glmm.hp包5月14更新,解决一个带NA原始数据的bug,请大家及时更新并使用

文摘   2024-05-15 22:56   北京  
glmm.hp包是我们前年开发的R包,基于我们2022年在MEE文章中提出来“平均共享方差”理论,将普通多元回归(lm)、广义线性模型(glm)、混合效应模型(lmm)和广义混合效应模型(glmm)中总R2,分配给具有共线性的解释变量,从而解决了评估共线性解释变量相对重要性的难题。目前,此程序包已经被广泛应用于科学研究数据分析当中。
5月14日,西交利物浦大学的邹怡博士给我发了信息说,同样的数据(数据中带有空值NA),用glmm.hp和hier.part分解lm模型,得到的结果不一样。后来经过我仔细排查后,原因是原始数据没有被用于模型构造的变量如果带NA,glmm.hp原先设计会将这些带有NA的先行剔除,这么设计是因为glmm.hp是直接从模型对象提取原始数据,而不是跟hier.part一样直接输入所需的数据列,所以glmm.hp就没考虑非应用列带有NA的情况。通过一番修改后,解决这个bug, 也及时更新包,欢迎大家及时更新包。
近期,hier.part包由于没更新,在R3.5之后就不能使用了,欢迎大家使用glmm.hp来代替hier.part包,而且glmm.hp能分解原始R2和校正R2,这是比hier.part, relaimpo和 dominanceanalysis等包更优势的地方,这些包仅仅分解原始R2 
另外,使用glmm.hp请别忘了引用如下两篇文献:

1.Jiangshan Lai*, Yi Zou, Shuang Zhang, Xiaoguang Zhang, LingfengMao.2022. glmm.hp: an R package for computing individual effect of predictors in generalized linear mixed models. Journal of Plant Ecology 15(6):1302-1307

2.Jiangshan Lai*, Weijie Zhu, Dongfang Cui, LingfengMao. 2023. Extension of the glmm.hp Package to Zero-Inflated Generalized Linear Mixed Models and Multiple Regression 16(6):doi:10.1093/jpe/rtad038

数量生态学与R语言
多元统计、一元统计、R程序包开发及R语言应用的推广。
 最新文章