨率最高(60nm)、速度最快(564Hz)、成像时间最长(>1小时),也能够实现跨尺度多模态超分辨提升。工作获得“20212023年度中国光学领域十大社会影响力事件(Light10等奖励,并两次入选国家十三五科技创新成就展;商品化超分辨率显微镜和微型化双光子销往国内顶级科研机构,解决高端显微镜的卡脖子问题,2022年销售过亿元,完成从基础理论创新-新技术方法-生物医学应用-商业转化-推动领域前进从而产生社会价值的闭环。



互动嘉宾

(按拼音顺序排列)




冯倩倩  清华大学  高级工程师


冯倩倩,清华大学生物医学测试中心副主任、共享仪器平台技术主管。毕业于首都师范大学细胞生物学专业,自2012年开始在清华大学从事光学影像技术和细胞功能研发,在共聚焦显微成像和高级应用、光片显微成像及大数据处理、超高分辨技术及样品制备和流式细胞分析实验设计、流式细胞分选质量控制等方面有着丰富的实战经验;近年来组织和参与多次大型仪器设备理论技术讲座和实用上机培训,在技术人才培养和公共平台建设方面卓有成效。

李博 复旦大学 研究员


李博,复旦大学脑科学转化研究院研究员、博导。主要科研方向是高速深层多光子显微镜技术的开发,进一步利用新技术手段开展鼠脑的神经环路和功能研究。主持国家优秀青年科学基金、上海市求索杰出青年、青年东方学者等项目,获得美国光学学会和相干公司颁发的2020 Bernard J. Couillaud Prize,迄今在Nature Methods等期刊发表第一/通讯论文20余篇,在国际学术会议作受邀或主题报告十余次和网上公开课多次,担任《Frontiers of Optoelectronics》、《Journal of Innovative Optical Health Sciences》和《中国激光》等杂志青年编委。


席鹏 北京大学 教授


席鹏,北京大学未来技术学院博雅特聘教授,国际先进材料学会会士,国家杰出青年科学基金获得者,科技部重点研发计划首席科学家。主要从事超分辨显微成像技术的研究。现担任LightAdvanced Photonics等五份SCI收录国际学术期刊的编委。在Nature, Nature Methods等国际一流期刊发表SCI收录期刊论文100余篇,总影响因子大于850,被引超过6000次。2016年获得中国光学重要成果奖。2022年获得广东省自然科学二等奖(排名第二)。已授权美国专利3项,中国专利19项,编辑专著2部。


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EVIDENT

Evident,我们以科学精神引领——创新和探索是我们工作的核心。我们致力于让人们的生活更健康、更安全、更充实。我们为客户提供解决他们所面临的挑战及工作中的解决方案;从研究医学突破、检测基础设施,到航空航天,电子半导体中的隐藏隐患,都会有我们的参与。


Evident生命科学领域解决方案,致力于应对各种挑战并满足客户不断变化的需求,致力于推进全面的临床研究、教育和优质显微镜及显微镜系统的开发及应用。



论坛主办机构




Bio-protocol

Bio-protocol 2011年在斯坦福大学创建,旨在提高科研的可重复性,以助力科学发现。它与eLifeScience/AAAS等国际知名出版机构合作,致力于提升实验方案的透明度和共享。Bio-protocol Bio-protocol 旗下一份同行评审的国际学术期刊,专注于发表高质量的生命科学实验方案。至今,已发表来自全球两万多名科研工作者的5000多篇文章。该期刊已被PubMed CentralWeb of Science 等国际权威数据库收录。

逻辑神经科学

逻辑神经科学:聚焦神经科学领域,深度报道最新研究进展,启发学术逻辑思维;以最严谨的学术逻辑思维,探索神经科学之奥秘。有国内外神经科学领域忠实读者6.4万多,每月平均阅读量50万以上;长期开展特邀主题学术报告系列一作面对面系列讲座神经科学前沿技术培训系列启迪者神经前沿论坛系列生命科学研究前沿技术论坛系列等;欢迎投稿撰稿、商务合作、加入我们。联系方式:Wang_Sizhen(微信)

     
编辑︱王思珍
本文完


逻辑神经科学
以逻辑之学术思维,探索神经科学奥秘;汇百家争鸣,促求真明理。
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