IF=5.2 专题征稿|揭示免疫代谢:单细胞和空间转录组学阐明疾病动态

文化   2024-09-19 11:00   黑龙江  


单细胞和空间转录组学与先进的代谢分析工具相结合,提供了前所未有的见解,揭示了驱动疾病进程的细胞机制,特别是在免疫相关疾病的背景下。这些技术在解开免疫细胞与疾病环境之间复杂的相互作用中变得至关重要,提供了关于细胞行为和相互作用的详细视图,达到了单细胞水平。这在免疫细胞在疾病进展和治疗反应中发挥关键作用的情况下尤为重要。

尽管取得了进展,但我们对免疫细胞如何在动态疾病环境中调整其代谢过程的理解仍存在很大差距。诸如单细胞通量估计分析(scFEA)、代谢成本模型(Mebocost)和单细胞代谢(scMetabolism)等工具已经开始应对这些挑战。这些技术使研究人员能够剖析免疫细胞的代谢活动,揭示这些细胞内的代谢重编程如何支持或抑制疾病进程。

然而,这些技术在探索免疫细胞功能代谢基础方面的应用仍在逐步发展。这些条件的特点是复杂的代谢重编程,支持疾病的持续存在和对治疗的抵抗,需要复杂的分析来捕捉免疫细胞代谢的静态状态及其随着时间的推移和对治疗的反应的演变。

本研究主题旨在通过应用尖端的单细胞和空间转录组学工具,以及像scFEA、Mebocost和scMetabolism这样的代谢分析技术,填补这些空白。我们的目标是全面绘制控制各种免疫相关疾病中免疫细胞功能的代谢通路。我们邀请研究者探讨免疫细胞在疾病进展中如何改变其代谢通路,这些代谢转变如何影响疾病结果,以及代谢干预如何可能改变这些疾病的进程。

通过聚焦于广泛的免疫相关疾病,这个研究集合希望发现新的代谢靶点用于治疗,并加深我们对决定免疫细胞功能和疾病进展的组织特异性代谢相互作用的理解。

该主题旨在通过应用这些复杂的方法,调查疾病微环境中免疫细胞的动态代谢变化,从而弥合现有的技术差距。这涉及不仅捕捉静态快照,还包括在疾病发展和对治疗反应过程中代谢状态的时间演变。

通过绘制免疫细胞在特定疾病中发生的代谢改变,本研究旨在确定新的代谢靶点用于治疗干预。这些靶点可能被利用来开发能够调节免疫细胞功能并改善疾病的治疗方法。

该研究主题集中于将单细胞和空间转录组学与先进的代谢分析工具相结合,以探索各种免疫相关疾病中免疫细胞的代谢动态。其目的是全面理解免疫细胞内的代谢重编程如何影响疾病进展和治疗反应。我们期待收到关于该主题的原创研究文章、综述、小型综述、观点和方法学方面的投稿。

具体的子主题包括:

综合代谢分析:使用scFEA、Mebocost和scMetabolism对免疫细胞代谢进行详细分析。
疾病特异性代谢见解:研究各种免疫相关疾病中的代谢途径差异。
治疗影响:探索潜在的代谢靶点用于创新治疗策略。

期刊介绍



1Frontiers in Endocrinology IF=3.9 中科院二区 JCR Q2
2Frontiers in Immunology IF=5.2 中科院二区 JCR Q1

编辑介绍



谭烨钧:
谭烨钧是香港理工大学健康科技及资讯学系博士生,同时也是美国大学优等生荣誉学会(Phi Beta Kappa Society)和科学研究荣誉协会(Sigma Xi Scientific Research Honor Society)的杰出成员。他以最高荣誉毕业于明尼苏达大学双城分校,获得数学学士学位,主修数学生物学和基因组学方向。目前,他的主要研究兴趣集中在单细胞和空间转录组学结合影像组学在神经精神疾病(如阿尔茨海默病和抑郁症)及自身免疫疾病(如SLE)中的应用与算法开发。他已发表超过20篇SCI论文,其中7篇为第一作者或通讯作者,并有两篇刊登于影响因子超过10的顶级期刊(h指数为7)。此外,他在亚太风湿病学会议(APLAR2024)上汇报了主要研究成果,并担任三个JCR Q1期刊的副主编和客座副主编。谭烨钧曾在美国国家科学院院士Ruth-G. Shaw的指导下研究定量遗传学,并在多家著名机构担任研究助理和生物信息学专家,包括香港大学李嘉诚医学院儿科与青少年医学系、明尼苏达大学神经科学研究所及共济会癌症中心、浙江大学附属儿童医院及中南大学湘雅二医院湖南省自身免疫性疾病临床研究中心。他擅长多组学分析(单细胞转录组学、代谢组学、微生物组学)、遗传数据分析(GWAS、post-GWAS、WGS),以及机器学习和深度学习在多组学研究中的应用。

刘征涛:
浙江大学第一附属医院郑树森院士课题组副研究员,专注于边缘性供肝的临床应用风险评估和机制探索、代谢性因素对慢性肝病及肝细胞癌的影响,以及多组学联合分析技术在慢性肝病及肝移植研究中的应用。他曾在浙江大学卫生部多器官联合移植研究重点实验室(2014-2016)和瑞典皇家理工学院的Science for Life Laboratory(2016-2018)从事博士后研究工作。期间参与了瑞典国家研究委员会(VR)项目、中国国家重点基础研究发展计划(973计划)项目以及国家科技部重大专项。此外,他主持了包括国家自然科学基金、浙江省自然科学基金、中国临床肿瘤学会(CSCO)拜耳肿瘤研究基金在内的十余个科研项目,获得了中国博士后科学基金国际交流计划、中国科协优秀中外青年交流计划以及树兰基金器官移植青年人才海外研修支持计划的支持。迄今为止,他以第一作者或通讯作者身份发表了20余篇SCI论文,其中8篇为一区论文,同时还以共同作者身份参与了《Science》等顶级期刊的发表。

朱亚锋:
中山大学“百人计划”引进人才,广东省优粤人才B类。瑞典卡罗林斯卡医学院博士,美国哈佛医学院博士后,2020年8月全职回国。研究方向为肿瘤蛋白质组学,研究内容包括:1)非编码区序列翻译产物鉴定和功能研究;2)单细胞-空间蛋白质组学技术解析肿瘤异质性及抗药机制;3)化学蛋白质学解析药物作用机制。研究成果发表于Nature Communications, Nucleic Acids Research等国际知名期刊,共计发表SCI论文15篇,,高引指数(H-index)11, 他引共计900余次。

投稿链接:
https://www.frontiersin.org/research-topics/66566/unraveling-immune-metabolism-single-cell-spatial-transcriptomics-illuminate-disease-dynamics



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