偷偷问一下,关注了吗?
之前我们复现了一篇文章的GSEA图((更新)复现Cell子刊图表:GSEA多组结果可视化函数)。小伙伴对这篇文章中的另一副中也比较感兴趣,如下。主要是气泡图展示了marker基因的表达。反正CNS的图看着就挺香的。所以复现一下。
(reference:Distinctive multicellular immunosuppressive hubs confer different intervention strategies for left- and right-sided colon cancers)
这个图其实就是基因气泡图展示,做法也是比较简单的。有两种实现方式,第一种自然是用ggplot2作图了,各种修饰即可。第二种是直接在seurat中DotPlot函数下添加修饰完成。为了简单,我们选择了第二种方式进行实现。需要完成的内容有。第一:分面图及其修饰。第二:气泡设置。第三:legend修饰。第四:tags设置。然后就完美实现了,不需要AI修饰!
原图中所有效果都已实现,是所有效果!我们复现的图:
关于基因展示图我们之前做过很多哦,回顾一下,那些你可能错过的精彩:
点击:ggplot作图实现线条注释-气泡图展示单细胞cluster与celltype注释
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