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主要
内容
- 分子动力学模拟的基本概念介绍
- 分子动力学模拟的程序设定
- 分子动力学模拟的结果分析
往期回看
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第一讲 | Discovery Studio加速先导化合物发现与优化的全面工具
• 小分子数据库的预处理
• 分子对接的具体应用
• 药效团模型的构建与应用
• 基于片段的药物设计方法
• 分子动力学模拟
• Discovery Studio案例介绍和软件演示
第二讲 | Discovery Studio分子模拟前的数据准备实操演示
• 配体过滤：类药性规则、可合成性、Pains过滤...
• 配体准备：构象生成、离子化、异构化
• 蛋白准备：晶体结构的选择、结合位点的定义
第三讲 | Discovery Studio基于分子对接的计算模拟方法与应用
• 基于Libdock的数据库虚拟筛选与结果分析
• 基于CDOCKER的精准分子对接与结果分析
第四讲 | Discovery Studio药效团模型的构建与应用
• 基于配体结构的药效团模型构建
• 基于受体-配体相互作用模型的药效团模型的构建
• 基于药效团模型的虚拟筛选与分子结构优化策略
第五讲 | Discovery Studio基于片段的药物设计方法
• 片段库构建方法介绍
• 基于MCSS与De Novo Receptor的片段对接程序的应用与操作
• 基于骨架跃迁的先导化合物优化应用与操作
-end-
