Sci Hortic| 东北农业大学王傲雪课题组在番茄抗冷方面取得新进展

乐活   2024-11-01 09:00   河南  
近日,Scientia Horticulturae在线发表了东北农业大学王傲雪课题组题为Genome-wide identification and expression analysis of the GT8 gene family in tomato(Solanum lycopersicum) and the functional of SlGolS1 under cold stress的研究论文。



论文链接

https://doi.org/10.1016/j.scienta.2024.113686

研究背景

随着全球气候变化的加剧,低温胁迫对植物生长发育和农作物产量的影响日益显著。冷胁迫会导致植物细胞膜流动性降低、活性氧(ROS)积累等一系列生理反应,进而损伤植物的生理功能。番茄(Solanum lycopersicum L.)作为世界上重要的蔬菜作物,其耐冷性研究对提高作物产量和保障食品安全具有重要意义。糖基转移酶8GT8)基因家族在植物细胞壁合成及对非生物胁迫的响应中发挥关键作用,然而其在番茄耐冷机制中的功能尚未被充分揭示。本研究通过全基因组分析和冷胁迫条件下的转录组数据,揭示了GT8基因家族成员SlGolS1在番茄耐冷反应中的作用。

研究结果

1.SlGT8基因家族的系统发育和染色体定位分析 
通过对番茄全基因组GT8基因家族进行鉴定,研究发现番茄中有40GT8基因,主要分为GAUTGATLGolSPGSIP四个亚家族(图1a)。这些基因不均匀分布在11条染色体上(图1b),其中GAUT亚家族在12346791012号染色体上广泛分布,而GolSPGSIP基因则较少,主要分布在14511号染色体。


1 SlGT8基因家族系统发育分析及SlGT8基因的染色体定位


2.SlGT8基因家族的共线性分析
通过共线性分析,发现14SlGT8基因家族成员表现出基因重复事件(图2a)。此外,与拟南芥、水稻、马铃薯等物种的同源性分析表明,SlGT8基因在物种间的同源性不同,尤其是在马铃薯和番茄之间,共有33SlGT8基因呈现出57对共线性关系(图2b),这表明这些基因可能在进化过程中被保留下来,对番茄的耐冷性产生重要影响。


2 GT8基因家族的共线性分析


3.冷胁迫条件下SlGT8基因家族成员的qRT-PCR分析 
4℃冷胁迫下,研究对40SlGT8基因的表达模式进行了qRT-PCR分析(图3)。结果显示,大部分基因在胁迫后6 h内发生显著变化,尤其是SlGolS1基因在12 h时的表达量达到峰值,是0 h25倍,并在24 h48 h内持续保持较高表达水平。



3 40SlGT8基因在冷胁迫下的qRT-PCR分析


  1. 4.SlGolS1的组织表达和亚细胞定位
  2. 通过组织表达分析发现,SlGolS1在番茄的茎和花中表达量最高,其次是叶和果实,根中的表达量最低(图4a)。进一步的亚细胞定位实验显示,SlGolS1蛋白主要定位于叶绿体中(图4b),这与其在冷胁迫下响应光合作用和ROS代谢的功能密切相关。

4 SlGolS1基因的组织特异性表达及亚细胞定位


5.冷胁迫下SlGolS1基因沉默植株的表型及ROS积累 
5展示了通过VIGS技术沉默SlGolS1基因后,番茄植株在冷胁迫下的表现。沉默后的pTRV2-SlGolS1植株比对照组pTRV2显示出更明显的萎蔫现象(图5 a),表明SlGolS1在提高番茄耐冷性方面的重要性。沉默效率在74.3%85%之间(图5 b),证明沉默成功。此外,DABNBT染色检测显示pTRV2-SlGolS1植株中活性氧(H2O2O2-)的积累显著高于对照组(图5 d),进一步支持了SlGolS1在抵御冷胁迫时的关键作用。



5 pTRV2-SlGolS1植株的沉默效率、冷胁迫下的表型及活性氧检测


6.冷胁迫下抗氧化酶活性检测 
在冷胁迫24 h后,pTRV2-SlGolS1植株中SODCATPPOAAO的酶活性显著低于对照组(图6),进一步表明该基因沉默降低了番茄的抗氧化能力,削弱了其对冷胁迫的抵抗性。


6 pTRV2-SlGolS1和对照植株在冷胁迫下生理指标的测定


7.SlGolS1CBF冷抵抗途径中的作用 
CBF基因在冷胁迫下是植物耐冷途径的核心调控因子。在本研究中,pTRV2-SlGolS1植株中CBF1CBF2CBF3的表达水平显著低于对照组(图7),说明SlGolS1可能通过调控CBF途径增强番茄的耐冷性。

7 pTRV2-SlGolS1pTRV2植株在冷胁迫下SlCBF1SlCBF2SlCBF3的相对表达水平


8.结论 
本研究通过全基因组分析鉴定了番茄中的40GT8基因,并揭示了SlGolS1在冷胁迫下的正向调控作用。SlGolS1在叶绿体中的定位、其在冷胁迫下对ROS代谢的调控以及对CBF途径的调节,均表明其在增强番茄耐冷性中起重要作用。本研究为进一步探索SlGT8基因家族的生物学功能奠定了基础。
东北农业大学园艺分子生物技术团队完成了此项工作,王傲雪教授,陈秀玲副研究员为论文的共同通讯作者,在读博士张慧欣和莫福磊为论文共同第一作者,该项目得到了国家自然科学基金项目(U22A20495, 32072588)的资助以及泰山产业领军人才项目专项资金

团队或作者(第一或者[和]通讯作者)简介

团队负责人:王傲雪,教授,博士生导师。国家高层次人才入选者;黑龙江省头雁团队带头人;黑龙江省政府特殊津贴获得者;主持国家重点研发计划、国家自然科学基金等20余项科研项目,获得包括国家科学技术进步奖、教育部科学技术进步奖、农业部中华农业科技奖、黑龙江省省长特别奖等22个奖项,获得授权发明专利19项,新品种保护权3项,农业农村部生物肥料证书3个。出版专著及教材10部,发表论文170余篇,其中SCI收录70余篇。
团队研究方向:番茄智能育种、抗逆抗病基因挖掘及防御引发机制研究。





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About Scientia Horticulturae
Scientia Horticulturae属农林科学Top期刊,由Elsevier出版社出版,发表果树、蔬菜、观赏植物和食用菌生产等与园艺有关(栽培、育种、生物化学、组织培养、营养学、植物生理学、植物病理学等)的原创论文,综述和短讯等。CiteScore:8.6 ,期刊影响因子:3.9。2023年中科院期刊分区,中科院大类:农林科学2区,Top期刊;中科院小类:园艺2区。JCR分区:Q1  (6/115 Horticulture)。


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