中国科学院西北高原生物研究所的动物生态与资源保护团队，在青海海北的研究站进行了夏季植被、土壤及高原鼠兔密度的综合调查。他们构建了维管植物的系统发育树，并利用广义可加模型(GAM)和结构方程模型(SEM)深入分析了高原鼠兔的干扰强度与土壤环境因子如何影响植物群落的系统发育结构和物种竞争。研究发现，高原鼠兔作为“异源工程师”，并未强烈地作为“生境过滤器”，而是促进了多物种共存的植物群落稳态。其干扰改变了植物群落的优势度，提升了物种周转率，降低了种间竞争，并促进了系统发育结构的分散和物种共存。
此外，即使在土壤条件相近的环境中，小型食草动物如高原鼠兔的活动仍能显著影响土壤因子对植物系统发育结构的作用。团队采用GAM模型，并结合gam.hp包中的“平均共享方差”理论，对模型的解释力进行了分解，明确了土壤湿度、温度、有机碳、总氮和总磷等因子在系统发育结构中的重要影响。这一清晰的变量解释比例排序为后续的结构方程模型构建提供了有力支持。
图1. 高寒草甸植物群落系统发育树
图2. 高原鼠兔干扰对植物群落β多样性的影响
图3. 使用gam.hp包分解土壤因子对植物群落系统发育结构的影响
图4. 高原鼠兔干扰协同土壤因子影响植物群落物种竞争
相关研究成果以“青藏高原高寒草甸植物系统发育结构对高原鼠兔干扰的响应”为题，近期在国际期刊Land Degradation & Development上发表。该研究由2023级硕士研究生陈欣扬和李婧共同担任第一作者，曲家鹏研究员为通讯作者。本研究得到了第二次青藏高原综合科学考察研究、国家自然科学基金及青海省重点研发转化计划等项目的资助。
论文链接：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/ldr.5356
使用gam.hp请引用如下文献：
Jiangshan Lai, Jing Tang, TingyuanLi, AiyingZhang, Lingfeng Mao. 2024. Evaluating the relative importance of predictors in Generalized Additive Models using the gam.hp R package. Plant Diversity. 46:542-546
也同时欢迎使用glmm.hp和rdacca.hp:
