JIA专题 Special Issue
近期，中国农业科学院棉花研究所联合河南科技学院和石河子农业科学研究院合作完成的题为“Identification of candidate genes for early-maturity traits by combining BSA-seq and QTL mapping in upland cotton (Gossypium hirsutum L.)” 的研究在Journal of Integrative Agriculture (《农业科学学报》(英文)，JIA) 2024年10期正式发表。
该研究以早熟棉品种中棉所50和晚熟棉品种国欣棉11为亲本分别在2020年和2021年构建得到两个F2分离群体，用于BSA-seq和QTL定位。基于2020年的F2分离群体表型数据，构建了极端混池进行BSA-seq测序，分析发现早熟相关性状的候选区间位于D03染色体上。为进一步缩小候选区间，利用22个多态性InDel标记在2020年和2021年群体中分别检测到位于两个候选区域内（InDel_G286-InDel_G144和InDel_G24-InDel_G43）的5个和4个早熟性状相关QTL位点。两个候选区间内，三个基因（GH_D03G0451、GH_D03GO649和GH_D03G1180）的外显子在两个亲本中存在非同义突变，一个基因（GH_D03G0450）的上游序列在两个亲本中存在SNP变异。上述四个基因在花器官中均具有较高的表达。在花芽分化阶段，GH_D03G0451、GH_D03GO649和GH_D03G1180在中棉所50中的表达量显著高于国欣棉11，而GH_D03G0450则表现出相反的趋势。对GH_D03G0451的进一步功能验证显示沉默GH_D03GO451的植株表现出开花延迟。
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Liang Ma, Tingli Hu, Meng Kang, Xiaokang Fu, Pengyun Chen, Fei Wei, Hongliang Jian, Xiaoyan Lü, Meng Zhang, Yonglin Yang. 2024. Identification of candidate genes for early-maturity traits by combining BSA-seq and QTL mapping in upland cotton (Gossypium hirsutum L.). Journal of Integrative Agriculture, 23(10): 3472-3486.
研究团队简介
中国农业科学院棉花研究所棉花早熟遗传改良团队长期开展早熟棉花育种研究工作，在早熟棉品种培育、早熟相关基因的挖掘及调控机制等研究上拥有良好的积累和沉淀。该团队培育了众多适合我国不同棉区种植的早熟棉新品种，拥有收集于不同时期、不同区域的早熟棉种质资源150余份，并且完成了西北内陆和黄河流域两个生态点的农艺性状鉴定，为以后早熟棉品种选育和遗传机制研究提供了丰富的资源材料。该团队先后承担了国家重点研发计划、国家自然科学基金等国家级项目 10 余项；发表学术论文 100余篇，在早熟棉花品种培育和遗传机制研究领域取得了重要成果。
| 图文由中国农业科学院棉花研究所棉花早熟遗传改良团队提供
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