张德林,殷平│高效酶法合成警报素分子

文摘   三农   2022-10-06 15:17   湖北  
技术与方法
植物和细菌处于营养胁迫时,会产生一种由核苷酸代谢产物(pp)pGpp诱导的严谨反应,即氨基酸饥饿时发生蛋白合成及相关基因表达停滞的反应。信使分子(pp)pGpp,也被称为警报素分子,是细菌和植物生存所必需的。信使分子(pp)pGpp主要分为3种:鸟苷五磷酸(pppGppG5P)、鸟苷四磷酸(ppGppG4P)和鸟苷三磷酸(pGppG3P)。
(pp)pGpp作为常用的信号传递分子,对许多病原菌(例如大肠杆菌、沙门氏菌、金黄色葡萄球菌)的黏附、侵入、免疫逃避、传播、生物膜形成和慢性感染起着重要作用。鞭毛是大多数细菌黏附宿主细胞的关键。(pp)pGpp能够通过抑制病原体鞭毛基因的表达,从而影响病原体入侵。由于信使分子(pp)pGpp对细菌和病原体的毒性、致病性的特殊作用,使其可能成为一种潜在的新型的抗菌药物。在细菌中,主要由3种信使分子合成酶(RelA、GppA、YvcI)负责催化合成(pp)pGpp。
尽管(p)ppGpp被发现已有近50年的历史,但是(p)ppGpp的代谢和信号传递过程仍是关注的重点。近年来,蓝细菌中的(p)ppGpp代谢机制逐渐被人们发现,可能与现有的代谢调控有所差异。由于蓝细菌是具有叶绿体的放氧光合性细菌,其类似的RSH活性调控机制为日益严重的蓝藻水华治理提供了可能。现有的研究中,(pp)pGpp主要来源于植物和细菌的内源提取以及酶生物合成,具有操作复杂、成本高昂、使用有毒试剂的弊端,无法满足快速获得大量的(pp)pGpp的需求。

图1   蛋白质科学团队合影(居中为殷平教授)

华中农业大学蛋白质科学研究团队张德林、殷平和陈传玉等人,以现有的体外酶合成(pp)pGpp的方法为基础,建立和优化了新的体外合成技术。结果显示,通过(pp)pGpp合成酶RelA、GppA和YvcI在25 mmol/L Tris-HCl pH 9.0、15 mmol/L MgCl2、100 mmol/L NaCl下37 ℃反应30 min,经阴离子交换进一步纯化,即可获得高纯度(pp)pGpp分子。与传统方法相比,本研究建立的体外合成方法,具有以下优势:一是方法简单,不需要特殊的有毒试剂;二是原料简单,常用的 ATP、GTP 即可参与反应,可大量获取目标分子;三是无需任何冰上或者 4 ℃操作;四是反应时间大大缩短。利用该技术可以快速、大量、绿色、经济地合成这些信号分子,为相关科学研究开展和基于此类分子的工业应用打下了坚实基础。

图2   3种信使分子酶合成示意图

该研究成果以《酶法体外高效制备信号分子(pp)pGpp》为题,发表在《华中农业大学学报》2022年第4期,本文获得国家自然科学基金面上项目(31770878)的资助。

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文章引用

陈传玉,谭樊杰,殷平,等.酶法体外高效制备信号分子(pp)pGpp[J].华中农业大学学报,2022,41(4):271-278 

DOI:10.13300/j.cnki.hnlkxb.2022.04.033

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