glmm.hp包是我们前年开发的R包,基于我们2022年在MEE文章中提出来“平均共享方差”理论,将普通多元回归(lm)、广义线性模型(glm)、混合效应模型(lmm)和广义混合效应模型(glmm)中总R2,分配给具有共线性的解释变量,从而解决了评估共线性解释变量相对重要性的难题。目前,此程序包已经被广泛应用于科学研究数据分析当中。“赖老师,为什么您那篇对glmm.hp零膨胀拓展的文章里针对glmm模型案例的代码,即第一个代码。我原封不动地放到R里跑只能跑出m1,也就是生成广义线性混合零膨胀模型是没有问题的,没有后面括号里的(m2<-glmm.hp(m1),这个代码是跑不出来的,报错是没有“site”这个predictor”我立马检查代码,发现是5月份为了解决带NA的问题,结果对于lm和glm分析只保留模型使用的列进行分析。结果忘了考虑到glmmTMB的随机效应的事情。现在已经修改这个bug并在CRAN上更新包。欢迎大家及时更新包。近期,hier.part包由于没更新,在R3.5之后就不能使用了,欢迎大家使用glmm.hp来代替hier.part包,而且glmm.hp能分解原始R2和校正R2,这是比hier.part, relaimpo和 dominanceanalysis等包更优势的地方,这些包仅仅分解原始R2。 另外,使用glmm.hp请别忘了引用如下两篇文献:1.Jiangshan Lai*, Yi Zou, Shuang Zhang, Xiaoguang Zhang, LingfengMao.2022. glmm.hp: an R package for computing individual effect of predictors in generalized linear mixed models. Journal of Plant Ecology 15(6):1302-1307
2.Jiangshan Lai*, Weijie Zhu, Dongfang Cui, LingfengMao. 2023. Extension of the glmm.hp Package to Zero-Inflated Generalized Linear Mixed Models and Multiple Regression 16(6):doi:10.1093/jpe/rtad038
正如下面引用就是正确的范例: